FuNGI

C1H8L2

Protein Details

Accession

C1H8L2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-123	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
407-427	AIFRRRRQTEERKNANAKRRK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-444	RRRRQTEERKNANAKRRKEEERVREEERSRKRRRS

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto_nucl 7, nucl 6.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	pbl:PAAG_07103 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSSKYPKIISSVVEELPQEIDGQEVPVDTTKPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPPPSNEEEMMLEIFKYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEADEKKVEFAKLLRKQNGKKSCEEIVEEVIVKTWDSNVITPGTPFMDILAAALRYWVAYKLNTDPAWEKLKIIISDATVPGEGEHKIMEFIRSQRSCPEHNPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQESKGRTCHLCGQTGHIAEACKGTAKEKNGEFDEKGKGSSLKPFIWLHVSVLREYLAVEMHVPQQPFPFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIRENGIDTLIAIWRDNIPVMGGYLTKDGHVDLNRAQLILQGLAKQEDAIFRRRRQTEERKNANAKRRKEEERVREEERSRKRRRSSPTYGTMRNELSLPAPPPLMVPGKGNISRAERELTHSMVVNRGAIYKANMANKSAAAAIKSQLFKGASSNGDSTGIDAEDSVDGATDASSPTHLGKRKADALDTGTESETPSIKPQDNDDDLPPDTVRLWEEGYADRYYEQKFQVHPKDIEFRHKVARAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWTWYYPYHYAPFAADFVDLGKMNIEFNRGAPFKPFEQLMGVLPAASNHAIPEVFHDLMSDPNSEIIDFYPEEFPIDLNGKKFAWQGVALLPFIDEKRLLVAMEKRYHLLSSEEHARNSMGRDVLLVSDRHPLYDNLTANFYSKKQGLPKLKLNMRVSEGLGGKVERNDAYVPHSSLVPPFDNVDLPTLDEDHSISVLYDIPKSMNTHKSMLLRGVKPNPPVLDKTDIEITRNKAQRSGRSFGGVPFSNGRGRGGPMSYGSNRPNNDRPNPFAAHINPDFVPPPIPPSHTGGPPAGWAPPPPRMVGGAYGASRFDRLPQAHPYQQQRSHSYPHQSGQRGQYSQSYNQPREYGQDRLSGQTQQYGQRGGYGQYRGSHNTSGGGGGGGGGGNAGRARGGGSYRGGGRGYYQGQNTYNGNRHDGYGRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.46
3	0.47
4	0.47
5	0.42
6	0.4
7	0.39
8	0.35
9	0.31
10	0.3
11	0.26
12	0.25
13	0.22
14	0.16
15	0.11
16	0.11
17	0.09
18	0.1
19	0.1
20	0.09
21	0.1
22	0.11
23	0.13
24	0.12
25	0.19
26	0.26
27	0.3
28	0.33
29	0.34
30	0.35
31	0.38
32	0.4
33	0.39
34	0.34
35	0.33
36	0.3
37	0.28
38	0.25
39	0.2
40	0.18
41	0.12
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.08
46	0.09
47	0.1
48	0.12
49	0.17
50	0.2
51	0.2
52	0.28
53	0.37
54	0.44
55	0.51
56	0.52
57	0.55
58	0.56
59	0.59
60	0.51
61	0.45
62	0.38
63	0.32
64	0.29
65	0.23
66	0.18
67	0.14
68	0.13
69	0.1
70	0.11
71	0.1
72	0.13
73	0.13
74	0.17
75	0.2
76	0.28
77	0.37
78	0.44
79	0.46
80	0.45
81	0.46
82	0.45
83	0.44
84	0.39
85	0.32
86	0.29
87	0.27
88	0.25
89	0.24
90	0.21
91	0.2
92	0.18
93	0.15
94	0.1
95	0.13
96	0.19
97	0.26
98	0.37
99	0.46
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.82
105	0.79
106	0.76
107	0.77
108	0.77
109	0.72
110	0.73
111	0.65
112	0.59
113	0.64
114	0.58
115	0.49
116	0.44
117	0.39
118	0.33
119	0.37
120	0.35
121	0.28
122	0.31
123	0.4
124	0.42
