Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9IP98

Protein Details
Accession W9IP98    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24LSEPRRPRLLPQNRKLRHLRGBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040939  Vps38  
Gene Ontology GO:0034272  C:phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II  
Pfam View protein in Pfam  
PF17649  VPS38  
Amino Acid Sequences MSTLSEPRRPRLLPQNRKLRHLRGIWLRNLSFAPTSLRTADDADLATSKLQVVKESSQLHPSRSSESLRKDSVRPDALRPVQKRRTSLSLAHVNLVARQKNLETLYEEAVGDVFYSLHVDGDAEPVYISEVRERATSFNFKFFSLENCASAISRCHSMILRIWARRPKADSWIFLLEETIDLRRLNFIGTLMDRNFPPNALIFHLEDGVYSFDFPNKISEPKQAPQVATSSYNALMKLANLESSIEDAIETQQRLMEEINRILDESPPDNSQMAREAVAMADKYVTAQKRANKQAQNKRDDLQESIRSRHEAIVKGRELQNEAEKDMASSREKLTASEELLEQTQQQIRGQRRRICADLSDIFPITPIPNAPPLSFQICNIPLPNSIYDAATARSISEDLLSAGLGIVALLTKHLQFYLAHPLPYPLDWFGSRSYARDDISQLSDRTVSRREFPLYLPRGGSTAGQWRFEYAWFLLNKDIEALCSSQGLRVVDIRHTLPNLKYLLYVCSAGSDQVPERKKGGVRGLWAGRMKGRMSTMSAQFDGDSSSVTESRRGSADSEANQNGDVLRDAIIKSNGHNKDEGRDSLDDGVALPFGEGDAKFTLRTKGLRERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.75
4 0.82
5 0.82
6 0.79
7 0.77
8 0.71
9 0.71
10 0.7
11 0.74
12 0.73
13 0.73
14 0.65
15 0.59
16 0.54
17 0.47
18 0.38
19 0.31
20 0.3
21 0.24
22 0.26
23 0.25
24 0.25
25 0.24
26 0.25
27 0.25
28 0.21
29 0.19
30 0.17
31 0.17
32 0.16
33 0.15
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.16
39 0.2
40 0.22
41 0.29
42 0.33
43 0.35
44 0.4
45 0.42
46 0.43
47 0.44
48 0.43
49 0.4
50 0.4
51 0.44
52 0.42
53 0.48
54 0.52
55 0.52
56 0.53
57 0.52
58 0.54
59 0.56
60 0.57
61 0.52
62 0.5
63 0.54
64 0.58
65 0.64
66 0.64
67 0.66
68 0.67
69 0.69
70 0.69
71 0.65
72 0.64
73 0.6
74 0.59
75 0.57
76 0.57
77 0.53
78 0.5
79 0.46
80 0.39
81 0.38
82 0.4
83 0.33
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.26
90 0.22
91 0.22
92 0.24
93 0.23
94 0.23
95 0.17
96 0.16
97 0.13
98 0.11
99 0.08
100 0.06
101 0.04
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.21
123 0.29
124 0.28
125 0.33
126 0.33
127 0.32
128 0.33
129 0.31
130 0.3
131 0.29
132 0.29
133 0.23
134 0.22
135 0.22
136 0.21
137 0.21
138 0.19
139 0.13
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.17
145 0.2
146 0.27
147 0.32
148 0.32
149 0.39
150 0.43
151 0.46
152 0.48
153 0.48
154 0.42
155 0.45
156 0.47
157 0.42
158 0.41
159 0.42
160 0.38
161 0.33
162 0.3
163 0.21
164 0.17
165 0.16
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.15
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.17
205 0.18
206 0.25
207 0.29
208 0.3
209 0.37
210 0.36
211 0.35
212 0.33
213 0.33
214 0.27
215 0.24
216 0.23
217 0.17
218 0.15
219 0.16
220 0.14
221 0.13
222 0.11
223 0.09
224 0.11
225 0.09
226 0.08
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.16
275 0.21
276 0.29
277 0.37
278 0.44
279 0.47
280 0.56
281 0.63
282 0.69
283 0.69
284 0.63
285 0.57
286 0.53
287 0.48
288 0.41
289 0.36
290 0.35
291 0.32
292 0.32
293 0.32
294 0.29
295 0.28
296 0.29
297 0.27
298 0.24
299 0.25
300 0.3
301 0.29
302 0.31
303 0.33
304 0.3
305 0.28
306 0.25
307 0.27
308 0.21
309 0.21
310 0.18
311 0.16
312 0.15
313 0.14
314 0.15
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.19
322 0.18
323 0.18
324 0.17
325 0.16
326 0.12
327 0.13
328 0.12
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.18
335 0.26
336 0.34
337 0.42
338 0.46
339 0.49
340 0.52
341 0.53
342 0.48
343 0.41
344 0.39
345 0.33
346 0.28
347 0.25
348 0.21
349 0.18
350 0.17
351 0.16
352 0.1
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.12
357 0.13
358 0.13
359 0.15
360 0.16
361 0.2
362 0.2
363 0.19
364 0.19
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.19
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.1
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.02
395 0.02
396 0.02
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.1
405 0.2
406 0.21
407 0.21
408 0.21
409 0.23
410 0.22
411 0.22
412 0.22
413 0.12
414 0.12
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.18
419 0.18
420 0.17
421 0.21
422 0.22
423 0.22
424 0.22
425 0.23
426 0.22
427 0.26
428 0.28
429 0.24
430 0.22
431 0.24
432 0.23
433 0.24
434 0.27
435 0.24
436 0.24
437 0.28
438 0.3
439 0.29
440 0.32
441 0.38
442 0.37
443 0.38
444 0.35
445 0.31
446 0.28
447 0.27
448 0.25
449 0.17
450 0.23
451 0.23
452 0.24
453 0.24
454 0.25
455 0.25
456 0.25
457 0.26
458 0.17
459 0.2
460 0.18
461 0.2
462 0.21
463 0.2
464 0.19
465 0.18
466 0.17
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.11
471 0.12
472 0.12
473 0.11
474 0.15
475 0.15
476 0.14
477 0.17
478 0.18
479 0.19
480 0.22
481 0.22
482 0.22
483 0.23
484 0.27
485 0.24
486 0.28
487 0.27
488 0.24
489 0.24
490 0.22
491 0.23
492 0.2
493 0.2
494 0.15
495 0.15
496 0.15
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.15
501 0.22
502 0.26
503 0.26
504 0.27
505 0.32
506 0.34
507 0.38
508 0.44
509 0.4
510 0.41
511 0.47
512 0.49
513 0.5
514 0.5
515 0.46
516 0.4
517 0.4
518 0.36
519 0.32
520 0.31
521 0.27
522 0.29
523 0.34
524 0.36
525 0.36
526 0.36
527 0.33
528 0.3
529 0.28
530 0.25
531 0.18
532 0.13
533 0.1
534 0.12
535 0.14
536 0.15
537 0.19
538 0.18
539 0.21
540 0.22
541 0.22
542 0.21
543 0.25
544 0.3
545 0.3
546 0.36
547 0.35
548 0.34
549 0.33
550 0.32
551 0.26
552 0.2
553 0.18
554 0.11
555 0.11
556 0.12
557 0.13
558 0.17
559 0.21
560 0.2
561 0.23
562 0.32
563 0.35
564 0.35
565 0.39
566 0.36
567 0.39
568 0.45
569 0.44
570 0.39
571 0.35
572 0.36
573 0.35
574 0.33
575 0.26
576 0.21
577 0.19
578 0.14
579 0.12
580 0.1
581 0.06
582 0.06
583 0.09
584 0.08
585 0.11
586 0.13
587 0.14
588 0.16
589 0.18
590 0.23
591 0.25
592 0.29
593 0.33