FuNGI

C1HDM5

Protein Details

Accession

C1HDM5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
53-72	GPPPYGKRTGWRPRNPEDFA	Hydrophilic
385-411	DEEAVRERERRRRQQRQEDERQLRQSR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
226-241	PKFKHKKIPRGPPSPP

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	pbl:PAAG_08882 -
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MATSIAQGLFKSLPKPKYTGEDEELPPHAQPKGPRIVGPGAVNESQVVLRVAGPPPYGKRTGWRPRNPEDFANGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGSSSKSNALAVQVDAEGKVKYDAIAKQGHGENRTVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLDRPSQEEVAEQMEKTKAALAKLVTGAVTAQKPKNVKGGKRNEPTFVRYTPANRMGDTSKKNDRIMKIVERQVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPRGFTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRQLAQKAREARSAGASRQESRARSRSITGSRSSSPYSSRSASPSEDEEAVRERERRRRQQRQEDERQLRQSRMGAERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQTSGFDSGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQGDDFDDEEAAGAEMSRIERNNRFEVLGRAKQGFKGAADAEARDGPVQFEKDTTDPFGIDGMIAEVTGAGGQKRYGIQEAEGTNERGSKRARVNDDDEHDRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.42
3	0.43
4	0.49
5	0.53
6	0.54
7	0.51
8	0.53
9	0.52
10	0.53
11	0.52
12	0.45
13	0.38
14	0.33
15	0.3
16	0.26
17	0.28
18	0.31
19	0.38
20	0.39
21	0.4
22	0.42
23	0.45
24	0.46
25	0.43
26	0.39
27	0.34
28	0.32
29	0.31
30	0.26
31	0.22
32	0.18
33	0.17
34	0.14
35	0.1
36	0.1
37	0.14
38	0.15
39	0.17
40	0.19
41	0.22
42	0.26
43	0.31
44	0.34
45	0.31
46	0.37
47	0.45
48	0.55
49	0.61
50	0.66
51	0.68
52	0.74
53	0.82
54	0.79
55	0.72
56	0.66
57	0.58
58	0.5
59	0.45
60	0.36
61	0.26
62	0.22
63	0.18
64	0.13
65	0.12
66	0.1
67	0.08
68	0.09
69	0.1
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.14
74	0.17
75	0.17
76	0.18
77	0.18
78	0.2
79	0.22
80	0.26
81	0.28
82	0.3
83	0.34
84	0.36
85	0.37
86	0.35
87	0.36
88	0.32
89	0.25
90	0.22
91	0.18
92	0.14
93	0.12
94	0.12
95	0.1
96	0.09
97	0.1
98	0.09
99	0.09
100	0.13
101	0.15
102	0.19
103	0.23
104	0.22
105	0.27
106	0.32
107	0.35
108	0.32
109	0.33
110	0.3
111	0.29
112	0.33
113	0.28
114	0.25
115	0.21
116	0.22
117	0.21
118	0.19
119	0.24
120	0.22
121	0.26
122	0.31
123	0.35
124	0.34
125	0.37
126	0.36
127	0.29
128	0.32
129	0.28
130	0.22
131	0.2
132	0.19
133	0.16
134	0.17
135	0.16
136	0.12
137	0.12
138	0.13
139	0.11
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.14
144	0.15
145	0.14
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.15
150	0.17
151	0.14
152	0.14
153	0.17
154	0.15
155	0.17
156	0.17
157	0.18
158	0.13
159	0.11
160	0.11
161	0.12
162	0.14
163	0.16
164	0.17
165	0.21
166	0.23
167	0.25
168	0.33
169	0.37
170	0.42
171	0.47
172	0.56
173	0.62
174	0.69
175	0.69
176	0.66
177	0.63
178	0.61
179	0.55
180	0.46
181	0.38
182	0.32
183	0.33
184	0.34
185	0.38
186	0.34
187	0.3
188	0.31
189	0.33
190	0.38
191	0.39
192	0.38
193	0.39
194	0.42
195	0.46
196	0.48
197	0.47
198	0.44
199	0.46
200	0.48
201	0.46
202	0.47
203	0.47
204	0.43
205	0.43
206	0.38
207	0.33
208	0.27
209	0.27
210	0.27
211	0.24
212	0.25
213	0.34
214	0.39
215	0.4
216	0.5
217	0.52
218	0.58
219	0.67
220	0.76
221	0.75
222	0.77
223	0.79
224	0.78
225	0.76