125	0.51
126	0.55
127	0.59
128	0.66
129	0.74
130	0.79
131	0.73
132	0.7
133	0.66
134	0.64
135	0.58
136	0.54
137	0.46
138	0.39
139	0.37
140	0.33
141	0.27
142	0.23
143	0.19
144	0.15
145	0.13
146	0.1
147	0.12
148	0.12
149	0.13
150	0.14
151	0.16
152	0.17
153	0.17
154	0.18
155	0.15
156	0.14
157	0.13
158	0.11
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.13
173	0.18
174	0.25
175	0.25
176	0.27
177	0.28
178	0.31
179	0.36
180	0.33
181	0.29
182	0.26
183	0.32
184	0.29
185	0.29
186	0.26
187	0.21
188	0.24
189	0.24
190	0.21
191	0.16
192	0.15
193	0.13
194	0.13
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.17
204	0.26
205	0.27
206	0.28
207	0.34
208	0.38
209	0.41
210	0.45
211	0.52
212	0.51
213	0.59
214	0.63
215	0.61
216	0.64
217	0.6
218	0.54
219	0.44
220	0.36
221	0.28
222	0.25
223	0.21
224	0.13
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.18
242	0.2
243	0.24
244	0.25
245	0.26
246	0.25
247	0.28
248	0.27
249	0.24
250	0.28
251	0.24
252	0.24
253	0.24
254	0.24
255	0.21
256	0.24
257	0.33
258	0.29
259	0.34
260	0.32
261	0.36
262	0.39
263	0.39
264	0.36
265	0.28
266	0.25
267	0.2
268	0.21
269	0.15
270	0.12
271	0.12
272	0.14
273	0.18
274	0.21
275	0.27
276	0.28
277	0.33
278	0.34
279	0.38
280	0.37
281	0.36
282	0.38
283	0.32
284	0.3
285	0.27
286	0.25
287	0.22
288	0.28
289	0.29
290	0.24
291	0.28
292	0.28
293	0.27
294	0.29
295	0.29
296	0.24
297	0.23
298	0.23
299	0.19
300	0.19
301	0.17
302	0.13
303	0.13
304	0.11
305	0.07
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.11
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.15
314	0.16
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.16
320	0.16
321	0.16
322	0.16
323	0.16
324	0.13
325	0.11
326	0.11
327	0.1
328	0.08
329	0.07
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.08
344	0.12
345	0.15
346	0.16
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.1
353	0.06
354	0.06
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.07
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.08
370	0.08
371	0.07
372	0.08
373	0.08
374	0.11
375	0.12
376	0.13
377	0.13
378	0.18
379	0.18
380	0.18
381	0.17
382	0.15
383	0.15
384	0.14
385	0.13
386	0.1
387	0.1
388	0.11
389	0.11
390	0.09
391	0.09
392	0.12
393	0.13
394	0.2
395	0.26
396	0.29
397	0.37
398	0.4
399	0.44
400	0.5
401	0.59
402	0.62
403	0.67
404	0.72
405	0.72
406	0.79
407	0.8
408	0.81
409	0.78
410	0.72
411	0.7
412	0.69
413	0.67
414	0.68
415	0.71
416	0.71
417	0.71
418	0.71
419	0.66
420	0.65
421	0.63
422	0.63
423	0.64
424	0.64
425	0.64
426	0.67
427	0.7
428	0.72
429	0.77
430	0.77
431	0.76
432	0.74
433	0.75
434	0.73
435	0.71
436	0.64
437	0.58
438	0.49
439	0.4
440	0.32
441	0.23
442	0.17
443	0.15
444	0.14
445	0.11
446	0.11
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.13
451	0.11
452	0.11
453	0.12
454	0.16
455	0.17
456	0.19
457	0.19
458	0.2
459	0.21
460	0.21
461	0.21
462	0.17
463	0.21
464	0.21
465	0.2
466	0.17
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.16
471	0.12
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.11
478	0.14
479	0.18
480	0.18
481	0.18
482	0.19
483	0.18
484	0.18
485	0.15
486	0.12
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.12
491	0.13
492	0.12
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.14
497	0.15
498	0.12
499	0.14
500	0.14
501	0.12
502	0.13
503	0.12
504	0.11
505	0.09
506	0.08
507	0.06
508	0.05
509	0.05
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.04
521	0.04
522	0.06
523	0.11
524	0.14
525	0.17
526	0.19
527	0.23
528	0.28
529	0.28
530	0.28
531	0.24
532	0.23
533	0.22
534	0.21
535	0.19
536	0.13
537	0.13
538	0.12
539	0.12
540	0.1
541	0.08
542	0.1
543	0.12
544	0.13
545	0.14
546	0.16
547	0.21
548	0.23
549	0.24
550	0.23
551	0.23
552	0.21
553	0.22
554	0.19
555	0.14
556	0.11
557	0.1
558	0.1
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.09
563	0.1
564	0.13
565	0.13
566	0.12
567	0.12
568	0.14
569	0.14
570	0.17
571	0.17
572	0.18
573	0.2
574	0.28
575	0.34
576	0.38
577	0.37
578	0.36
579	0.43
580	0.41
581	0.48
582	0.43
583	0.38
584	0.39
585	0.41
586	0.39
587	0.33
588	0.34
589	0.26
590	0.26
591	0.24
592	0.18
593	0.15
594	0.14
595	0.11
596	0.08
597	0.07
598	0.04
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.06
605	0.06
606	0.07
607	0.12
608	0.16
609	0.15
610	0.19
611	0.2
612	0.25
613	0.28
614	0.3
615	0.27
616	0.23
617	0.23
618	0.2
619	0.19
620	0.15
621	0.12
622	0.09
623	0.07
624	0.07
625	0.09
626	0.08
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.08
631	0.08
632	0.1
633	0.08
634	0.09
635	0.16
636	0.16
637	0.16
638	0.18
639	0.2
640	0.19
641	0.21
642	0.2
643	0.14
644	0.15
645	0.16
646	0.14
647	0.13
648	0.12
649	0.09
650	0.09
651	0.09
652	0.08
653	0.08
654	0.07
655	0.05
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.1
660	0.13
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.13
665	0.15
666	0.16
667	0.13
668	0.09
669	0.1
670	0.1
671	0.09
672	0.09
673	0.08
674	0.09
675	0.08
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.11
681	0.1
682	0.1
683	0.13
684	0.13
685	0.13
686	0.15
687	0.15
688	0.16
689	0.17
690	0.16
691	0.15
692	0.13
693	0.14
694	0.15
695	0.17
696	0.15
697	0.14
698	0.13
699	0.12
700	0.12
701	0.12
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.09
706	0.09
707	0.11
708	0.17
709	0.23
710	0.28
711	0.28
712	0.28
713	0.28
714	0.28
715	0.25
716	0.22
717	0.16
718	0.17
719	0.26
720	0.27
721	0.26
722	0.27
723	0.26
724	0.25
725	0.25
726	0.24
727	0.15
728	0.13
729	0.13
730	0.13
731	0.14
732	0.15
733	0.13
734	0.11
