FuNGI

C1H350

Protein Details

Accession

C1H350

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
271-293	KAEEKERKRKLKEQKAKEKQLAT	Basic
450-478	DGPSQPQPLHPPKRGRKPKQTATPPPPVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
242-289	SKRAPKASTSNKEAREAEKLAARVLRERDKAEEKERKRKLKEQKAKEK
461-468	PKRGRKPK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042530 EME1/EME2_C IPR006166 ERCC4_domain IPR033310 Mms4/EME1/EME2 IPR047521 XPF_nuclease_EME1_ascomycetes
Gene Ontology	GO:0048476 C:Holliday junction resolvase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0004518 F:nuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0051321 P:meiotic cell cycle
KEGG	pbl:PAAG_05193 -
Pfam	View protein in Pfam PF02732 ERCC4
CDD	cd20085 XPF_nuclease_Mms4

Amino Acid Sequences

MPEVISLLSSPEDGRSNKTEQPSTATFDRLSDHPPRASRIAILSDDSIFDWGNPTPAKKRRLSPELDPSPPNGPTPSPKTNHIDLEESIIFSPVPRLNSNKTVTANSSKWNGDISDPIEFTSPAVDSTTANRAENRASTSYDVITIDDSIVEFDEPSSPGGPWNALPLAPSSSNLSNRTASLLSRIQQSSSTEPSKFNQKGVSASTSKSISCTSKIRSPKPSQTLDFDDDESLSLTITTSKSKRAPKASTSNKEAREAEKLAARVLRERDKAEEKERKRKLKEQKAKEKQLATDLAEANKGKLNKKASTPEMIIDMSSTFEGSTVGNQVTEYMRHLGVEYHFVSTRMADIVTWRRKITAQYNEEAGHWEPCPLTIKKEDHVLCHLLAQQFVDMTVATTGNGTLESHVFEMKRSYPGCKLIYLIEGLTVWMRKNNNSKNRAYQASVLRDLDGPSQPQPLHPPKRGRKPKQTATPPPPVDDDTIEDALLQLQVQHECLIQHTGVPSESAEWIKNFTEHISTVPYRHEMINRHDASFCMDVGQVRTGEDNADTYVKMLQEIQRVTAPISYGITMQYPTVGELVRELKEQGPLLLENVKKCTNKSGTLSDGRIGPAISKRLHKVFTSLNPASTDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.28
3	0.33
4	0.38
5	0.44
6	0.46
7	0.42
8	0.47
9	0.45
10	0.46
11	0.44
12	0.41
13	0.35
14	0.32
15	0.33
16	0.28
17	0.31
18	0.32
19	0.34
20	0.37
21	0.4
22	0.44
23	0.44
24	0.43
25	0.4
26	0.37
27	0.36
28	0.32
29	0.31
30	0.27
31	0.24
32	0.24
33	0.21
34	0.18
35	0.14
36	0.12
37	0.12
38	0.11
39	0.16
40	0.17
41	0.21
42	0.29
43	0.37
44	0.45
45	0.49
46	0.57
47	0.62
48	0.68
49	0.7
50	0.7
51	0.73
52	0.73
53	0.71
54	0.65
55	0.58
56	0.54
57	0.49
58	0.42
59	0.33
60	0.28
61	0.31
62	0.38
63	0.43
64	0.42
65	0.47
66	0.51
67	0.54
68	0.56
69	0.51
70	0.47
71	0.39
72	0.42
73	0.36
74	0.31
75	0.26
76	0.21
77	0.18
78	0.14
79	0.19
80	0.15
81	0.18
82	0.2
83	0.25
84	0.31
85	0.39
86	0.42
87	0.42
88	0.42
89	0.41
90	0.44
91	0.46
92	0.42
93	0.38
94	0.4
95	0.35
96	0.33
97	0.31
98	0.27
99	0.21
100	0.24
101	0.22
102	0.21
103	0.21
104	0.21
105	0.2
106	0.19
107	0.17
108	0.15
109	0.13
110	0.09
111	0.1
112	0.1
113	0.09
114	0.13
115	0.19
116	0.19
117	0.2
118	0.21
119	0.21
120	0.23
121	0.25
122	0.27
123	0.23
124	0.23
125	0.24
126	0.25
127	0.23
128	0.22
129	0.2
130	0.16
131	0.14
132	0.12
133	0.1
134	0.08
135	0.08
136	0.06
137	0.07
138	0.06
139	0.05
140	0.05
141	0.07
142	0.08
143	0.09
144	0.1
145	0.09
146	0.1
147	0.11
148	0.12
149	0.1
150	0.13
151	0.12
152	0.11
153	0.12
154	0.12
155	0.15
156	0.14
157	0.15
158	0.15
159	0.19
160	0.23
161	0.25
162	0.26
163	0.24
164	0.24
165	0.26
166	0.23
167	0.19
168	0.2
169	0.21
170	0.2
171	0.25
172	0.25
173	0.23
174	0.24
175	0.27
176	0.27
177	0.3
178	0.31
179	0.27
180	0.28
181	0.3
182	0.38
183	0.36
184	0.33
185	0.31
186	0.29
187	0.3
188	0.31
189	0.35
190	0.26
191	0.25
192	0.27
193	0.24
194	0.22
195	0.21
196	0.21
197	0.18
198	0.2
199	0.24
200	0.25
201	0.31
202	0.39
203	0.44
204	0.5
205	0.56
206	0.61
207	0.64
208	0.65
209	0.61
210	0.58
211	0.57
212	0.51
213	0.45
214	0.37
215	0.3
216	0.24
217	0.22
218	0.17
219	0.11
220	0.08
221	0.06
222	0.05
223	0.07
224	0.07
225	0.12
226	0.12
227	0.17
228	0.24
229	0.31
230	0.38
231	0.44
