Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GZW4

Protein Details
Accession C1GZW4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-103LSDRQSQATHRRRPQQVQDTHHydrophilic
271-291LSVQKRFRQQSQRRARQERFDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027786  Nse4/EID  
IPR014854  Nse4_C  
IPR029225  Nse4_Nse3-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG pbl:PAAG_04058  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15412  Nse4-Nse3_bdg  
PF08743  Nse4_C  
Amino Acid Sequences MPSLPTHRRSGSSPSPAAASAGSSDEMTPSPSTSFSSDKENRNSNSRSEKRKTTHLAPQSTQKPQVMADASNKRRKLSDNRGLSDRQSQATHRRRPQQVQDTHLYDPNQDPEERRAVRKGLRDLATNLNDSRAEYLKPGSNGIRTTLEKANEWFKSVKQTSDATIDSRLLVSAADLSYKRTAQTVLGDGDSGIDVDEFVSKCISYMRQGPRGEEPSFSSTQRRRRRVTGNDPVEEDSDDEGDALNWDWLGRRACFPNNLRPALSGFLLGPLSVQKRFRQQSQRRARQERFDPSLARKPQELEEKDIDKQETSNLTAMCTDIRELLVKTQSHSEALVNEELSQMGDDVSEDAVKEVMSKHPISDDGGVPLFRFCINPKSFGQTVENLFYVSFLIRDGSVGISMDSNELPTLLPSHPAAPSEAQAKKLQKHQTVFSLDYETWEDLIEIFNIEESLIPHREEGTTESADKRKVPGRRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.45
3 0.42
4 0.4
5 0.31
6 0.22
7 0.14
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.18
21 0.22
22 0.2
23 0.3
24 0.36
25 0.43
26 0.5
27 0.56
28 0.56
29 0.61
30 0.63
31 0.6
32 0.64
33 0.65
34 0.67
35 0.66
36 0.72
37 0.69
38 0.76
39 0.75
40 0.72
41 0.73
42 0.72
43 0.72
44 0.65
45 0.7
46 0.68
47 0.67
48 0.65
49 0.56
50 0.48
51 0.41
52 0.44
53 0.37
54 0.33
55 0.36
56 0.41
57 0.48
58 0.55
59 0.55
60 0.51
61 0.51
62 0.56
63 0.58
64 0.58
65 0.59
66 0.61
67 0.64
68 0.67
69 0.66
70 0.61
71 0.58
72 0.51
73 0.44
74 0.37
75 0.38
76 0.44
77 0.51
78 0.58
79 0.59
80 0.65
81 0.7
82 0.76
83 0.81
84 0.81
85 0.78
86 0.74
87 0.73
88 0.67
89 0.62
90 0.57
91 0.47
92 0.39
93 0.35
94 0.33
95 0.29
96 0.26
97 0.26
98 0.26
99 0.35
100 0.35
101 0.36
102 0.36
103 0.39
104 0.43
105 0.48
106 0.5
107 0.49
108 0.48
109 0.48
110 0.47
111 0.5
112 0.47
113 0.42
114 0.35
115 0.29
116 0.27
117 0.25
118 0.24
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.17
123 0.19
124 0.19
125 0.22
126 0.21
127 0.23
128 0.23
129 0.24
130 0.26
131 0.23
132 0.27
133 0.29
134 0.28
135 0.26
136 0.28
137 0.32
138 0.27
139 0.29
140 0.25
141 0.22
142 0.31
143 0.31
144 0.3
145 0.26
146 0.27
147 0.26
148 0.29
149 0.29
150 0.2
151 0.2
152 0.19
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.1
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.1
178 0.08
179 0.05
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.17
193 0.23
194 0.3
195 0.31
196 0.33
197 0.37
198 0.41
199 0.4
200 0.32
201 0.3
202 0.27
203 0.28
204 0.27
205 0.29
206 0.3
207 0.4
208 0.48
209 0.52
210 0.52
211 0.57
212 0.65
213 0.68
214 0.72
215 0.72
216 0.68
217 0.62
218 0.6
219 0.54
220 0.45
221 0.36
222 0.26
223 0.16
224 0.1
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.08
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.15
240 0.18
241 0.25
242 0.28
243 0.33
244 0.38
245 0.39
246 0.37
247 0.34
248 0.34
249 0.28
250 0.25
251 0.16
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.1
259 0.12
260 0.15
261 0.16
262 0.25
263 0.28
264 0.36
265 0.45
266 0.52
267 0.6
268 0.69
269 0.77
270 0.78
271 0.85
272 0.81
273 0.78
274 0.76
275 0.74
276 0.68
277 0.61
278 0.55
279 0.52
280 0.57
281 0.52
282 0.46
283 0.39
284 0.35
285 0.37
286 0.43
287 0.39
288 0.36
289 0.38
290 0.39
291 0.4
292 0.4
293 0.35
294 0.26
295 0.24
296 0.21
297 0.18
298 0.17
299 0.19
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.13
305 0.11
306 0.1
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.12
312 0.17
313 0.17
314 0.18
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.21
319 0.19
320 0.14
321 0.17
322 0.17
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.11
343 0.15
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.2
349 0.21
350 0.18
351 0.17
352 0.18
353 0.18
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.2
361 0.22
362 0.26
363 0.27
364 0.33
365 0.34
366 0.36
367 0.37
368 0.32
369 0.34
370 0.32
371 0.31
372 0.24
373 0.23
374 0.2
375 0.17
376 0.12
377 0.09
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.11
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.15
401 0.16
402 0.17
403 0.19
404 0.18
405 0.2
406 0.26
407 0.27
408 0.28
409 0.34
410 0.4
411 0.42
412 0.49
413 0.56
414 0.56
415 0.59
416 0.6
417 0.61
418 0.61
419 0.58
420 0.52
421 0.48
422 0.39
423 0.37
424 0.36
425 0.28
426 0.22
427 0.2
428 0.18
429 0.12
430 0.14
431 0.11
432 0.09
433 0.08
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.08
438 0.08
439 0.14
440 0.15
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.18
445 0.19
446 0.22
447 0.22
448 0.23
449 0.25
450 0.31
451 0.34
452 0.37
453 0.38
454 0.4
455 0.42