FuNGI

C1HA24

Protein Details

Accession

C1HA24

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
360-380	SSNQHDRRKDDHKKGFKGGKG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
340-393	GRLKPNAGRGRGGHHRGRGGSSNQHDRRKDDHKKGFKGGKGGRGGQRGGRGGGR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 14.833, cyto 7.5, cyto_pero 4.998

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR002344 Lupus_La IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
KEGG	pbl:PAAG_07753 -
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA PS50102 RRM
CDD	cd08029 LA_like_fungal cd12291 RRM1_La

Amino Acid Sequences

MAEEQKRATPPVDANPNAQSENDLKQVLQELKAQGPKETELKADVDVEMTAPEPSENNDAAGTNGKASEEGAGDDAEAKEEARIIAAAAKMGQDAEAKNENKDEQKGTGRNHRQSSRGGRGGIRQRVNYRDNIKSDVSTLKETNDPDEIRKQVEFYFSDSNLVMDKFLLSKVGGSENRPVELSLLHSFKRMRRFQPFSAVVDALKASKTLELTNDNTCVKRKIPLPEIVKESVDPTAVKVFEDRAMQRSIYAKGFGPEEPSTQFDIEAFFTPYGPTNAIRLRRTPEKIFKGSVFVEFDSEETQKAFLALDPKPKWKGTTELLIKSKKDYCDEKIKEIEAGRLKPNAGRGRGGHHRGRGGSSNQHDRRKDDHKKGFKGGKGGRGGQRGGRGGGRTELQKDARGVPVIQVSPTEKPPATNDDSTTKNGQKRAREDGDAAANGSGNSIGNGNAVSNGAGPAAESGAPPAKKVDVKES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.46
3	0.48
4	0.43
5	0.39
6	0.33
7	0.27
8	0.29
9	0.29
10	0.26
11	0.22
12	0.23
13	0.3
14	0.3
15	0.28
16	0.29
17	0.29
18	0.35
19	0.4
20	0.39
21	0.35
22	0.35
23	0.36
24	0.35
25	0.34
26	0.29
27	0.27
28	0.27
29	0.26
30	0.24
31	0.21
32	0.17
33	0.15
34	0.13
35	0.11
36	0.1
37	0.09
38	0.07
39	0.08
40	0.07
41	0.1
42	0.14
43	0.14
44	0.14
45	0.15
46	0.15
47	0.16
48	0.2
49	0.17
50	0.13
51	0.14
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.13
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.09
61	0.11
62	0.11
63	0.1
64	0.1
65	0.09
66	0.08
67	0.09
68	0.09
69	0.07
70	0.07
71	0.06
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.09
76	0.1
77	0.09
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.14
83	0.22
84	0.23
85	0.24
86	0.26
87	0.29
88	0.3
89	0.34
90	0.31
91	0.28
92	0.36
93	0.41
94	0.44
95	0.51
96	0.57
97	0.61
98	0.66
99	0.65
100	0.6
101	0.62
102	0.66
103	0.65
104	0.6
105	0.55
106	0.49
107	0.54
108	0.59
109	0.59
110	0.54
111	0.5
112	0.5
113	0.55
114	0.56
115	0.55
116	0.52
117	0.5
118	0.48
119	0.47
120	0.44
121	0.37
122	0.36
123	0.33
124	0.3
125	0.27
126	0.25
127	0.23
128	0.25
129	0.25
130	0.25
131	0.26
132	0.24
133	0.24
134	0.29
135	0.28
136	0.27
137	0.26
138	0.25
139	0.21
140	0.25
141	0.22
142	0.21
143	0.24
144	0.22
145	0.23
146	0.22
147	0.21
148	0.18
149	0.17
150	0.12
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.07
155	0.08
156	0.06
157	0.07
158	0.08
159	0.14
160	0.15
161	0.16
162	0.23
163	0.23
164	0.23
165	0.23
166	0.22
167	0.16
168	0.15
169	0.17
170	0.15
171	0.16
172	0.15
173	0.18
174	0.21
175	0.24
176	0.33
177	0.36
178	0.38
179	0.46
180	0.52
181	0.51
182	0.59
183	0.57
184	0.5
185	0.47
186	0.41
187	0.31
188	0.25
189	0.23
190	0.14
191	0.11
192	0.09
193	0.06
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.1
198	0.13
199	0.15
200	0.17
201	0.2
202	0.2
203	0.2
204	0.21
205	0.21
206	0.18
207	0.2
208	0.23
209	0.26
210	0.3
211	0.37
212	0.4
213	0.42
214	0.46
215	0.42
216	0.38
217	0.31
218	0.27
219	0.2
220	0.16
221	0.12
222	0.09
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.1
228	0.11
229	0.14
230	0.14
231	0.14
232	0.15
233	0.15
234	0.16
235	0.17
236	0.18
237	0.16
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.15
242	0.14
243	0.16
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.17
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.11
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.09
263	0.12
264	0.16
265	0.22
266	0.23
267	0.25
268	0.29
269	0.35
270	0.4
271	0.43
272	0.48
273	0.5
274	0.52
275	0.52
276	0.47
277	0.44
278	0.39
279	0.35
280	0.28
281	0.21
282	0.18
283	0.16
284	0.16
285	0.14
286	0.14
287	0.11
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.12
295	0.14
296	0.23
297	0.25
298	0.3
299	0.34
300	0.35
301	0.35
302	0.33
303	0.36
304	0.3
305	0.37
306	0.38
307	0.42
308	0.47
309	0.49
310	0.48
311	0.46
312	0.48
313	0.41
314	0.41
315	0.38
316	0.38
317	0.45
318	0.47
319	0.49
320	0.47
321	0.45
322	0.43
323	0.39
324	0.4
325	0.35
326	0.36
327	0.33
328	0.31
329	0.31
330	0.29
331	0.37
332	0.37
333	0.33
334	0.34
335	0.32
336	0.37
337	0.45
338	0.5
339	0.47
340	0.45
341	0.47
342	0.44
343	0.47
344	0.45
345	0.4
346	0.42
347	0.43
348	0.5
349	0.53
350	0.6
351	0.6
352	0.59
353	0.62
354	0.64
355	0.68
356	0.68
357	0.71
358	0.72
359	0.76
360	0.81
361	0.81
362	0.74
363	0.73
364	0.68
365	0.65
366	0.61
367	0.61
368	0.58
369	0.55
370	0.54
371	0.48
372	0.48
373	0.42
374	0.39
375	0.35
376	0.31
377	0.27
378	0.28
379	0.28
380	0.25
381	0.26
382	0.3
383	0.29
384	0.32
385	0.33
386	0.33
387	0.33
388	0.32
389	0.3
390	0.26
391	0.29
392	0.26
393	0.24
394	0.23
395	0.23
396	0.24
397	0.26
398	0.29
399	0.24
400	0.25
401	0.29
402	0.34
403	0.37
404	0.36
405	0.37
406	0.37
407	0.4
408	0.42
409	0.46
410	0.45
411	0.44
412	0.48
413	0.51
414	0.55
415	0.58
416	0.64
417	0.62
418	0.59
419	0.56
420	0.54
421	0.54
422	0.46
423	0.4
424	0.31
425	0.26
426	0.21
427	0.19
428	0.14
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.11
449	0.19
450	0.19
451	0.2
452	0.21
453	0.26
454	0.29

C1HA24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer