FuNGI

C1GVP8

Protein Details

Accession

C1GVP8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-84	VEILSPRPPKRQRVDGDFKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
294-304	KKKSEKARLRK

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_mito 9, nucl 7, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR025313 DUF4217 IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	pbl:PAAG_02325 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF13959 DUF4217 PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd17949 DEADc_DDX31 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MADDGMLLNFSLGDGIINTQQKYKGGTWKDRLSVKKISLHRQNKSNSEDRGNARQKDGPGNPNRVEILSPRPPKRQRVDGDFKLSNRTGGQAAAPNTGSSNAGGGNTKENQARKNQNQPREIISSLFSFNPTSTSAVEPPKPEGESDEPSKPSNAPLIDGIDTFTSLGLSPTLAVHLMTKLELKAPTAVQKSAISQLLKEECDAFIQAQTGSGKTLAYLLPLVQRLINLSKTNGKAFGRGGGEEGNTAVHRDSGLFAIILAPTRELCKQISVVLEQLLRCAHWIVAGTVIGGEKKKSEKARLRKGLNILVATPGRLADHLENTKVLDVSNVRWLVLDEGDRLMDLGFEEEIQGIVKKLDERQKSNGIPGLPNKRVTILCSATLKMNVQRLGEISLKDAVHVQADPDDECNDAMAKNNANNSEFSVPAQLKQSYSVVAAKLRLVTLAALMKRTFARKGSVMKAIVFVSCADSVDFHFEVFSRQDSENKNEGEKEGPIVAETSFTTNLASVHVTIAKATAFSNPTNPVTLYKLHGSLPQHVRTSTLTSFARQSEAAVLICTDVAARGLDLPNVDFVIEYDPAFSADDHLHRIGRTARLGRDGRALIFLLPGNEEKYVEILKSGYRDGGANICRTDANETLKRGFGGNTETASKSWEAKATEWQLDIERWALENPAILEMARRAYQSHIRAYATHIAGERDMFNIKDLHLGHLAKSFALRDRPTKINVPGLRSGKDDMKKEFKADRKHTRDGAQDESSAVISDGARKMRAKLKEHMAGASEFNIA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.07
3	0.13
4	0.17
5	0.19
6	0.22
7	0.25
8	0.27
9	0.31
10	0.34
11	0.38
12	0.44
13	0.53
14	0.58
15	0.63
16	0.68
17	0.71
18	0.71
19	0.68
20	0.67
21	0.63
22	0.63
23	0.63
24	0.66
25	0.69
26	0.73
27	0.75
28	0.75
29	0.77
30	0.76
31	0.77
32	0.74
33	0.7
34	0.66
35	0.66
36	0.63
37	0.67
38	0.67
39	0.63
40	0.6
41	0.59
42	0.56
43	0.58
44	0.6
45	0.59
46	0.58
47	0.63
48	0.6
49	0.59
50	0.56
51	0.47
52	0.42
53	0.35
54	0.36
55	0.37
56	0.45
57	0.47
58	0.56
59	0.63
60	0.71
61	0.75
62	0.76
63	0.75
64	0.76
65	0.8
66	0.78
67	0.79
68	0.74
69	0.67
70	0.65
71	0.57
72	0.49
73	0.39
74	0.34
75	0.26
76	0.22
77	0.24
78	0.22
79	0.23
80	0.24
81	0.24
82	0.21
83	0.21
84	0.21
85	0.19
86	0.13
87	0.12
88	0.09
89	0.1
90	0.12
91	0.12
92	0.16
93	0.18
94	0.22
95	0.26
96	0.29
97	0.31
98	0.39
99	0.49
100	0.52
101	0.61
102	0.66
103	0.7
104	0.71
105	0.7
106	0.66
107	0.61
108	0.54
109	0.44
110	0.37
111	0.31
112	0.27
113	0.25
114	0.21
115	0.16
116	0.15
117	0.16
118	0.15
119	0.15
120	0.15
121	0.18
122	0.21
123	0.26
124	0.29
125	0.29
126	0.31
127	0.33
128	0.32
129	0.29
130	0.3
131	0.29
132	0.32
133	0.35
134	0.36
135	0.35
136	0.35
137	0.37
138	0.32
139	0.28
140	0.28
141	0.24
142	0.2
143	0.2
144	0.22
145	0.21
146	0.2
147	0.19
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.1
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.07
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.1
167	0.1
168	0.13
169	0.14
170	0.14
171	0.16
172	0.17
173	0.24
174	0.25
175	0.25
176	0.24
177	0.24
178	0.25
179	0.26
180	0.29
181	0.22
182	0.2
183	0.25
184	0.26
185	0.25
186	0.24
187	0.21
188	0.17
189	0.17
190	0.18
191	0.13
192	0.1
193	0.11
194	0.1
195	0.11
196	0.12
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.09
201	0.08
202	0.11
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.09
207	0.11
208	0.13
209	0.13
210	0.11
211	0.12
212	0.13
213	0.16
214	0.19
215	0.17
216	0.18
217	0.24
218	0.26
219	0.27
220	0.3
221	0.28
222	0.26
223	0.26
224	0.29
225	0.24
226	0.22
227	0.22
228	0.18
229	0.18
230	0.15
231	0.14
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.08
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.09
251	0.1
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.13
256	0.15
257	0.16
258	0.15
259	0.15
260	0.16
261	0.17
262	0.15
263	0.15
264	0.13
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.08
269	0.07
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.11
282	0.17
283	0.21
284	0.31
285	0.39
286	0.49
287	0.6
288	0.67
289	0.68
290	0.67
291	0.68
292	0.63
293	0.56
294	0.46
295	0.35
296	0.3
297	0.26
298	0.21
299	0.17
300	0.12
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.08
305	0.13
306	0.15
307	0.15
308	0.15
309	0.15
310	0.16
311	0.14
312	0.13
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.16
317	0.15
318	0.14
319	0.14
320	0.15
321	0.14
322	0.14
323	0.13
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.06
344	0.11
345	0.19
346	0.23
347	0.27
348	0.32
349	0.39
350	0.39
351	0.4
352	0.38
353	0.32
354	0.3
355	0.32
356	0.35
357	0.3
358	0.31
359	0.29
360	0.29
361	0.28
362	0.27
363	0.27
364	0.2
365	0.2
366	0.2
367	0.2
368	0.18
369	0.19
370	0.18
371	0.15
372	0.18
373	0.17
374	0.16
375	0.16
376	0.15
377	0.18
378	0.18
379	0.15
380	0.13
381	0.15
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.08
401	0.08
402	0.1
403	0.12
404	0.13
405	0.14
406	0.14
407	0.15
408	0.15
409	0.14
410	0.13
411	0.16
412	0.14
413	0.15
414	0.17
415	0.16
416	0.15
417	0.16
418	0.16
419	0.12
420	0.13
421	0.14
422	0.12
423	0.12
424	0.13
425	0.12
426	0.12
427	0.11
428	0.1
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.1
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.12
437	0.14
438	0.16
439	0.16
440	0.14
441	0.17
442	0.2
443	0.25
444	0.27
445	0.31
446	0.3
447	0.29
448	0.29
449	0.26
450	0.22
451	0.17
452	0.14
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.12
460	0.12
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.11
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.12
469	0.18
470	0.21
471	0.27
472	0.31
473	0.31
474	0.31
475	0.28
476	0.29
477	0.25
478	0.22
479	0.18
480	0.13
481	0.11
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.09
488	0.08
489	0.09
490	0.09
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.07
496	0.08
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.09
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.1
505	0.11
506	0.12
507	0.15
508	0.18
509	0.19
510	0.19
511	0.2
512	0.18
513	0.18
514	0.2
515	0.19
516	0.18
517	0.18
518	0.18
519	0.22
520	0.22
521	0.28
522	0.33
523	0.35
524	0.35
525	0.33
526	0.34
527	0.32
528	0.35
529	0.27
530	0.26
531	0.22
532	0.22
533	0.25
534	0.24
535	0.24
536	0.18
537	0.18
538	0.15
539	0.16
540	0.14
541	0.12
542	0.11
543	0.09
544	0.09
545	0.08
546	0.06
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.06
552	0.07
553	0.08
554	0.09
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.06
560	0.07
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.09
566	0.1
567	0.1
568	0.1
569	0.09
570	0.11
571	0.12
572	0.15
573	0.16
574	0.17
575	0.16
576	0.19
577	0.21
578	0.23
579	0.27
580	0.29
581	0.3
582	0.37
583	0.39
584	0.38
585	0.4
586	0.37
587	0.32
588	0.29
589	0.27
590	0.19
591	0.19
592	0.18
593	0.12
594	0.12
595	0.13
596	0.12
597	0.12
598	0.12
599	0.11
600	0.12
601	0.13
602	0.11
603	0.11
604	0.1
605	0.12
606	0.13
607	0.14
608	0.13
609	0.12
610	0.13
611	0.14
612	0.2
613	0.21
614	0.22
615	0.21
616	0.21
617	0.21
618	0.21
619	0.24
620	0.22
621	0.27
622	0.29
623	0.32
624	0.33
625	0.34
626	0.34
627	0.3
628	0.26
629	0.21
630	0.21
631	0.2
632	0.2
633	0.22
634	0.23
635	0.22
636	0.24
637	0.23
638	0.2
639	0.2
640	0.23
641	0.22
642	0.23
643	0.31
644	0.34
645	0.35
646	0.33
647	0.33
648	0.3
649	0.28
650	0.28
651	0.21
652	0.16
653	0.14
654	0.14
655	0.13
656	0.11
657	0.13
658	0.12
659	0.12
660	0.12
661	0.1
662	0.11
663	0.12
664	0.15
665	0.14
666	0.14
667	0.14
668	0.19
669	0.27
670	0.31
671	0.36
672	0.37
673	0.37
674	0.37
675	0.41
676	0.44
677	0.37
678	0.35
679	0.3
680	0.27
681	0.26
682	0.27
683	0.23
684	0.16
685	0.18
686	0.15
687	0.16
688	0.15
689	0.15
690	0.19
691	0.19
692	0.21
693	0.25
694	0.26
695	0.25
696	0.28
697	0.28
698	0.23
699	0.24
700	0.22
701	0.22
702	0.29
703	0.31
704	0.33
705	0.39
706	0.44
707	0.47
708	0.52
709	0.51
710	0.54
711	0.54
712	0.54
713	0.56
714	0.56
715	0.53
716	0.49
717	0.48
718	0.46
719	0.49
720	0.49
721	0.48
722	0.53
723	0.53
724	0.56
725	0.61
726	0.61
727	0.65
728	0.7
729	0.73
730	0.72
731	0.78
732	0.78
733	0.76
734	0.76
735	0.71
736	0.68
737	0.59
738	0.52
739	0.44
740	0.4
741	0.33
742	0.24
743	0.19
744	0.13
745	0.1
746	0.16
747	0.2
748	0.21
749	0.25
750	0.27
751	0.32
752	0.38
753	0.47
754	0.47
755	0.51
756	0.58
757	0.61
758	0.62
759	0.59
760	0.54
761	0.47
762	0.43

C1GVP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer