Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H9T5

Protein Details
Accession C1H9T5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-64QWMRVRQPRYKGSHKLERERPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045245  Pfs2-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
KEGG pbl:PAAG_07526  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MSSYDHDGVEGGFPRPLRSYEGGVGGPRRPRPVTDYGSSMVQWMRVRQPRYKGSHKLERERPSASYTVDMLPPLAGIDSPVDSIPVRHLHQSIGKSKKPITVVRWTPEGRRLLTGGHTGEFMLWNGTAFNFETVMDAHYDQYQAGVTSAAWSHSHDWLISGGQKGDIKYWRPNFNNVETVDDAHHDAVRDLSWCPSDTKFVSASDDTTLKIFDFTARQCEMVLTGHGWDAKSCDWHPTKGLLVSGSKDHQVKFWDPRTGRCLTTLHSHKNTVTCTRFSRVNNNLLATSSRDQSARVFDLRMMRDMCILRGHEKPISSMTWHPIHSSLISTGSEDGSIHHYLLDEQNLPAGQVPTVAPYDSADPANTPAQVIFPAHRIPYAHASTIWTLDWHPLGHILASGSKDNFTRFWSRARPGETSYLKDRFHIGEEAAEAQGTWSRNFGRRQMREEEEQELQDEAEGLVDQKKPDTSLLPGIQSGAGGENMGIPGLIPGIGAVQPPPPPPSGTPQSMHQVDPSRLAAMVSSGSFPLPQGDLPPNSRPPPYPIPGMHGGLPPHMDLATLQDQFFAQQQQHHNQTGAFQQNQNFQSSGIPGVQGLTSDQNEDSSNGVRKRGPLPSQQDSLMEEQRRGNWRNIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.23
4 0.25
5 0.26
6 0.3
7 0.31
8 0.35
9 0.34
10 0.36
11 0.38
12 0.37
13 0.4
14 0.4
15 0.43
16 0.41
17 0.42
18 0.45
19 0.5
20 0.51
21 0.48
22 0.48
23 0.44
24 0.44
25 0.41
26 0.36
27 0.28
28 0.27
29 0.25
30 0.25
31 0.33
32 0.38
33 0.44
34 0.48
35 0.57
36 0.61
37 0.67
38 0.72
39 0.73
40 0.75
41 0.8
42 0.82
43 0.83
44 0.83
45 0.83
46 0.78
47 0.72
48 0.65
49 0.59
50 0.53
51 0.44
52 0.37
53 0.31
54 0.29
55 0.26
56 0.24
57 0.19
58 0.16
59 0.14
60 0.11
61 0.09
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.14
72 0.18
73 0.19
74 0.22
75 0.23
76 0.25
77 0.31
78 0.38
79 0.42
80 0.46
81 0.48
82 0.5
83 0.52
84 0.54
85 0.54
86 0.54
87 0.51
88 0.53
89 0.56
90 0.55
91 0.59
92 0.56
93 0.54
94 0.54
95 0.53
96 0.44
97 0.4
98 0.36
99 0.3
100 0.31
101 0.32
102 0.27
103 0.22
104 0.21
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.14
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.11
139 0.13
140 0.15
141 0.16
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.15
150 0.17
151 0.17
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.33
156 0.4
157 0.46
158 0.47
159 0.54
160 0.54
161 0.54
162 0.56
163 0.47
164 0.45
165 0.36
166 0.35
167 0.28
168 0.24
169 0.21
170 0.16
171 0.16
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.14
182 0.14
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.22
189 0.2
190 0.2
191 0.18
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.12
201 0.12
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.18
207 0.17
208 0.14
209 0.13
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.13
219 0.13
220 0.2
221 0.21
222 0.23
223 0.24
224 0.24
225 0.25
226 0.23
227 0.23
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.17
234 0.18
235 0.17
236 0.18
237 0.21
238 0.24
239 0.29
240 0.33
241 0.38
242 0.36
243 0.4
244 0.43
245 0.41
246 0.37
247 0.33
248 0.29
249 0.23
250 0.31
251 0.34
252 0.36
253 0.36
254 0.37
255 0.36
256 0.38
257 0.38
258 0.36
259 0.33
260 0.29
261 0.3
262 0.31
263 0.35
264 0.33
265 0.4
266 0.38
267 0.41
268 0.39
269 0.37
270 0.34
271 0.3
272 0.29
273 0.23
274 0.19
275 0.15
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.15
285 0.21
286 0.21
287 0.23
288 0.2
289 0.18
290 0.21
291 0.21
292 0.2
293 0.16
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.15
305 0.17
306 0.19
307 0.19
308 0.18
309 0.17
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.09
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.14
365 0.19
366 0.2
367 0.19
368 0.17
369 0.19
370 0.19
371 0.19
372 0.17
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.11
387 0.1
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.13
392 0.15
393 0.19
394 0.2
395 0.26
396 0.31
397 0.34
398 0.38
399 0.41
400 0.41
401 0.38
402 0.46
403 0.42
404 0.4
405 0.42
406 0.43
407 0.39
408 0.37
409 0.36
410 0.29
411 0.29
412 0.26
413 0.2
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.13
418 0.12
419 0.09
420 0.07
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.11
425 0.14
426 0.2
427 0.23
428 0.31
429 0.38
430 0.42
431 0.47
432 0.52
433 0.54
434 0.54
435 0.54
436 0.5
437 0.42
438 0.37
439 0.33
440 0.26
441 0.21
442 0.15
443 0.13
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.09
449 0.11
450 0.11
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.15
455 0.16
456 0.16
457 0.22
458 0.23
459 0.23
460 0.23
461 0.22
462 0.21
463 0.18
464 0.16
465 0.09
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.03
478 0.03
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.06
483 0.09
484 0.11
485 0.13
486 0.16
487 0.16
488 0.18
489 0.2
490 0.27
491 0.31
492 0.33
493 0.34
494 0.35
495 0.42
496 0.41
497 0.4
498 0.37
499 0.37
500 0.34
501 0.35
502 0.33
503 0.25
504 0.23
505 0.23
506 0.18
507 0.12
508 0.13
509 0.09
510 0.09
511 0.08
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.13
519 0.18
520 0.22
521 0.26
522 0.32
523 0.36
524 0.39
525 0.41
526 0.39
527 0.41
528 0.46
529 0.45
530 0.46
531 0.41
532 0.45
533 0.47
534 0.46
535 0.41
536 0.36
537 0.33
538 0.28
539 0.28
540 0.22
541 0.18
542 0.16
543 0.13
544 0.1
545 0.15
546 0.2
547 0.2
548 0.2
549 0.2
550 0.2
551 0.21
552 0.23
553 0.2
554 0.16
555 0.21
556 0.28
557 0.36
558 0.43
559 0.44
560 0.43
561 0.39
562 0.4
563 0.42
564 0.42
565 0.38
566 0.35
567 0.38
568 0.45
569 0.46
570 0.46
571 0.38
572 0.31
573 0.3
574 0.27
575 0.25
576 0.18
577 0.16
578 0.13
579 0.14
580 0.13
581 0.12
582 0.12
583 0.14
584 0.14
585 0.16
586 0.16
587 0.17
588 0.18
589 0.19
590 0.19
591 0.2
592 0.27
593 0.28
594 0.31
595 0.32
596 0.36
597 0.41
598 0.48
599 0.49
600 0.51
601 0.57
602 0.6
603 0.61
604 0.58
605 0.54
606 0.48
607 0.47
608 0.46
609 0.4
610 0.36
611 0.36
612 0.42
613 0.49
614 0.49