Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H5I6

Protein Details
Accession C1H5I6    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-56LSAPEPPSKKALRKAKKKSAALQTVEHydrophilic
315-343NEKTKNNHAKTKSKKPRMKKVWVNRILGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-48PSKKALRKAKKK
319-335KNNHAKTKSKKPRMKKV
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbl:PAAG_06027  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPGLKEPSHSQSPTATRKRKLDDGPALEIDLSAPEPPSKKALRKAKKKSAALQTVEPSLPISTEPVTDSNPTATLAPKSQPTENTEKPSKRSDYGVWVGNLPFTAKKSDIRKFLTGSGTLSNEDITRIHLPDGAKQNGKAQNKGFAYVDFSTSKAMETAIAMSEQLINGRRALIKNAKSYAGRPERTKGGESAAGGREVNNSSMAAAGKELSQRIFVGNLGFDVTKEILEDHFKPCGSIESVHVATFEDSGKCKGYAWVEFESIDGAEAAVRGFVKVPEEVDEDEDEDEDEELEEEGDSDAAREEERGANNKNDNEKTKNNHAKTKSKKPRMKKVWVNRILGRLLRMEFAEDKATRYRKRYGKEGTAKDKFAGGSGGSWGQGGDSEVPAIEEVSERKTKAFPPRAGKSQGSYGKGAASSGCRYTQDVVQRLSGAIVESHGKKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.64
3 0.63
4 0.71
5 0.76
6 0.77
7 0.75
8 0.75
9 0.74
10 0.72
11 0.7
12 0.62
13 0.56
14 0.47
15 0.39
16 0.29
17 0.2
18 0.15
19 0.1
20 0.1
21 0.13
22 0.15
23 0.17
24 0.24
25 0.3
26 0.36
27 0.46
28 0.56
29 0.63
30 0.72
31 0.81
32 0.85
33 0.88
34 0.88
35 0.87
36 0.87
37 0.86
38 0.79
39 0.74
40 0.66
41 0.61
42 0.53
43 0.44
44 0.34
45 0.25
46 0.21
47 0.15
48 0.14
49 0.1
50 0.11
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.17
57 0.17
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.17
62 0.18
63 0.2
64 0.24
65 0.26
66 0.29
67 0.32
68 0.36
69 0.43
70 0.45
71 0.51
72 0.55
73 0.56
74 0.56
75 0.6
76 0.58
77 0.52
78 0.51
79 0.46
80 0.45
81 0.45
82 0.46
83 0.38
84 0.36
85 0.34
86 0.29
87 0.26
88 0.19
89 0.16
90 0.13
91 0.16
92 0.16
93 0.22
94 0.3
95 0.36
96 0.43
97 0.46
98 0.49
99 0.47
100 0.5
101 0.48
102 0.4
103 0.36
104 0.31
105 0.27
106 0.23
107 0.21
108 0.17
109 0.14
110 0.13
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.16
117 0.16
118 0.22
119 0.3
120 0.31
121 0.3
122 0.3
123 0.38
124 0.42
125 0.45
126 0.43
127 0.37
128 0.41
129 0.39
130 0.41
131 0.34
132 0.26
133 0.28
134 0.24
135 0.25
136 0.18
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.16
141 0.11
142 0.1
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.2
160 0.26
161 0.28
162 0.32
163 0.34
164 0.35
165 0.33
166 0.34
167 0.39
168 0.39
169 0.38
170 0.36
171 0.37
172 0.39
173 0.41
174 0.41
175 0.32
176 0.26
177 0.24
178 0.22
179 0.23
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.15
185 0.13
186 0.13
187 0.1
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.11
218 0.11
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.15
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.15
243 0.16
244 0.19
245 0.2
246 0.19
247 0.19
248 0.19
249 0.17
250 0.14
251 0.11
252 0.07
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.1
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.07
292 0.11
293 0.14
294 0.19
295 0.21
296 0.26
297 0.31
298 0.35
299 0.4
300 0.42
301 0.44
302 0.46
303 0.5
304 0.51
305 0.57
306 0.63
307 0.61
308 0.64
309 0.66
310 0.7
311 0.73
312 0.78
313 0.78
314 0.79
315 0.83
316 0.84
317 0.88
318 0.88
319 0.9
320 0.89
321 0.89
322 0.89
323 0.89
324 0.85
325 0.77
326 0.72
327 0.65
328 0.56
329 0.47
330 0.39
331 0.31
332 0.27
333 0.23
334 0.21
335 0.19
336 0.19
337 0.23
338 0.2
339 0.22
340 0.29
341 0.37
342 0.39
343 0.42
344 0.5
345 0.51
346 0.55
347 0.62
348 0.63
349 0.66
350 0.71
351 0.76
352 0.77
353 0.76
354 0.72
355 0.63
356 0.57
357 0.46
358 0.37
359 0.29
360 0.19
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.14
381 0.18
382 0.19
383 0.21
384 0.24
385 0.3
386 0.39
387 0.48
388 0.51
389 0.56
390 0.64
391 0.7
392 0.73
393 0.7
394 0.62
395 0.62
396 0.61
397 0.55
398 0.49
399 0.42
400 0.38
401 0.36
402 0.32
403 0.25
404 0.22
405 0.22
406 0.23
407 0.25
408 0.24
409 0.26
410 0.29
411 0.32
412 0.36
413 0.39
414 0.38
415 0.38
416 0.37
417 0.35
418 0.33
419 0.27
420 0.19
421 0.13
422 0.13
423 0.17
424 0.18
425 0.21
426 0.24