Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GTH6

Protein Details
Accession C1GTH6    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-30LTKLFSSSSKKSPDKKKHKSSASTSSDLHydrophilic
111-131SSKPSSRSQRIPESKNRRTHSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-19KKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001440  TPR_1  
IPR013105  TPR_2  
IPR019734  TPR_repeat  
KEGG pbl:PAAG_01821  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF00515  TPR_1  
PF13432  TPR_16  
PF07719  TPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MVLTKLFSSSSKKSPDKKKHKSSASTSSDLSDLQPHGSQHPPPLFPAAAPNRRPESPAGISPNTYHHHHHQHHPDPNHQRPLQSSSTSTTPSNNNNKSSSSPRVRSSLKFSSKPSSRSQRIPESKNRRTHSTLSGSPTKHKSRNSSSRFSYDRDSHPLNLPPDELHRLSAMAAAKDDTRSSMDIEQPDAGVVPAPSLSSVSTPMQQDSPASSPATQSNGIYSDTVERSPTPPPHSVLSSSPQPTLPAVDAEACKLSGNKFFKAGDYQKAIQEYTKAVEAQPSSSTYLSNRAAAYISAHRYLEALEDAKLADELEPGNQKIMHRLARIYTSLGRPVEALDIYSKIQPPVSAKDKGPSEAMLHHITQAEESLREDKGGSMTLYCLDQAVKGLGAGIQQPRKWRLMRVEAYLKMGSANALGDAQNIVMSILRDNNQDPDALFLRGRLFYVQGENEQAIKHFKLALSLDPDSSQAVKYLRMVQKLLRMKDEGNAAYKSRKYQQAIDIYSKALEIDPKNKNINSKLLQNRAQSYLNLNNYEKSIEDCTKALELDPLYVKAQRVRAKAYGGAGNWEEAVQDLKKISEANPGETGIQEEIRNAEFELKKSQRKDYYKILGVDKDATDQEIKKAYRKLAIQHHPDKNLDGDKGDTQFKEIGEAYEILSDPQKRASYDNGDDLIDPSDIFSRGGGASFAHMGGMGGMGGMGGMGGAGQNIHIDPNILFNMMNGGGFGRGGGRGGNPFESYHPHGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.78
3 0.82
4 0.87
5 0.9
6 0.91
7 0.92
8 0.92
9 0.89
10 0.89
11 0.85
12 0.78
13 0.68
14 0.59
15 0.5
16 0.41
17 0.34
18 0.28
19 0.22
20 0.21
21 0.22
22 0.22
23 0.25
24 0.29
25 0.31
26 0.34
27 0.39
28 0.37
29 0.36
30 0.4
31 0.36
32 0.32
33 0.39
34 0.41
35 0.44
36 0.45
37 0.5
38 0.51
39 0.51
40 0.53
41 0.47
42 0.45
43 0.41
44 0.45
45 0.45
46 0.42
47 0.43
48 0.41
49 0.44
50 0.4
51 0.38
52 0.36
53 0.38
54 0.46
55 0.5
56 0.58
57 0.63
58 0.68
59 0.74
60 0.74
61 0.76
62 0.75
63 0.79
64 0.8
65 0.71
66 0.64
67 0.59
68 0.61
69 0.56
70 0.49
71 0.42
72 0.37
73 0.38
74 0.38
75 0.35
76 0.32
77 0.33
78 0.39
79 0.47
80 0.49
81 0.5
82 0.49
83 0.51
84 0.52
85 0.54
86 0.54
87 0.53
88 0.53
89 0.52
90 0.57
91 0.59
92 0.58
93 0.59
94 0.59
95 0.58
96 0.58
97 0.59
98 0.62
99 0.63
100 0.64
101 0.65
102 0.65
103 0.63
104 0.66
105 0.69
106 0.7
107 0.73
108 0.76
109 0.78
110 0.78
111 0.8
112 0.81
113 0.78
114 0.75
115 0.71
116 0.69
117 0.66
118 0.63
119 0.59
120 0.57
121 0.6
122 0.54
123 0.56
124 0.59
125 0.59
126 0.57
127 0.58
128 0.61
129 0.64
130 0.73
131 0.73
132 0.73
133 0.69
134 0.71
135 0.68
136 0.62
137 0.59
138 0.54
139 0.52
140 0.5
141 0.49
142 0.44
143 0.46
144 0.49
145 0.44
146 0.39
147 0.35
148 0.29
149 0.3
150 0.32
151 0.28
152 0.23
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.21
157 0.19
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.15
163 0.15
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.17
169 0.2
170 0.21
171 0.22
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.15
176 0.12
177 0.09
178 0.07
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.09
187 0.1
188 0.14
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.18
196 0.16
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.21
202 0.18
203 0.16
204 0.15
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.15
215 0.21
216 0.25
217 0.26
218 0.28
219 0.3
220 0.31
221 0.32
222 0.32
223 0.29
224 0.29
225 0.3
226 0.29
227 0.28
228 0.25
229 0.25
230 0.23
231 0.21
232 0.18
233 0.12
234 0.1
235 0.12
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.17
244 0.2
245 0.2
246 0.22
247 0.23
248 0.24
249 0.31
250 0.33
251 0.3
252 0.32
253 0.33
254 0.32
255 0.34
256 0.32
257 0.25
258 0.23
259 0.19
260 0.15
261 0.15
262 0.13
263 0.12
264 0.15
265 0.15
266 0.14
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.13
273 0.19
274 0.18
275 0.19
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.15
280 0.17
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.13
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.07
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.15
307 0.19
308 0.21
309 0.2
310 0.21
311 0.21
312 0.22
313 0.23
314 0.21
315 0.19
316 0.17
317 0.2
318 0.19
319 0.18
320 0.16
321 0.16
322 0.15
323 0.12
324 0.11
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.13
334 0.18
335 0.22
336 0.23
337 0.23
338 0.28
339 0.28
340 0.28
341 0.26
342 0.21
343 0.18
344 0.16
345 0.19
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.12
353 0.09
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.08
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.08
380 0.11
381 0.14
382 0.15
383 0.19
384 0.22
385 0.26
386 0.27
387 0.29
388 0.31
389 0.38
390 0.39
391 0.41
392 0.44
393 0.4
394 0.43
395 0.38
396 0.32
397 0.22
398 0.19
399 0.14
400 0.08
401 0.07
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.07
415 0.08
416 0.09
417 0.1
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.11
422 0.13
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.13
434 0.13
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.12
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.14
447 0.15
448 0.16
449 0.19
450 0.19
451 0.19
452 0.18
453 0.18
454 0.16
455 0.15
456 0.13
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.21
462 0.24
463 0.26
464 0.27
465 0.27
466 0.35
467 0.4
468 0.4
469 0.34
470 0.32
471 0.31
472 0.32
473 0.35
474 0.28
475 0.25
476 0.25
477 0.23
478 0.26
479 0.27
480 0.28
481 0.29
482 0.34
483 0.33
484 0.37
485 0.43
486 0.47
487 0.49
488 0.5
489 0.45
490 0.39
491 0.36
492 0.3
493 0.23
494 0.15
495 0.16
496 0.15
497 0.22
498 0.26
499 0.31
500 0.36
501 0.37
502 0.42
503 0.4
504 0.46
505 0.4
506 0.45
507 0.48
508 0.51
509 0.56
510 0.54
511 0.54
512 0.49
513 0.48
514 0.39
515 0.37
516 0.37
517 0.35
518 0.35
519 0.33
520 0.3
521 0.29
522 0.29
523 0.23
524 0.19
525 0.2
526 0.18
527 0.19
528 0.18
529 0.19
530 0.2
531 0.2
532 0.17
533 0.15
534 0.13
535 0.15
536 0.16
537 0.16
538 0.16
539 0.18
540 0.19
541 0.2
542 0.27
543 0.31
544 0.32
545 0.35
546 0.37
547 0.37
548 0.39
549 0.38
550 0.34
551 0.28
552 0.29
553 0.24
554 0.22
555 0.19
556 0.16
557 0.13
558 0.09
559 0.12
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.09
564 0.11
565 0.12
566 0.13
567 0.19
568 0.21
569 0.23
570 0.25
571 0.25
572 0.24
573 0.23
574 0.24
575 0.16
576 0.16
577 0.13
578 0.12
579 0.13
580 0.13
581 0.14
582 0.12
583 0.19
584 0.19
585 0.21
586 0.3
587 0.35
588 0.42
589 0.45
590 0.53
591 0.55
592 0.6
593 0.64
594 0.64
595 0.66
596 0.66
597 0.67
598 0.62
599 0.55
600 0.51
601 0.48
602 0.39
603 0.33
604 0.26
605 0.23
606 0.22
607 0.21
608 0.22
609 0.27
610 0.28
611 0.31
612 0.36
613 0.38
614 0.4
615 0.43
616 0.47
617 0.5
618 0.58
619 0.62
620 0.67
621 0.7
622 0.68
623 0.66
624 0.6
625 0.55
626 0.5
627 0.42
628 0.33
629 0.29
630 0.28
631 0.3
632 0.33
633 0.27
634 0.26
635 0.27
636 0.25
637 0.26
638 0.23
639 0.21
640 0.19
641 0.19
642 0.17
643 0.17
644 0.17
645 0.14
646 0.18
647 0.19
648 0.17
649 0.22
650 0.25
651 0.23
652 0.26
653 0.32
654 0.36
655 0.38
656 0.43
657 0.38
658 0.37
659 0.36
660 0.34
661 0.29
662 0.21
663 0.16
664 0.12
665 0.13
666 0.13
667 0.12
668 0.11
669 0.11
670 0.11
671 0.12
672 0.11
673 0.09
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.09
678 0.08
679 0.08
680 0.07
681 0.07
682 0.05
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.02
688 0.02
689 0.02
690 0.02
691 0.02
692 0.02
693 0.02
694 0.03
695 0.03
696 0.04
697 0.05
698 0.06
699 0.06
700 0.08
701 0.08
702 0.13
703 0.14
704 0.13
705 0.13
706 0.12
707 0.16
708 0.15
709 0.14
710 0.1
711 0.1
712 0.09
713 0.09
714 0.1
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.09
719 0.11
720 0.15
721 0.18
722 0.21
723 0.21
724 0.22
725 0.24
726 0.3