Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H9A7

Protein Details
Accession C1H9A7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-46GMEFKPANKDKRKILHIKRKKVKDAQSRAERFARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-64KPANKDKRKILHIKRKKVKDAQSRAERFARKKEEAKDPKLKAERLRRN
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbl:PAAG_07348  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPSMKSKLLPSGGMEFKPANKDKRKILHIKRKKVKDAQSRAERFARKKEEAKDPKLKAERLRRNIPLTLERKRVWDDVDSDVEDGLGMSFDVERIKRHKMEEEAWREKIDEINATSGNEEKSGEGEEGDEHGDNHEVDSMIASDSDEDEDSEENDRIQKSNRTRKSKLPSATERATSPTQSTRSTNLDLAPDALAAKFPTLFTKELPPAPKILITTSINSTLHDQAQLLTDLFPNSVYIRRSAHKYAHKYSVREISKFASNRNFTALVVVEEDQKRVSGMTIVHLPVGPTFHFSVSNWVEGKKLPGHGNSTGHWPELILNNFRTPLGMLAAHLFRTLFPAQPELVGRQVVTLHNQRDYIFVRRHRYVFREKRETEKSVVGADGKEMKGVEGIRTGLQELGPRFTLKLRRVDKGIQRASGQEWEWKGGMEKQRTKFQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.33
4 0.41
5 0.44
6 0.46
7 0.51
8 0.57
9 0.63
10 0.71
11 0.77
12 0.78
13 0.82
14 0.84
15 0.85
16 0.9
17 0.91
18 0.92
19 0.92
20 0.9
21 0.9
22 0.89
23 0.89
24 0.89
25 0.89
26 0.85
27 0.81
28 0.79
29 0.77
30 0.72
31 0.72
32 0.7
33 0.66
34 0.69
35 0.7
36 0.73
37 0.75
38 0.78
39 0.78
40 0.73
41 0.76
42 0.76
43 0.74
44 0.72
45 0.73
46 0.75
47 0.73
48 0.78
49 0.75
50 0.72
51 0.7
52 0.66
53 0.65
54 0.62
55 0.61
56 0.6
57 0.55
58 0.54
59 0.54
60 0.51
61 0.44
62 0.41
63 0.36
64 0.33
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.25
69 0.22
70 0.17
71 0.14
72 0.09
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.08
79 0.09
80 0.13
81 0.17
82 0.24
83 0.28
84 0.31
85 0.37
86 0.39
87 0.45
88 0.51
89 0.57
90 0.57
91 0.55
92 0.52
93 0.47
94 0.42
95 0.38
96 0.3
97 0.24
98 0.18
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.17
105 0.14
106 0.13
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.1
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.24
146 0.32
147 0.42
148 0.51
149 0.57
150 0.6
151 0.68
152 0.73
153 0.74
154 0.7
155 0.68
156 0.66
157 0.65
158 0.64
159 0.56
160 0.48
161 0.44
162 0.39
163 0.31
164 0.26
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.25
170 0.27
171 0.28
172 0.27
173 0.24
174 0.22
175 0.2
176 0.19
177 0.15
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.24
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.21
198 0.17
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.14
227 0.16
228 0.21
229 0.24
230 0.3
231 0.35
232 0.42
233 0.44
234 0.52
235 0.54
236 0.5
237 0.51
238 0.53
239 0.48
240 0.42
241 0.39
242 0.31
243 0.34
244 0.34
245 0.34
246 0.32
247 0.31
248 0.31
249 0.33
250 0.31
251 0.24
252 0.25
253 0.21
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.13
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.19
282 0.19
283 0.23
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.2
288 0.24
289 0.19
290 0.22
291 0.22
292 0.24
293 0.28
294 0.31
295 0.33
296 0.3
297 0.35
298 0.32
299 0.28
300 0.25
301 0.21
302 0.19
303 0.22
304 0.25
305 0.21
306 0.21
307 0.22
308 0.23
309 0.23
310 0.21
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.09
322 0.14
323 0.15
324 0.14
325 0.15
326 0.17
327 0.17
328 0.19
329 0.21
330 0.18
331 0.19
332 0.17
333 0.16
334 0.14
335 0.16
336 0.15
337 0.2
338 0.25
339 0.26
340 0.27
341 0.29
342 0.28
343 0.31
344 0.33
345 0.35
346 0.36
347 0.41
348 0.46
349 0.5
350 0.54
351 0.55
352 0.59
353 0.62
354 0.65
355 0.68
356 0.71
357 0.68
358 0.73
359 0.75
360 0.72
361 0.65
362 0.6
363 0.51
364 0.43
365 0.42
366 0.34
367 0.27
368 0.26
369 0.27
370 0.22
371 0.22
372 0.2
373 0.18
374 0.2
375 0.2
376 0.19
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.18
381 0.18
382 0.16
383 0.16
384 0.2
385 0.19
386 0.21
387 0.21
388 0.22
389 0.22
390 0.27
391 0.35
392 0.35
393 0.44
394 0.45
395 0.49
396 0.54
397 0.62
398 0.65
399 0.67
400 0.68
401 0.62
402 0.58
403 0.55
404 0.53
405 0.5
406 0.43
407 0.39
408 0.35
409 0.35
410 0.33
411 0.31
412 0.3
413 0.32
414 0.39
415 0.42
416 0.49
417 0.52