735	0.18
736	0.18
737	0.18
738	0.19
739	0.18
740	0.2
741	0.26
742	0.27
743	0.21
744	0.23
745	0.22
746	0.22
747	0.24
748	0.21
749	0.18
750	0.18
751	0.21
752	0.26
753	0.34
754	0.42
755	0.47
756	0.55
757	0.6
758	0.64
759	0.68
760	0.65
761	0.6
762	0.54
763	0.5
764	0.42
765	0.38
766	0.34
767	0.26
768	0.24
769	0.21
770	0.18
771	0.17
772	0.18
773	0.12
774	0.14
775	0.14
776	0.13
777	0.17
778	0.2
779	0.2
780	0.18
781	0.19
782	0.17
783	0.18
784	0.21
785	0.18
786	0.15
787	0.15
788	0.15
789	0.16
790	0.16
791	0.16
792	0.13
793	0.13
794	0.13
795	0.12
796	0.12
797	0.11
798	0.11
799	0.09
800	0.09
801	0.08
802	0.07
803	0.07
804	0.09
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.11
809	0.13
810	0.16
811	0.22
812	0.26
813	0.28
814	0.3
815	0.34
816	0.37
817	0.37
818	0.42
819	0.43
820	0.4
821	0.44
822	0.49
823	0.5
824	0.49
825	0.51
826	0.47
827	0.43
828	0.42
829	0.39
830	0.39
831	0.34
832	0.34
833	0.37
834	0.35
835	0.33
836	0.36
837	0.36
838	0.38
839	0.43
840	0.4
841	0.39
842	0.45
843	0.51
844	0.53
845	0.53
846	0.46
847	0.45
848	0.45
849	0.41
850	0.42
851	0.34
852	0.29
853	0.28
854	0.29
855	0.28
856	0.28
857	0.27
858	0.22
859	0.23
860	0.24
861	0.22
862	0.21
863	0.2
864	0.25
865	0.26
866	0.31
867	0.33
868	0.37
869	0.38
870	0.43
871	0.49
872	0.52
873	0.58
874	0.57
875	0.58
876	0.58
877	0.59
878	0.54
879	0.52
880	0.46
881	0.45
882	0.4
883	0.38
884	0.31
885	0.3
886	0.29
887	0.24
888	0.23
889	0.15
890	0.2
891	0.19
892	0.22
893	0.23
894	0.29
895	0.32
896	0.33
897	0.36
898	0.31
899	0.29
900	0.28
901	0.26
902	0.22
903	0.19
904	0.2
905	0.21
906	0.26
907	0.27
908	0.27
909	0.27
910	0.26
911	0.26
912	0.25
913	0.25
914	0.21
915	0.21
916	0.2
917	0.2
918	0.19
919	0.19
920	0.16
921	0.17
922	0.21
923	0.23
924	0.27
925	0.34
926	0.41
927	0.47
928	0.54
929	0.6
930	0.61
931	0.65
932	0.68
933	0.67
934	0.64
935	0.64
936	0.64
937	0.64
938	0.6
939	0.6
940	0.62
941	0.6
942	0.61
943	0.62
944	0.63
945	0.56
946	0.52
947	0.54
948	0.5
949	0.51
950	0.54
951	0.55
952	0.51
953	0.53
954	0.54
955	0.47
956	0.48
957	0.47
958	0.44
959	0.37
960	0.41
961	0.38
962	0.4
963	0.42
964	0.39
965	0.36
966	0.35
967	0.37
968	0.36
969	0.38
970	0.36
971	0.33
972	0.33
973	0.34
974	0.31
975	0.33
976	0.3
977	0.3
978	0.32
979	0.37
980	0.37
981	0.4
982	0.39
983	0.34
984	0.32
985	0.3
986	0.25
987	0.21
988	0.16
989	0.12
990	0.09
991	0.09
992	0.06
993	0.05
994	0.04
995	0.04
996	0.05
997	0.05
998	0.05
999	0.05
1000	0.05
1001	0.07
1002	0.1
1003	0.12
1004	0.15
1005	0.17
1006	0.22
1007	0.23
1008	0.26
1009	0.26
1010	0.23
1011	0.24
1012	0.28
1013	0.3
1014	0.31
1015	0.32
1016	0.35
1017	0.37
1018	0.41
1019	0.42
1020	0.42
1021	0.45
1022	0.42
1023	0.44
1024	0.39
1025	0.4

C1H8L2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer