FuNGI

C1GTP1

Protein Details

Accession

C1GTP1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
413-438	EGAEIRAEKKRKKEEEEKKKKLGESR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-456	RAEKKRKKEEEEKKKKLGESRGVRDLKKVNVKGMKKLSA

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, plas 4, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040456 RNase_H2_suB IPR019024 RNase_H2_suB_wHTH IPR041195 Rnh202_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0032299 C:ribonuclease H2 complex
KEGG	pbl:PAAG_01886 -
Pfam	View protein in Pfam PF09468 RNase_H2-Ydr279 PF17745 Ydr279_N
CDD	cd09270 RNase_H2-B

Amino Acid Sequences

MRTRSAPARNVSNDEVDQSTPASVPSKSTKTLILPSNASDDARFISLENPRTGTQSRYFFCPKLGLYEFTAISSSSSTPRSTLFTGTTTTTTKANASPVADKREGEAQNGCYRMVSSGSSAEANEVIHQVVLDWAPTKATVAKHAQLLVTTPVDLLFFLLPILAAASGYSTAQKLFQPLDDMLDFQDNVSKPLRRILLGSLRSKAVARMAAVCDTVEAGETMYRLNEEKLVRELVSKAERMAANGLPPSLEEHFIHRALELPILSVKRDDILTSTSDVSDVASGANNSFEKVESQTTDSTTPITTSFATSFTSSDVSTPNTVITPPTNESLSPNCDIHQLLRIHTAISFLQSSYLPKHLSSRVKNILSSSEKSPKDFSPLTQHLKHIAELREKVLASRSPSDFSRKRGVEDDEGAEIRAEKKRKKEEEEKKKKLGESRGVRDLKKVNVKGMKKLSAFFGKKM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.4
3	0.31
4	0.28
5	0.22
6	0.2
7	0.15
8	0.16
9	0.15
10	0.13
11	0.18
12	0.24
13	0.28
14	0.3
15	0.32
16	0.34
17	0.36
18	0.43
19	0.44
20	0.42
21	0.39
22	0.38
23	0.42
24	0.39
25	0.35
26	0.27
27	0.23
28	0.19
29	0.18
30	0.17
31	0.12
32	0.17
33	0.22
34	0.27
35	0.28
36	0.3
37	0.29
38	0.34
39	0.35
40	0.35
41	0.36
42	0.39
43	0.38
44	0.42
45	0.47
46	0.43
47	0.44
48	0.43
49	0.37
50	0.36
51	0.38
52	0.33
53	0.3
54	0.33
55	0.31
56	0.27
57	0.27
58	0.19
59	0.16
60	0.15
61	0.14
62	0.13
63	0.15
64	0.15
65	0.16
66	0.17
67	0.21
68	0.21
69	0.22
70	0.21
71	0.2
72	0.22
73	0.23
74	0.24
75	0.22
76	0.21
77	0.19
78	0.18
79	0.19
80	0.18
81	0.19
82	0.2
83	0.21
84	0.27
85	0.31
86	0.37
87	0.36
88	0.35
89	0.34
90	0.39
91	0.38
92	0.33
93	0.32
94	0.29
95	0.32
96	0.33
97	0.31
98	0.23
99	0.22
100	0.2
101	0.17
102	0.14
103	0.11
104	0.11
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.11
110	0.1
111	0.09
112	0.09
113	0.08
114	0.07
115	0.07
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.07
124	0.08
125	0.1
126	0.11
127	0.16
128	0.2
129	0.23
130	0.24
131	0.25
132	0.25
133	0.21
134	0.22
135	0.19
136	0.14
137	0.12
138	0.1
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.05
144	0.05
145	0.05
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.04
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.07
160	0.08
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.13
165	0.13
166	0.15
167	0.14
168	0.14
169	0.12
170	0.13
171	0.12
172	0.09
173	0.13
174	0.11
175	0.13
176	0.16
177	0.17
178	0.16
179	0.21
180	0.22
181	0.18
182	0.19
183	0.22
184	0.28
185	0.31
186	0.33
187	0.3
188	0.29
189	0.29
190	0.28
191	0.24
192	0.17
193	0.13
194	0.11
195	0.12
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.12
200	0.1
201	0.08
202	0.08
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.13
217	0.14
218	0.14
219	0.14
220	0.14
221	0.14
222	0.16
223	0.15
224	0.13
225	0.16
226	0.16
227	0.16
228	0.18
229	0.14
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.09
234	0.09
235	0.1
236	0.09
237	0.1
238	0.09
239	0.13
240	0.16
241	0.16
242	0.16
243	0.14
244	0.15
245	0.14
246	0.15
247	0.11
248	0.09
249	0.11
250	0.12
251	0.12
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.07
258	0.09
259	0.09
260	0.11
261	0.11
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.07
267	0.06
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.1
279	0.12
280	0.11
281	0.14
282	0.15
283	0.16
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.13
288	0.13
289	0.1
290	0.11
291	0.1
292	0.1
293	0.11
294	0.11
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.11
299	0.12
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.12
311	0.13
312	0.15
313	0.16
314	0.16
315	0.16
316	0.19
317	0.21
318	0.24
319	0.23
320	0.21
321	0.2
322	0.21
323	0.22
324	0.2
325	0.24
326	0.21
327	0.19
328	0.23
329	0.23
330	0.21
331	0.2
332	0.21
333	0.14
334	0.15
335	0.14
336	0.1
337	0.12
338	0.12
339	0.14
340	0.15
341	0.19
342	0.18
343	0.18
344	0.23
345	0.29
346	0.38
347	0.41
348	0.47
349	0.52
350	0.53
351	0.54
352	0.5
353	0.5
354	0.46
355	0.45
356	0.42
357	0.42
358	0.42
359	0.43
360	0.45
361	0.38
362	0.4
363	0.39
364	0.35
365	0.36
366	0.43
367	0.48
368	0.48
369	0.49
370	0.47
371	0.47
372	0.47
373	0.43
374	0.41
375	0.41
376	0.4
377	0.4
378	0.38
379	0.37
380	0.35
381	0.33
382	0.31
383	0.29
384	0.33
385	0.33
386	0.32
387	0.35
388	0.44
389	0.43
390	0.45
391	0.5
392	0.45
393	0.47
394	0.5
395	0.53
396	0.49
397	0.49
398	0.46
399	0.4
400	0.39
401	0.35
402	0.29
403	0.25
404	0.23
405	0.26
406	0.31
407	0.33
408	0.42
409	0.53
410	0.61
411	0.7
412	0.77
413	0.81
414	0.85
415	0.9
416	0.9
417	0.88
418	0.86
419	0.82
420	0.79
421	0.78
422	0.77
423	0.76
424	0.74
425	0.75
426	0.75
427	0.7
428	0.69
429	0.65
430	0.64
431	0.64
432	0.59
433	0.59
434	0.62
435	0.65
436	0.67
437	0.7
438	0.69
439	0.61
440	0.59
441	0.57
442	0.59

C1GTP1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer