FuNGI

W9IFE6

Protein Details

Accession

W9IFE6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
451-482	APVLSAKAAKKEKKRKSKETSDKKQKKGQSIP	Hydrophilic
521-541	ETKLAASKSKKQKTNRAGSPD	Hydrophilic
572-597	SASTPVTSSKKQKKVKEASVPAPRQS	Hydrophilic
621-654	QLPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKKETPV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
457-478	KAAKKEKKRKSKETSDKKQKKG
627-650	SQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKK

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPYKVHSLNKHIENTKKGLSAEAQFNRRPGNRAATIKKESSDPNNIFANNDGDDDDESGSGSDSDSSSDGPADFISKLTSATKPASATPRRRSKDDEIADSDAERNASKKSTSVKKTAPAKSKPQSSSDSSSEDESGDEKTKAKTNGTSPTKASESTSSSSESGSDSDSDEEDKKAPKPSTKKQDDSASISDSSSEDESEDEADAKAKPALNGKAAPTPDSSSEDSDSESEDEEQDAKPAAKPAAKPVAPEPGSSSSEEEDSDDEMVDESMHIEDREGQLALPNFIAPDFVLRKGDDGTNGRDVAEICNKANLEGKQFWYFTVPSNVPISVVQNLEIPMNQSQSTDKLFSHNGEDYGVSFESIAPKGNIQIMIPSDRPQYQPATKQIDQVMQVKKITQLGSTNSVAPVPKPAPRAQPTGLKARYQPIGVNEPMGSIGDDEDVEMGDAPVLSAKAAKKEKKRKSKETSDKKQKKGQSIPEPLSSRTTEAPTPDTRKNKRKLAASEDDAVAVAEQLQEETKLAASKSKKQKTNRAGSPDLGSEPASAAAKKYTPVLPPAIPTAGTPTPKSASTPVTSSKKQKKVKEASVPAPRQSVVPIPSIPHSSPPRSSPARAPASQLPASPSQGKEKRAKKRKDKDGKKTPSGKKETPVVPPVPVSSSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.7
3	0.71
4	0.69
5	0.65
6	0.62
7	0.57
8	0.5
9	0.45
10	0.43
11	0.41
12	0.45
13	0.47
14	0.49
15	0.47
16	0.5
17	0.54
18	0.53
19	0.52
20	0.47
21	0.48
22	0.5
23	0.57
24	0.61
25	0.62
26	0.65
27	0.64
28	0.59
29	0.55
30	0.53
31	0.52
32	0.54
33	0.48
34	0.46
35	0.47
36	0.46
37	0.42
38	0.38
39	0.34
40	0.24
41	0.23
42	0.19
43	0.15
44	0.16
45	0.16
46	0.15
47	0.11
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.08
52	0.08
53	0.08
54	0.07
55	0.09
56	0.09
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.1
66	0.11
67	0.1
68	0.12
69	0.14
70	0.16
71	0.18
72	0.2
73	0.22
74	0.22
75	0.27
76	0.35
77	0.42
78	0.5
79	0.56
80	0.64
81	0.66
82	0.7
83	0.72
84	0.71
85	0.72
86	0.69
87	0.66
88	0.61
89	0.59
90	0.55
91	0.48
92	0.4
93	0.31
94	0.25
95	0.19
96	0.15
97	0.14
98	0.16
99	0.15
100	0.18
101	0.26
102	0.35
103	0.41
104	0.47
105	0.5
106	0.57
107	0.66
108	0.7
109	0.71
110	0.68
111	0.73
112	0.73
113	0.77
114	0.71
115	0.67
116	0.64
117	0.6
118	0.59
119	0.52
120	0.48
121	0.4
122	0.38
123	0.34
124	0.28
125	0.23
126	0.17
127	0.17
128	0.16
129	0.16
130	0.16
131	0.18
132	0.24
133	0.26
134	0.28
135	0.3
136	0.33
137	0.42
138	0.46
139	0.47
140	0.43
141	0.45
142	0.43
143	0.39
144	0.36
145	0.3
146	0.28
147	0.26
148	0.27
149	0.24
150	0.23
151	0.22
152	0.2
153	0.17
154	0.14
155	0.13
156	0.12
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.13
161	0.14
162	0.14
163	0.16
164	0.18
165	0.2
166	0.27
167	0.3
168	0.35
169	0.43
170	0.52
171	0.6
172	0.66
173	0.68
174	0.66
175	0.71
176	0.68
177	0.65
178	0.57
179	0.49
180	0.41
181	0.36
182	0.31
183	0.23
184	0.2
185	0.14
186	0.11
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.08
193	0.07
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.18
201	0.2
202	0.22
203	0.24
204	0.25
205	0.28
206	0.27
207	0.27
208	0.23
209	0.23
210	0.21
211	0.23
212	0.23
213	0.2
214	0.21
215	0.2
216	0.19
217	0.18
218	0.17
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.12
231	0.14
232	0.16
233	0.16
234	0.22
235	0.3
236	0.29
237	0.3
238	0.29
239	0.36
240	0.34
241	0.33
242	0.31
243	0.27
244	0.28
245	0.28
246	0.27
247	0.18
248	0.18
249	0.18
250	0.15
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.08
255	0.07
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.08
269	0.08
270	0.11
271	0.11
272	0.12
273	0.09
274	0.09
275	0.07
276	0.07
277	0.08
278	0.04
279	0.08
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.15
289	0.17
290	0.18
291	0.19
292	0.18
293	0.17
294	0.17
295	0.16
296	0.19
297	0.17
298	0.14
299	0.16
300	0.16
301	0.16
302	0.2
303	0.18
304	0.18
305	0.19
306	0.21
307	0.22
308	0.22
309	0.22
310	0.2
311	0.19
312	0.16
313	0.19
314	0.17
315	0.16
316	0.17
317	0.16
318	0.14
319	0.14
320	0.14
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.09
325	0.1
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.1
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.11
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.15
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.14
345	0.14
346	0.11
347	0.12
348	0.11
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.08
361	0.1
362	0.1
363	0.13
364	0.13
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.18
369	0.18
370	0.22
371	0.23
372	0.28
373	0.33
374	0.39
375	0.38
376	0.41
377	0.4
378	0.38
379	0.37
380	0.39
381	0.35
382	0.29
383	0.29
384	0.26
385	0.26
386	0.26
387	0.24
388	0.18
389	0.17
390	0.18
391	0.22
392	0.22
393	0.21
394	0.18
395	0.19
396	0.17
397	0.15
398	0.17
399	0.14
400	0.17
401	0.2
402	0.23
403	0.31
404	0.34
405	0.4
406	0.37
407	0.43
408	0.43
409	0.49
410	0.47
411	0.41
412	0.39
413	0.38
414	0.37
415	0.3
416	0.29
417	0.23
418	0.26
419	0.24
420	0.24
421	0.2
422	0.18
423	0.17
424	0.15
425	0.11
426	0.06
427	0.06
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.04
441	0.04
442	0.07
443	0.08
444	0.16
445	0.24
446	0.32
447	0.42
448	0.53
449	0.63
450	0.71
451	0.8
452	0.83
453	0.85
454	0.9
455	0.9
456	0.91
457	0.92
458	0.92
459	0.92
460	0.89
461	0.87
462	0.82
463	0.81
464	0.78
465	0.77
466	0.76
467	0.75
468	0.72
469	0.72
470	0.68
471	0.59
472	0.54
473	0.45
474	0.37
475	0.3
476	0.29
477	0.23
478	0.23
479	0.26
480	0.29
481	0.34
482	0.39
483	0.47
484	0.54
485	0.62
486	0.68
487	0.72
488	0.72
489	0.75
490	0.74
491	0.73
492	0.72
493	0.66
494	0.61
495	0.53
496	0.46
497	0.38
498	0.3
499	0.21
500	0.12
501	0.08
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.09
511	0.09
512	0.16
513	0.2
514	0.29
515	0.4
516	0.48
517	0.55
518	0.62
519	0.73
520	0.76
521	0.83
522	0.81
523	0.79
524	0.74
525	0.68
526	0.63
527	0.54
528	0.45
529	0.36
530	0.28
531	0.2
532	0.17
533	0.16
534	0.14
535	0.12
536	0.12
537	0.13
538	0.13
539	0.14
540	0.17
541	0.19
542	0.2
543	0.24
544	0.28
545	0.27
546	0.28
547	0.3
548	0.28
549	0.24
550	0.21
551	0.24
552	0.24
553	0.26
554	0.25
555	0.25
556	0.26
557	0.27
558	0.29
559	0.27
560	0.27
561	0.27
562	0.3
563	0.35
564	0.4
565	0.46
566	0.54
567	0.6
568	0.65
569	0.71
570	0.76
571	0.78
572	0.81
573	0.85
574	0.85
575	0.83
576	0.83
577	0.85
578	0.81
579	0.73
580	0.66
581	0.56
582	0.46
583	0.4
584	0.37
585	0.29
586	0.28
587	0.26
588	0.26
589	0.29
590	0.33
591	0.31
592	0.33
593	0.37
594	0.39
595	0.41
596	0.43
597	0.48
598	0.49
599	0.52
600	0.51
601	0.54
602	0.57
603	0.54
604	0.56
605	0.55
606	0.56
607	0.54
608	0.48
609	0.42
610	0.38
611	0.42
612	0.41
613	0.37
614	0.4
615	0.44
616	0.5
617	0.55
618	0.61
619	0.68
620	0.73
621	0.82
622	0.82
623	0.87
624	0.91
625	0.93
626	0.94
627	0.94
628	0.95
629	0.94
630	0.94
631	0.93
632	0.92
633	0.91
634	0.9
635	0.84
636	0.79
637	0.78
638	0.74
639	0.71
640	0.69
641	0.61
642	0.55
643	0.51
644	0.47

W9IFE6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer