Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HCW9

Protein Details
Accession C1HCW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
703-727DGAGGVDARRRRRRAREVERMYTEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
711-717RRRRRRA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001810  F-box_dom  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR006553  Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_08610  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
PF13516  LRR_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MATSMSSGSSGDNQPGTPTKLKGHQRLLKGLQRMSSSPSLVRTGRKRSSSLGSRRLGNPSMSCVSLSSPSYSQCFGNSSSPQIYKCLSTAPNNIPSDRQTVQDENNTPIRMVFSDTAVAAAANSWPQITVPLPADVRPTSRSGILPSSMEVDEDSCEMKDAVGETAPPQKSHFEFWADMPEEIKMAILQYLPAKDLFRCSRVSKSWNKMCFDGQLWARLDASTYYTDIPSEALVKVITAAGPFLRDLNLRGCTQLEDAWQSHGERIADVCRNLANICIRDSRIDRNTLHLLLRKNPKLVHIDLSGLAIVNNCSMRIISQSCPNLELLDISWCKGVDAKGLKRIVASCPHLRDLRVNELSGFDNHQLQQQLFEENSLERLILSHCSSLSDMSLKILMEGINPEIDLLTDRAVVPPRKLKHLDLSRCRSLTDVGIKSLAHNLPLLEGLQLSQCPNIGDEALLDVLRSTPRLTHLDLEELDKLTNTFLIELSKAPCAATLQHLNLSFCERIGDTGVLQLLKNCSSIRSLDLDNTRVSDLTLMELCSQARKRGFGNSFPKLGFRVAVFDCGNVTWAGVREVLSSNTYVPRQRAINPPTTAKSPTESSQSLSSTPSSYTTTTVSTTTFLPHTPYNIHPITITDDPSTFPPSATILYPKEIIDLKCFYGWQMMVNEHTKRVLRGNLAGAMRLERKWADYMMATEEAGADGAGGVDARRRRRRAREVERMYTEEDDGDESAYGPAGLAPLGGRRRRARSGGCVIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.28
3 0.32
4 0.32
5 0.34
6 0.36
7 0.43
8 0.53
9 0.58
10 0.64
11 0.65
12 0.67
13 0.73
14 0.76
15 0.74
16 0.72
17 0.66
18 0.6
19 0.56
20 0.51
21 0.48
22 0.44
23 0.4
24 0.35
25 0.35
26 0.36
27 0.36
28 0.43
29 0.45
30 0.5
31 0.56
32 0.58
33 0.58
34 0.58
35 0.64
36 0.65
37 0.67
38 0.67
39 0.63
40 0.64
41 0.64
42 0.66
43 0.59
44 0.54
45 0.45
46 0.42
47 0.4
48 0.35
49 0.32
50 0.26
51 0.25
52 0.24
53 0.24
54 0.22
55 0.21
56 0.22
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.27
64 0.27
65 0.29
66 0.34
67 0.36
68 0.35
69 0.35
70 0.34
71 0.29
72 0.27
73 0.29
74 0.27
75 0.3
76 0.37
77 0.41
78 0.48
79 0.49
80 0.49
81 0.45
82 0.44
83 0.44
84 0.37
85 0.34
86 0.3
87 0.32
88 0.36
89 0.41
90 0.41
91 0.39
92 0.43
93 0.41
94 0.35
95 0.31
96 0.29
97 0.21
98 0.23
99 0.2
100 0.15
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.09
115 0.09
116 0.12
117 0.13
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.23
122 0.22
123 0.24
124 0.23
125 0.24
126 0.22
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.25
131 0.24
132 0.23
133 0.2
134 0.22
135 0.2
136 0.18
137 0.15
138 0.13
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.18
153 0.2
154 0.19
155 0.2
156 0.24
157 0.25
158 0.29
159 0.3
160 0.26
161 0.26
162 0.27
163 0.34
164 0.3
165 0.29
166 0.25
167 0.22
168 0.18
169 0.16
170 0.15
171 0.07
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.21
183 0.23
184 0.23
185 0.27
186 0.29
187 0.34
188 0.38
189 0.45
190 0.47
191 0.54
192 0.6
193 0.62
194 0.62
195 0.57
196 0.54
197 0.5
198 0.42
199 0.38
200 0.31
201 0.31
202 0.3
203 0.28
204 0.27
205 0.23
206 0.22
207 0.16
208 0.17
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.1
234 0.13
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.14
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.16
251 0.12
252 0.13
253 0.15
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.15
259 0.15
260 0.17
261 0.16
262 0.14
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.21
267 0.24
268 0.28
269 0.27
270 0.31
271 0.29
272 0.32
273 0.35
274 0.33
275 0.33
276 0.3
277 0.29
278 0.32
279 0.4
280 0.38
281 0.38
282 0.37
283 0.38
284 0.39
285 0.38
286 0.34
287 0.26
288 0.25
289 0.22
290 0.22
291 0.18
292 0.13
293 0.11
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.09
303 0.11
304 0.11
305 0.17
306 0.2
307 0.2
308 0.21
309 0.21
310 0.18
311 0.15
312 0.14
313 0.08
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.11
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.19
324 0.21
325 0.27
326 0.28
327 0.28
328 0.27
329 0.28
330 0.25
331 0.24
332 0.27
333 0.24
334 0.26
335 0.29
336 0.29
337 0.29
338 0.3
339 0.28
340 0.32
341 0.29
342 0.27
343 0.24
344 0.24
345 0.25
346 0.21
347 0.19
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.13
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.07
397 0.12
398 0.14
399 0.15
400 0.22
401 0.23
402 0.29
403 0.31
404 0.32
405 0.37
406 0.45
407 0.52
408 0.54
409 0.59
410 0.58
411 0.55
412 0.53
413 0.45
414 0.36
415 0.31
416 0.29
417 0.23
418 0.2
419 0.2
420 0.2
421 0.2
422 0.24
423 0.2
424 0.13
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.06
431 0.06
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.11
455 0.14
456 0.15
457 0.17
458 0.18
459 0.21
460 0.21
461 0.22
462 0.2
463 0.17
464 0.16
465 0.13
466 0.12
467 0.09
468 0.09
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.13
483 0.16
484 0.16
485 0.2
486 0.21
487 0.21
488 0.21
489 0.24
490 0.19
491 0.15
492 0.15
493 0.11
494 0.11
495 0.13
496 0.12
497 0.09
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.12
503 0.11
504 0.11
505 0.13
506 0.12
507 0.11
508 0.13
509 0.14
510 0.14
511 0.16
512 0.16
513 0.2
514 0.23
515 0.24
516 0.23
517 0.23
518 0.21
519 0.18
520 0.17
521 0.13
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.1
526 0.1
527 0.11
528 0.11
529 0.16
530 0.17
531 0.21
532 0.22
533 0.23
534 0.24
535 0.32
536 0.36
537 0.39
538 0.47
539 0.45
540 0.47
541 0.45
542 0.45
543 0.37
544 0.34
545 0.26
546 0.18
547 0.19
548 0.16
549 0.21
550 0.2
551 0.18
552 0.18
553 0.16
554 0.17
555 0.12
556 0.11
557 0.07
558 0.08
559 0.09
560 0.09
561 0.1
562 0.1
563 0.12
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.14
568 0.17
569 0.19
570 0.21
571 0.21
572 0.24
573 0.25
574 0.3
575 0.38
576 0.39
577 0.45
578 0.45
579 0.49
580 0.48
581 0.48
582 0.46
583 0.37
584 0.36
585 0.31
586 0.3
587 0.32
588 0.29
589 0.29
590 0.3
591 0.3
592 0.27
593 0.25
594 0.24
595 0.19
596 0.19
597 0.19
598 0.18
599 0.17
600 0.18
601 0.17
602 0.18
603 0.18
604 0.18
605 0.16
606 0.15
607 0.15
608 0.16
609 0.15
610 0.14
611 0.17
612 0.17
613 0.19
614 0.22
615 0.23
616 0.28
617 0.27
618 0.27
619 0.24
620 0.24
621 0.27
622 0.25
623 0.25
624 0.19
625 0.19
626 0.2
627 0.22
628 0.24
629 0.19
630 0.17
631 0.15
632 0.16
633 0.17
634 0.17
635 0.21
636 0.19
637 0.21
638 0.23
639 0.22
640 0.23
641 0.27
642 0.26
643 0.26
644 0.26
645 0.26
646 0.25
647 0.25
648 0.23
649 0.23
650 0.22
651 0.2
652 0.21
653 0.2
654 0.24
655 0.3
656 0.31
657 0.27
658 0.31
659 0.29
660 0.29
661 0.33
662 0.34
663 0.32
664 0.35
665 0.37
666 0.39
667 0.38
668 0.37
669 0.32
670 0.31
671 0.3
672 0.25
673 0.25
674 0.2
675 0.22
676 0.23
677 0.23
678 0.21
679 0.2
680 0.22
681 0.23
682 0.23
683 0.2
684 0.17
685 0.16
686 0.14
687 0.12
688 0.1
689 0.05
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.1
696 0.16
697 0.26
698 0.36
699 0.44
700 0.54
701 0.64
702 0.75
703 0.81
704 0.87
705 0.88
706 0.88
707 0.9
708 0.86
709 0.79
710 0.71
711 0.62
712 0.52
713 0.41
714 0.32
715 0.25
716 0.19
717 0.16
718 0.13
719 0.11
720 0.1
721 0.1
722 0.09
723 0.07
724 0.07
725 0.06
726 0.06
727 0.05
728 0.06
729 0.13
730 0.22
731 0.26
732 0.34
733 0.41
734 0.49
735 0.56
736 0.64
737 0.64
738 0.65