226	0.72
227	0.65
228	0.56
229	0.52
230	0.49
231	0.49
232	0.5
233	0.5
234	0.48
235	0.48
236	0.51
237	0.46
238	0.43
239	0.42
240	0.41
241	0.4
242	0.37
243	0.34
244	0.34
245	0.33
246	0.32
247	0.28
248	0.21
249	0.15
250	0.16
251	0.18
252	0.25
253	0.29
254	0.36
255	0.4
256	0.47
257	0.52
258	0.49
259	0.5
260	0.44
261	0.42
262	0.36
263	0.42
264	0.37
265	0.36
266	0.38
267	0.34
268	0.3
269	0.3
270	0.28
271	0.18
272	0.17
273	0.14
274	0.14
275	0.14
276	0.14
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.15
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.13
286	0.11
287	0.11
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.16
302	0.25
303	0.31
304	0.35
305	0.38
306	0.38
307	0.44
308	0.49
309	0.5
310	0.44
311	0.44
312	0.43
313	0.44
314	0.45
315	0.41
316	0.37
317	0.41
318	0.44
319	0.43
320	0.39
321	0.4
322	0.45
323	0.5
324	0.55
325	0.51
326	0.45
327	0.42
328	0.48
329	0.48
330	0.42
331	0.38
332	0.37
333	0.34
334	0.38
335	0.36
336	0.3
337	0.31
338	0.31
339	0.28
340	0.3
341	0.29
342	0.27
343	0.31
344	0.34
345	0.3
346	0.34
347	0.39
348	0.35
349	0.35
350	0.36
351	0.37
352	0.39
353	0.41
354	0.37
355	0.35
356	0.34
357	0.36
358	0.35
359	0.29
360	0.26
361	0.25
362	0.26
363	0.24
364	0.24
365	0.24
366	0.24
367	0.24
368	0.24
369	0.24
370	0.22
371	0.22
372	0.2
373	0.18
374	0.19
375	0.2
376	0.2
377	0.23
378	0.26
379	0.35
380	0.45
381	0.54
382	0.62
383	0.71
384	0.79
385	0.86
386	0.91
387	0.92
388	0.93
389	0.93
390	0.89
391	0.85
392	0.83
393	0.75
394	0.65
395	0.57
396	0.49
397	0.44
398	0.45
399	0.45
400	0.4
401	0.41
402	0.44
403	0.43
404	0.42
405	0.37
406	0.3
407	0.32
408	0.36
409	0.37
410	0.37
411	0.35
412	0.39
413	0.4
414	0.41
415	0.33
416	0.27
417	0.23
418	0.19
419	0.19
420	0.16
421	0.14
422	0.12
423	0.14
424	0.13
425	0.15
426	0.16
427	0.17
428	0.18
429	0.2
430	0.21
431	0.22
432	0.28
433	0.3
434	0.31
435	0.35
436	0.34
437	0.37
438	0.39
439	0.36
440	0.29
441	0.26
442	0.24
443	0.22
444	0.24
445	0.2
446	0.16
447	0.17
448	0.2
449	0.19
450	0.18
451	0.16
452	0.13
453	0.14
454	0.16
455	0.19
456	0.17
457	0.16
458	0.16
459	0.16
460	0.19
461	0.18
462	0.2
463	0.16
464	0.18
465	0.19
466	0.2
467	0.19
468	0.17
469	0.17
470	0.18
471	0.19
472	0.17
473	0.19
474	0.22
475	0.22
476	0.27
477	0.32
478	0.34
479	0.33
480	0.33
481	0.31
482	0.25
483	0.24
484	0.19
485	0.13
486	0.07
487	0.05
488	0.04
489	0.06
490	0.07
491	0.1
492	0.12
493	0.18
494	0.24
495	0.3
496	0.34
497	0.35
498	0.35
499	0.35
500	0.41
501	0.45
502	0.44
503	0.42
504	0.41
505	0.41
506	0.41
507	0.42
508	0.36
509	0.28
510	0.27
511	0.24
512	0.25
513	0.25
514	0.24
515	0.23
516	0.22
517	0.22
518	0.18
519	0.18
520	0.15
521	0.19
522	0.2
523	0.18
524	0.18
525	0.2
526	0.22
527	0.24
528	0.26
529	0.22
530	0.2
531	0.2
532	0.2
533	0.16
534	0.13
535	0.11
536	0.08
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.07
546	0.08
547	0.11
548	0.13
549	0.16
550	0.19
551	0.2
552	0.2
553	0.26
554	0.27
555	0.3
556	0.31
557	0.31
558	0.28
559	0.31
560	0.3
561	0.29
562	0.32
563	0.34
564	0.4
565	0.47
566	0.53
567	0.56
568	0.63
569	0.66
570	0.7
571	0.71

C1HDM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer