Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9IJD0

Protein Details
Accession W9IJD0    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-170EVIKITGKSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTIKKQSSKAASKDHydrophilic
176-201DNDDDKQKKVKPTKPRKKTGTMSSHFHydrophilic
318-342MAPDKSPTKKAPKKKKPRTITELATHydrophilic
380-408KNAKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPKPVLLSHydrophilic
667-694ATPPATTSSPKKPRGRPRKNSINAPEPQHydrophilic
697-722PPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-169KSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTIKKQSSKAASK
181-194KQKKVKPTKPRKKT
322-335KSPTKKAPKKKKPR
382-403AKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPK
676-748PKKPRGRPRKNSINAPEPQEPPPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSIPGAASPSKPKSAAKPQRVVASPRRKKA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MVSSNAFGTSPLGDTRRQPLHVNSSSPDLPSLRDVLTTKTTSQPSAHSGSGAAALSIDGPSGFISARQLYPAPESAPKVVSTPSTGLPWTLSHPGEVTGLAEDVSGNGGFIAGDNEPPKEREEHIEVIKITGKSTRKPRQQKVSNQAAPKRTAKPKPTIKKQSSKAASKDHSPAEDNDDDKQKKVKPTKPRKKTGTMSSHFPPPKESKDLEKAKQIDVNEPLHLEQAPARRLDWTPPAQKTIVDLDSDSSVFKNLGSSEADQRLPVFKNLVDGYSCMEGPNESISHSITNASDEDSSFLKKRKRIELLATMGTDAPAMAPDKSPTKKAPKKKKPRTITELATAAYRVPSQPDTEPPNASILDHFSTTNKEAGSLADEQTKNAKGKSTSRRKPSKAPKKKVPPKPVLLSPSAALAQVANQDFVFGTSSQLAREESPTVLRDLQAALRQSDQNHDMDFAMPLNSDAIESPQQRSNLWDAAARDAEGDLFDVEVINLADDTGLSEVGHVSNPFGYQLGADDSVICVESRVLDDHIPPAKPRNDIPSLDEKDLVDSRASSPYFSDSELSTSTNVHRPPLAQTEVSQANQMTTAEEPESLPELPAQPPRPNYEAFTDIRLAREIKRFGFKPIKRRSAMIALLDQCWQSKTRMGQASLHTSTKLSSPTKTTRATPPATTSSPKKPRGRPRKNSINAPEPQEPPPSAQPPETPKRPRGRPRKDSLSSIPGAASPSKPKSAAKPQRVVASPRRKKATAKSVIEIPDSEDNESDEFASSPDTNAEQMFSSPPPLDMSLTTNDGTPLTATQSDQEALLFDHITNAVTSAPRTTNPQEPSWHEKILIYDPIVLEDLAAWLNTGELSRVGYDGEVNPNDVKKWCESKSICCLWRISLRGKERKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.31
3 0.36
4 0.38
5 0.41
6 0.44
7 0.52
8 0.54
9 0.54
10 0.48
11 0.49
12 0.47
13 0.43
14 0.39
15 0.3
16 0.27
17 0.26
18 0.27
19 0.2
20 0.23
21 0.23
22 0.25
23 0.3
24 0.31
25 0.31
26 0.35
27 0.37
28 0.36
29 0.37
30 0.36
31 0.35
32 0.37
33 0.35
34 0.28
35 0.26
36 0.24
37 0.25
38 0.2
39 0.15
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.11
52 0.14
53 0.15
54 0.17
55 0.18
56 0.19
57 0.23
58 0.25
59 0.24
60 0.26
61 0.28
62 0.29
63 0.29
64 0.28
65 0.26
66 0.25
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.21
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.23
78 0.22
79 0.2
80 0.2
81 0.21
82 0.2
83 0.19
84 0.15
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.08
99 0.06
100 0.1
101 0.11
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.19
106 0.2
107 0.22
108 0.26
109 0.3
110 0.34
111 0.35
112 0.4
113 0.37
114 0.36
115 0.4
116 0.33
117 0.28
118 0.29
119 0.3
120 0.32
121 0.43
122 0.51
123 0.56
124 0.67
125 0.76
126 0.8
127 0.86
128 0.89
129 0.88
130 0.89
131 0.86
132 0.83
133 0.81
134 0.75
135 0.71
136 0.67
137 0.66
138 0.64
139 0.67
140 0.65
141 0.68
142 0.74
143 0.78
144 0.83
145 0.85
146 0.85
147 0.86
148 0.85
149 0.86
150 0.84
151 0.81
152 0.76
