Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HCJ5

Protein Details
Accession C1HCJ5    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-165GDSPRSSGSHRTRSRRSRNCNSDDDMHydrophilic
232-283ADVLQRARSRHRSKSRRRAESLDRGRDHNREYRHRHRRHRSRSSPDSRVKTLBasic
357-381LIERARSKSRSRKGERSRSRIRQGLHydrophilic
397-426YEKHKEKKENESSQRHHRRRSRSRSVVPSSBasic
470-489ESSFRRRSRHRSVSRSHSRNHydrophilic
544-566REYTQRQERKKAEKDRRKYARDHBasic
798-818DRSLRFHSRPHHRPRTHTSYHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-276RARSRHRSKSRRRAESLDRGRDHNREYRHRHRRHRSRSSP
300-347ARKKSQRSEKAGNSHHGRRSRSRHRRGSESGSDNGRNPAHRNKRMAEA
356-378GLIERARSKSRSRKGERSRSRIR
400-418HKEKKENESSQRHHRRRSR
476-478RSR
552-561RKKAEKDRRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024436  DUF3824  
KEGG pbl:PAAG_08486  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12868  DUF3824  
Amino Acid Sequences MASSYRDSNWDEADRQSEQRYYSVKRYVIPSEQSSMYRRDGPATSERELTIRPHHDRDDRYNYEYRREKDYDQVYRASSHAPSHHESDYQLVSRPDPDERWALRSSRDPRDDDYYYSRSTREYDDGRHHYDEYEERYYAGDSPRSSGSHRTRSRRSRNCNSDDDMVYSRRGRCYRDESPRHYKRHLAEGALVGVGAAELVRHRSKKRDGEESSAFSRIGTDVGAGALGAVAADVLQRARSRHRSKSRRRAESLDRGRDHNREYRHRHRRHRSRSSPDSRVKTLAGLGLGAAAIAGAVALARKKSQRSEKAGNSHHGRRSRSRHRRGSESGSDNGRNPAHRNKRMAEAGLAGAAVAGLIERARSKSRSRKGERSRSRIRQGLPIAAASLGSAAIAGLYEKHKEKKENESSQRHHRRRSRSRSVVPSSAYSDPSGSAPQLIEYGDDPVYGSIPTNHYYGRPSSRQSSPRAIESSFRRRSRHRSVSRSHSRNRHHYRDDGSGSNSSFSDHDGGRNHRSGHHKERSRSRTRDLATAGLAAAGAGLAAREYTQRQERKKAEKDRRKYARDHDYTDSYEEGYDPVPRVPSPPPNGANYYPHSNHFPPPPGSTPVPPNHQGGPYNPADYPPSPGAPPMTQANYSYPPPPPPAADPYSPRSIKGEENVSAVPTPNPTLSHEQRHMSSEGIMATAPRHLLLPSTHPVSDTGAQSATSLGYSAFPFAPTPPPLATSPQPIPTSRNLFNSFSRPRSSSQPASIPAKSVQFDLRPHYARSPSTDRHARIPKGENQGYETDDSDSTMDGLDRSLRFHSRPHHRPRTHTSYHPHQSTASPASIPFPSAPSFPHTSATPQHRSDKTHTRVHNNNNLDVESDTTIELSDRFDARGHRLLGSWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.38
4 0.36
5 0.33
6 0.37
7 0.4
8 0.41
9 0.46
10 0.5
11 0.48
12 0.49
13 0.53
14 0.53
15 0.54
16 0.54
17 0.5
18 0.47
19 0.47
20 0.47
21 0.45
22 0.43
23 0.39
24 0.39
25 0.36
26 0.36
27 0.35
28 0.37
29 0.42
30 0.43
31 0.42
32 0.38
33 0.38
34 0.35
35 0.35
36 0.34
37 0.35
38 0.38
39 0.42
40 0.45
41 0.52
42 0.57
43 0.62
44 0.67
45 0.68
46 0.65
47 0.65
48 0.67
49 0.62
50 0.64
51 0.66
52 0.6
53 0.58
54 0.57
55 0.54
56 0.55
57 0.62
58 0.61
59 0.56
60 0.57
61 0.5
62 0.47
63 0.46
64 0.4
65 0.33
66 0.29
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.36
71 0.36
72 0.34
73 0.33
74 0.32
75 0.32
76 0.28
77 0.29
78 0.25
79 0.25
80 0.27
81 0.28
82 0.28
83 0.25
84 0.27
85 0.32
86 0.33
87 0.36
88 0.37
89 0.36
90 0.36
91 0.43
92 0.47
93 0.49
94 0.53
95 0.51
96 0.52
97 0.58
98 0.57
99 0.52
100 0.52
101 0.46
102 0.43
103 0.41
104 0.37
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.31
109 0.32
110 0.35
111 0.43
112 0.49
113 0.53
114 0.53
115 0.49
116 0.42
117 0.42
118 0.4
119 0.37
120 0.35
121 0.3
122 0.27
123 0.27
124 0.28
125 0.27
126 0.26
127 0.24
128 0.2
129 0.23
130 0.26
131 0.27
132 0.28
133 0.34
134 0.39
135 0.45
136 0.53
137 0.59
138 0.66
139 0.76
140 0.85
141 0.85
142 0.87
143 0.87
144 0.89
145 0.87
146 0.83
147 0.77
148 0.72
149 0.63
150 0.57
151 0.49