232	0.48
233	0.51
234	0.61
235	0.66
236	0.67
237	0.67
238	0.67
239	0.61
240	0.6
241	0.55
242	0.46
243	0.41
244	0.36
245	0.3
246	0.26
247	0.25
248	0.21
249	0.21
250	0.2
251	0.19
252	0.22
253	0.27
254	0.26
255	0.27
256	0.31
257	0.36
258	0.39
259	0.44
260	0.49
261	0.49
262	0.58
263	0.65
264	0.69
265	0.68
266	0.73
267	0.75
268	0.76
269	0.8
270	0.8
271	0.83
272	0.84
273	0.87
274	0.83
275	0.75
276	0.64
277	0.59
278	0.51
279	0.41
280	0.35
281	0.29
282	0.24
283	0.23
284	0.22
285	0.18
286	0.18
287	0.18
288	0.15
289	0.2
290	0.24
291	0.24
292	0.29
293	0.33
294	0.33
295	0.35
296	0.34
297	0.29
298	0.26
299	0.23
300	0.19
301	0.14
302	0.11
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.04
307	0.04
308	0.05
309	0.04
310	0.05
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.13
326	0.13
327	0.12
328	0.13
329	0.13
330	0.13
331	0.11
332	0.12
333	0.08
334	0.07
335	0.05
336	0.09
337	0.18
338	0.23
339	0.25
340	0.25
341	0.25
342	0.27
343	0.31
344	0.36
345	0.37
346	0.34
347	0.34
348	0.37
349	0.36
350	0.35
351	0.33
352	0.25
353	0.17
354	0.14
355	0.13
356	0.11
357	0.11
358	0.16
359	0.14
360	0.17
361	0.22
362	0.24
363	0.24
364	0.32
365	0.32
366	0.29
367	0.32
368	0.31
369	0.24
370	0.24
371	0.26
372	0.19
373	0.18
374	0.16
375	0.12
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.06
392	0.07
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.12
397	0.13
398	0.18
399	0.18
400	0.21
401	0.23
402	0.29
403	0.3
404	0.28
405	0.27
406	0.23
407	0.23
408	0.21
409	0.17
410	0.11
411	0.1
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.11
417	0.13
418	0.18
419	0.28
420	0.37
421	0.46
422	0.51
423	0.56
424	0.6
425	0.65
426	0.63
427	0.55
428	0.52
429	0.5
430	0.49
431	0.48
432	0.4
433	0.35
434	0.33
435	0.31
436	0.28
437	0.22
438	0.19
439	0.17
440	0.21
441	0.2
442	0.2
443	0.28
444	0.35
445	0.42
446	0.47
447	0.56
448	0.61
449	0.73
450	0.82
451	0.83
452	0.85
453	0.87
454	0.89
455	0.89
456	0.9
457	0.9
458	0.86
459	0.87
460	0.77
461	0.69
462	0.62
463	0.53
464	0.45
465	0.35
466	0.31
467	0.25
468	0.24
469	0.21
470	0.18
471	0.16
472	0.14
473	0.13
474	0.09
475	0.06
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.09
480	0.1
481	0.1
482	0.12
483	0.13
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.13
488	0.12
489	0.13
490	0.11
491	0.1
492	0.13
493	0.13
494	0.14
495	0.13
496	0.16
497	0.16
498	0.17
499	0.16
500	0.15
501	0.16
502	0.15
503	0.16
504	0.2
505	0.2
506	0.21
507	0.24
508	0.24
509	0.23
510	0.26
511	0.3
512	0.29
513	0.35
514	0.44
515	0.43
516	0.42
517	0.41
518	0.38
519	0.38
520	0.34
521	0.26
522	0.17
523	0.16
524	0.16
525	0.18
526	0.2
527	0.16
528	0.15
529	0.16
530	0.15
531	0.15
532	0.14
533	0.13
534	0.12
535	0.13
536	0.12
537	0.12
538	0.14
539	0.13
540	0.13
541	0.16
542	0.18
543	0.24
544	0.25
545	0.26
546	0.27
547	0.27
548	0.28
549	0.26
550	0.22
551	0.17
552	0.17
553	0.15
554	0.13
555	0.14
556	0.14
557	0.13
558	0.12
559	0.12
560	0.1
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.1
565	0.14
566	0.18
567	0.18
568	0.18
569	0.2
570	0.2
571	0.24
572	0.24
573	0.21
574	0.2
575	0.2
576	0.21
577	0.26
578	0.27
579	0.26
580	0.3
581	0.36
582	0.35
583	0.37
584	0.44
585	0.43
586	0.47
587	0.5
588	0.51
589	0.52
590	0.57
591	0.57
592	0.5
593	0.46
594	0.41
595	0.36
596	0.29
597	0.26
598	0.25
599	0.29
600	0.31
601	0.35
602	0.4
603	0.45
604	0.49
605	0.46
606	0.46
607	0.48
608	0.52
609	0.55
610	0.5
611	0.47

C1H350

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer