Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDV1

Protein Details
Accession C1HDV1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-392HEIRRMRRDNLSKEERRRLMBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR002931  Transglutaminase-like  
Gene Ontology GO:0006950  P:response to stress  
KEGG pbl:PAAG_08944  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MTDRPHRSGARASRPPRPSASSSKAYDASQLTRQFEQLLRTRRLNSLQERSRSRTASPSPAPSHRLMHNYQSYSQRTHPQPQSSQQQEQQQPSQSPSQPPSYSLRSLPLVPAPPQDPTSFKFRNLLHVLSVTPTKYENPGLLDEALAVIPLDRLYAEAEEECQILQAEAASMGENVKPQWGYQDCVIKALLRWFKRSFFQFVNNPPCSICYSPTIAQGMTPPTPDETARGATRVELYRCSDPGCGANERFPRYSDVWALLQSRRGRVGEWANCFSMLCRAVGGRVRWVWNSEDYVWTEVYSEHQKRWIHVDACEEAWDNPRLYTEGWNRKMAYCIAFSIDGATDVTRRYVRNPVKHGMSRTRAPEEVLLWVIHEIRRMRRDNLSKEERRRLMKEDEREERELRGYMAQAIAMEINNLFPNEQLNTNTSNNGNSASSDETKIPVASRNGTVEWVNPTASQTGQPNPDRPNQGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.72
3 0.68
4 0.65
5 0.61
6 0.61
7 0.63
8 0.62
9 0.59
10 0.6
11 0.56
12 0.5
13 0.49
14 0.43
15 0.39
16 0.39
17 0.42
18 0.4
19 0.38
20 0.39
21 0.37
22 0.36
23 0.38
24 0.39
25 0.42
26 0.45
27 0.48
28 0.51
29 0.53
30 0.57
31 0.59
32 0.6
33 0.62
34 0.64
35 0.68
36 0.71
37 0.73
38 0.72
39 0.66
40 0.59
41 0.58
42 0.56
43 0.57
44 0.55
45 0.57
46 0.56
47 0.58
48 0.61
49 0.55
50 0.53
51 0.49
52 0.49
53 0.44
54 0.47
55 0.49
56 0.48
57 0.49
58 0.53
59 0.52
60 0.5
61 0.51
62 0.52
63 0.5
64 0.56
65 0.59
66 0.59
67 0.61
68 0.64
69 0.7
70 0.68
71 0.69
72 0.64
73 0.66
74 0.65
75 0.65
76 0.62
77 0.58
78 0.53
79 0.5
80 0.52
81 0.47
82 0.46
83 0.44
84 0.46
85 0.41
86 0.41
87 0.44
88 0.42
89 0.4
90 0.35
91 0.35
92 0.3
93 0.3
94 0.29
95 0.28
96 0.26
97 0.24
98 0.27
99 0.24
100 0.24
101 0.25
102 0.25
103 0.24
104 0.22
105 0.3
106 0.28
107 0.28
108 0.33
109 0.31
110 0.39
111 0.39
112 0.38
113 0.31
114 0.3
115 0.29
116 0.24
117 0.26
118 0.17
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.16
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.07
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.14
167 0.15
168 0.17
169 0.2
170 0.27
171 0.25
172 0.26
173 0.26
174 0.2
175 0.19
176 0.25
177 0.28
178 0.23
179 0.29
180 0.29
181 0.31
182 0.35
183 0.37
184 0.35
185 0.31
186 0.36
187 0.36
188 0.42
189 0.49
190 0.45
191 0.43
192 0.38
193 0.36
194 0.33
195 0.29
196 0.22
197 0.15
198 0.18
199 0.19
200 0.21
201 0.21
202 0.17
203 0.16
204 0.16
205 0.17
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.16
228 0.14
229 0.16
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.21
234 0.24
235 0.27
236 0.27
237 0.26
238 0.27
239 0.26
240 0.27
241 0.23
242 0.2
243 0.18
244 0.19
245 0.21
246 0.18
247 0.22
248 0.21
249 0.21
250 0.22
251 0.21
252 0.2
253 0.22
254 0.3
255 0.29
256 0.32
257 0.33
258 0.31
259 0.31
260 0.3
261 0.26
262 0.21
263 0.16
264 0.12
265 0.1
266 0.09
267 0.12
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.18
272 0.2
273 0.2
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.22
278 0.19
279 0.19
280 0.18
281 0.19
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.11
286 0.13
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.26
291 0.27
292 0.28
293 0.34
294 0.38
295 0.31
296 0.31
297 0.35
298 0.3
299 0.3
300 0.3
301 0.25
302 0.18
303 0.2
304 0.2
305 0.16
306 0.14
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.22
311 0.28
312 0.36
313 0.39
314 0.43
315 0.43
316 0.43
317 0.45
318 0.39
319 0.32
320 0.23
321 0.2
322 0.18
323 0.17
324 0.16
325 0.15
326 0.12
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.16
336 0.26
337 0.34
338 0.42
339 0.47
340 0.51
341 0.56
342 0.6
343 0.63
344 0.62
345 0.6
346 0.56
347 0.56
348 0.54
349 0.47
350 0.44
351 0.4
352 0.32
353 0.29
354 0.25
355 0.19
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.17
361 0.18
362 0.24
363 0.33
364 0.36
365 0.4
366 0.47
367 0.56
368 0.59
369 0.66
370 0.69
371 0.7
372 0.75
373 0.81
374 0.78
375 0.76
376 0.72
377 0.68
378 0.68
379 0.67
380 0.67
381 0.66
382 0.69
383 0.68
384 0.69
385 0.64
386 0.56
387 0.5
388 0.42
389 0.34
390 0.28
391 0.23
392 0.2
393 0.19
394 0.16
395 0.13
396 0.13
397 0.12
398 0.1
399 0.1
400 0.08
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.11
407 0.13
408 0.15
409 0.16
410 0.17
411 0.22
412 0.24
413 0.27
414 0.25
415 0.25
416 0.23
417 0.23
418 0.21
419 0.17
420 0.18
421 0.2
422 0.22
423 0.23
424 0.23
425 0.22
426 0.23
427 0.24
428 0.22
429 0.23
430 0.25
431 0.27
432 0.29
433 0.31
434 0.3
435 0.32
436 0.31
437 0.28
438 0.28
439 0.26
440 0.24
441 0.21
442 0.22
443 0.21
444 0.22
445 0.23
446 0.22
447 0.27
448 0.34
449 0.39
450 0.44
451 0.47
452 0.55