152 0.41
153 0.38
154 0.36
155 0.34
156 0.36
157 0.37
158 0.36
159 0.4
160 0.47
161 0.53
162 0.59
163 0.66
164 0.66
165 0.74
166 0.8
167 0.79
168 0.74
169 0.71
170 0.64
171 0.65
172 0.59
173 0.51
174 0.45
175 0.4
176 0.37
177 0.3
178 0.26
179 0.15
180 0.12
181 0.09
182 0.05
183 0.03
184 0.02
185 0.03
186 0.08
187 0.13
188 0.18
189 0.21
190 0.29
191 0.38
192 0.47
193 0.53
194 0.59
195 0.59
196 0.62
197 0.65
198 0.62
199 0.56
200 0.48
201 0.42
202 0.31
203 0.28
204 0.2
205 0.15
206 0.1
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.03
221 0.03
222 0.06
223 0.08
224 0.1
225 0.18
226 0.29
227 0.36
228 0.47
229 0.58
230 0.66
231 0.76
232 0.85
233 0.88
234 0.87
235 0.86
236 0.83
237 0.82
238 0.82
239 0.81
240 0.79
241 0.71
242 0.66
243 0.65
244 0.61
245 0.56
246 0.51
247 0.49
248 0.49
249 0.56
250 0.63
251 0.69
252 0.75
253 0.81
254 0.86
255 0.89
256 0.91
257 0.93
258 0.92
259 0.91
260 0.92
261 0.9
262 0.89
263 0.86
264 0.81
265 0.73
266 0.65
267 0.55
268 0.45
269 0.37
270 0.28
271 0.2
272 0.13
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.04
278 0.02
279 0.02
280 0.02
281 0.02
282 0.01
283 0.01
284 0.02
285 0.03
286 0.04
287 0.07
288 0.1
289 0.13
290 0.21
291 0.31
292 0.4
293 0.47
294 0.56
295 0.61
296 0.67
297 0.69
298 0.69
299 0.66
300 0.64
301 0.62
302 0.59
303 0.56
304 0.56
305 0.61
306 0.65
307 0.7
308 0.73
309 0.77
310 0.76
311 0.8
312 0.77
313 0.75
314 0.72
315 0.65
316 0.59
317 0.54
318 0.5
319 0.43
320 0.41
321 0.34
322 0.28
323 0.28
324 0.34
325 0.39
326 0.44
327 0.48
328 0.46
329 0.51
330 0.51
331 0.48
332 0.39
333 0.3
334 0.24
335 0.19
336 0.16
337 0.1
338 0.07
339 0.05
340 0.04
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.03
346 0.04
347 0.06
348 0.09
349 0.13
350 0.2
351 0.3
352 0.39
353 0.49
354 0.57
355 0.65
356 0.73
357 0.81
358 0.84
359 0.83
360 0.85
361 0.83
362 0.81
363 0.76
364 0.68
365 0.64
366 0.57
367 0.51
368 0.41
369 0.33
370 0.26
371 0.2
372 0.18
373 0.1
374 0.08
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.02
379 0.02
380 0.02
381 0.02
382 0.03
383 0.05
384 0.07
385 0.1
386 0.15
387 0.18
388 0.24
389 0.28
390 0.37
391 0.47
392 0.54
393 0.61
394 0.66
395 0.68
396 0.73
397 0.81
398 0.76
399 0.75
400 0.72
401 0.74
402 0.76
403 0.81
404 0.81
405 0.79
406 0.81
407 0.81
408 0.79
409 0.72
410 0.62
411 0.54
412 0.47
413 0.39
414 0.32
415 0.23
416 0.18
417 0.15
418 0.14
419 0.13
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.07
438 0.09
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.12
443 0.15
444 0.19
445 0.2
446 0.21
447 0.25
448 0.32
449 0.36
450 0.39
451 0.43
452 0.4
453 0.41
454 0.4
455 0.36
456 0.34
457 0.37
458 0.42
459 0.43
460 0.46
461 0.46
462 0.49
463 0.57
464 0.63
465 0.66
466 0.65
467 0.65
468 0.68
469 0.75
470 0.8
471 0.79
472 0.75
473 0.73
474 0.71
475 0.74
476 0.75
477 0.73
478 0.67
479 0.64
480 0.61
481 0.59
482 0.55
483 0.46
484 0.4
485 0.33
486 0.3
487 0.26
488 0.22
489 0.16
490 0.13
491 0.12
492 0.12
493 0.1
494 0.13
495 0.16
496 0.2
497 0.23
498 0.26
499 0.26
500 0.29
501 0.36
502 0.4
503 0.46
504 0.52
505 0.55
506 0.58
507 0.68
508 0.72
509 0.75