153 0.75
154 0.69
155 0.64
156 0.64
157 0.57
158 0.51
159 0.45
160 0.41
161 0.38
162 0.39
163 0.35
164 0.33
165 0.39
166 0.37
167 0.36
168 0.41
169 0.39
170 0.45
171 0.54
172 0.57
173 0.59
174 0.7
175 0.79
176 0.83
177 0.88
178 0.86
179 0.86
180 0.86
181 0.85
182 0.85
183 0.77
184 0.73
185 0.65
186 0.67
187 0.6
188 0.52
189 0.48
190 0.43
191 0.45
192 0.45
193 0.44
194 0.43
195 0.5
196 0.58
197 0.55
198 0.58
199 0.55
200 0.51
201 0.52
202 0.46
203 0.41
204 0.38
205 0.37
206 0.29
207 0.27
208 0.25
209 0.23
210 0.21
211 0.16
212 0.15
213 0.19
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.26
220 0.3
221 0.32
222 0.37
223 0.39
224 0.42
225 0.39
226 0.39
227 0.37
228 0.34
229 0.28
230 0.21
231 0.19
232 0.16
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.1
243 0.12
244 0.14
245 0.19
246 0.22
247 0.22
248 0.21
249 0.21
250 0.24
251 0.23
252 0.22
253 0.18
254 0.15
255 0.19
256 0.19
257 0.2
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.15
285 0.2
286 0.24
287 0.28
288 0.34
289 0.41
290 0.47
291 0.49
292 0.53
293 0.56
294 0.55
295 0.54
296 0.48
297 0.39
298 0.32
299 0.27
300 0.2
301 0.12
302 0.07
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.08
308 0.15
309 0.17
310 0.21
311 0.26
312 0.36
313 0.44
314 0.54
315 0.64
316 0.69
317 0.79
318 0.86
319 0.9
320 0.89
321 0.9
322 0.88
323 0.84
324 0.77
325 0.7
326 0.61
327 0.51
328 0.42
329 0.32
330 0.24
331 0.17
332 0.13
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.12
337 0.13
338 0.18
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.24
343 0.25
344 0.22
345 0.21
346 0.17
347 0.14
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.13
353 0.14
354 0.16
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.14
360 0.12
361 0.12
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.2
366 0.23
367 0.21
368 0.2
369 0.22
370 0.19
371 0.28
372 0.38
373 0.46
374 0.5
375 0.59
376 0.68
377 0.69
378 0.77
379 0.79
380 0.8
381 0.8
382 0.82
383 0.82
384 0.84
385 0.9
386 0.9
387 0.89
388 0.85
389 0.8
390 0.76
391 0.7
392 0.63
393 0.54
394 0.45
395 0.35
396 0.28
397 0.22
398 0.17
399 0.12
400 0.08
401 0.07
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.12
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.11
429 0.12
430 0.12
431 0.12
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.16
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.1
453 0.11
454 0.13
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.19
459 0.2
460 0.17
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.16
465 0.17
466 0.14
467 0.12
468 0.1
469 0.09
470 0.07
471 0.07
472 0.04
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.07
508 0.06
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.09
517 0.14
518 0.17
519 0.17
520 0.17
521 0.22
522 0.24
523 0.26
524 0.27
525 0.29
526 0.3
527 0.3
528 0.34
529 0.38
530 0.38
531 0.37
532 0.37
533 0.3
534 0.29
535 0.28
536 0.25
537 0.15
538 0.12
539 0.13
540 0.17
541 0.17
542 0.14
543 0.14
544 0.16
545 0.16
546 0.16
547 0.16
548 0.11
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.11
553 0.12
554 0.13
555 0.17
556 0.17
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.2
561 0.24
562 0.24
563 0.2
564 0.2
565 0.24
566 0.26
567 0.26
568 0.23
569 0.18
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.11
574 0.08
575 0.09
576 0.08
577 0.09
578 0.08
579 0.09
580 0.11
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.11
585 0.13
586 0.19
587 0.22
588 0.24
589 0.26
590 0.31
591 0.33
592 0.32
593 0.32
594 0.3
595 0.31
596 0.28
597 0.28
598 0.26
599 0.24
600 0.24
601 0.23
602 0.21
603 0.21
604 0.27
605 0.27
606 0.27
607 0.33
608 0.33
609 0.39
610 0.48
611 0.48
612 0.53
613 0.6
614 0.66
615 0.6
616 0.61
617 0.58
618 0.55
619 0.53
620 0.45
621 0.41
622 0.33
623 0.33
624 0.32
625 0.28
626 0.21
627 0.19
628 0.17
629 0.13
630 0.16
631 0.18
632 0.25
633 0.31
634 0.32
635 0.36
636 0.39
637 0.45
638 0.44
639 0.42
640 0.34
641 0.29
642 0.27
643 0.24
644 0.27
645 0.21
646 0.2
647 0.26
648 0.32
649 0.38
650 0.4
651 0.41
652 0.44
653 0.49
654 0.5
655 0.46
656 0.45
657 0.44
658 0.45
659 0.46
660 0.43
661 0.46
662 0.52
663 0.59
664 0.63
665 0.67
666 0.75
667 0.82
668 0.87
669 0.87
670 0.88
671 0.9
672 0.88
673 0.89
674 0.85
675 0.82
676 0.75
677 0.72
678 0.67
679 0.59
680 0.54
681 0.49
682 0.42
683 0.37
684 0.4
685 0.37
686 0.33
687 0.32
688 0.35
689 0.39
690 0.47
691 0.52
692 0.53
693 0.57
694 0.65
695 0.73
696 0.78
697 0.81
698 0.83
699 0.84
700 0.87
701 0.88
702 0.83
703 0.8
704 0.76
705 0.72
706 0.62
707 0.53
708 0.44
709 0.34
710 0.31
711 0.26
712 0.22
713 0.22
714 0.25
715 0.27
716 0.29
717 0.3
718 0.37
719 0.46
720 0.54
721 0.56
722 0.6
723 0.61
724 0.66
725 0.68
726 0.67
727 0.66
728 0.67
729 0.66
730 0.67
731 0.7
732 0.65
733 0.68
734 0.71
735 0.71
736 0.7
737 0.67
738 0.62
739 0.62
740 0.61
741 0.56
742 0.46
743 0.4
744 0.36
745 0.32
746 0.29
747 0.23
748 0.22
749 0.21
750 0.21
751 0.17
752 0.11
753 0.1
754 0.09
755 0.12
756 0.11
757 0.11
758 0.12
759 0.13
760 0.13
761 0.13
762 0.14
763 0.11
764 0.12
765 0.14
766 0.13
767 0.15
768 0.15
769 0.15
770 0.17
771 0.17
772 0.17
773 0.16
774 0.19
775 0.19
776 0.22
777 0.21
778 0.19
779 0.18
780 0.17
781 0.16
782 0.13
783 0.11
784 0.12
785 0.13
786 0.13
787 0.14
788 0.16
789 0.16
790 0.15
791 0.14
792 0.12
793 0.12
794 0.13
795 0.12
796 0.09
797 0.11
798 0.11
799 0.11
800 0.1
801 0.1
802 0.1
803 0.11
804 0.12
805 0.14
806 0.16
807 0.16
808 0.23
809 0.27
810 0.34
811 0.37
812 0.41
813 0.43
814 0.48
815 0.56
816 0.54
817 0.52
818 0.44
819 0.42
820 0.41
821 0.4
822 0.38
823 0.3
824 0.28
825 0.26
826 0.26
827 0.26
828 0.21
829 0.16
830 0.11
831 0.11
832 0.09
833 0.08
834 0.07
835 0.06
836 0.06
837 0.07
838 0.07
839 0.06
840 0.07
841 0.08
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.09
846 0.12
847 0.14
848 0.21
849 0.21
850 0.23
851 0.26
852 0.27
853 0.29
854 0.29
855 0.29
856 0.29
857 0.36
858 0.36
859 0.44
860 0.46
861 0.52
862 0.59
863 0.65
864 0.61
865 0.56
866 0.56
867 0.52
868 0.56
869 0.53
870 0.52
871 0.52
872 0.59
873 0.66