510 0.72
511 0.66
512 0.65
513 0.6
514 0.59
515 0.5
516 0.42
517 0.33
518 0.28
519 0.24
520 0.15
521 0.13
522 0.07
523 0.05
524 0.03
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.02
529 0.02
530 0.02
531 0.04
532 0.05
533 0.1
534 0.18
535 0.25
536 0.3
537 0.39
538 0.47
539 0.56
540 0.65
541 0.71
542 0.75
543 0.78
544 0.83
545 0.84
546 0.86
547 0.81
548 0.78
549 0.76
550 0.76
551 0.7
552 0.67
553 0.61
554 0.55
555 0.51
556 0.47
557 0.38
558 0.27
559 0.22
560 0.17
561 0.13
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.1
567 0.1
568 0.13
569 0.16
570 0.23
571 0.27
572 0.33
573 0.34
574 0.36
575 0.4
576 0.39
577 0.4
578 0.36
579 0.38
580 0.32
581 0.32
582 0.34
583 0.32
584 0.34
585 0.34
586 0.36
587 0.32
588 0.35
589 0.36
590 0.35
591 0.35
592 0.34
593 0.37
594 0.36
595 0.39
596 0.38
597 0.37
598 0.34
599 0.35
600 0.34
601 0.29
602 0.3
603 0.26
604 0.26
605 0.23
606 0.22
607 0.22
608 0.21
609 0.24
610 0.2
611 0.2
612 0.18
613 0.19
614 0.21
615 0.18
616 0.19
617 0.18
618 0.19
619 0.19
620 0.2
621 0.23
622 0.23
623 0.24
624 0.25
625 0.23
626 0.23
627 0.26
628 0.26
629 0.24
630 0.25
631 0.3
632 0.31
633 0.33
634 0.34
635 0.36
636 0.43
637 0.41
638 0.38
639 0.35
640 0.33
641 0.32
642 0.33
643 0.33
644 0.26
645 0.28
646 0.28
647 0.26
648 0.24
649 0.22
650 0.18
651 0.14
652 0.14
653 0.12
654 0.14
655 0.16
656 0.24
657 0.29
658 0.35
659 0.38
660 0.39
661 0.4
662 0.42
663 0.39
664 0.31
665 0.27
666 0.21
667 0.17
668 0.15
669 0.13
670 0.1
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.07
675 0.08
676 0.07
677 0.1
678 0.11
679 0.16
680 0.19
681 0.22
682 0.22
683 0.22
684 0.23
685 0.25
686 0.27
687 0.23
688 0.2
689 0.17
690 0.17
691 0.16
692 0.16
693 0.12
694 0.08
695 0.07
696 0.06
697 0.07
698 0.07
699 0.09
700 0.09
701 0.1
702 0.1
703 0.12
704 0.17
705 0.17
706 0.2
707 0.18
708 0.21
709 0.22
710 0.26
711 0.27
712 0.28
713 0.3
714 0.34
715 0.36
716 0.34
717 0.36
718 0.39
719 0.44
720 0.41
721 0.45
722 0.43
723 0.44
724 0.46
725 0.52
726 0.51
727 0.48
728 0.5
729 0.45
730 0.43
731 0.48
732 0.52
733 0.49
734 0.48
735 0.49
736 0.5
737 0.54
738 0.51
739 0.46
740 0.41
741 0.39
742 0.35
743 0.31
744 0.3
745 0.29
746 0.31
747 0.34
748 0.39
749 0.38
750 0.4
751 0.44
752 0.44
753 0.42
754 0.47
755 0.49
756 0.45
757 0.51
758 0.57
759 0.53
760 0.58
761 0.65
762 0.61
763 0.6
764 0.63
765 0.62
766 0.64
767 0.65
768 0.57
769 0.51
770 0.5
771 0.45
772 0.4
773 0.33
774 0.25
775 0.22
776 0.21
777 0.17
778 0.15
779 0.12
780 0.11
781 0.1
782 0.07
783 0.08
784 0.13
785 0.13
786 0.15
787 0.19
788 0.23
789 0.24
790 0.31
791 0.4
792 0.45
793 0.55
794 0.64
795 0.71
796 0.72
797 0.79
798 0.83
799 0.83
800 0.79
801 0.77
802 0.75
803 0.74
804 0.78
805 0.72
806 0.64
807 0.56
808 0.52
809 0.5
810 0.46
811 0.37
812 0.28
813 0.26
814 0.27
815 0.26
816 0.26
817 0.2
818 0.18
819 0.18
820 0.18
821 0.2
822 0.22
823 0.27
824 0.27
825 0.29
826 0.27
827 0.3
828 0.38
829 0.45
830 0.46
831 0.46
832 0.54
833 0.56
834 0.61
835 0.64
836 0.67
837 0.65
838 0.66
839 0.68
840 0.69
841 0.74
842 0.77
843 0.79
844 0.73
845 0.71
846 0.65
847 0.58
848 0.5
849 0.41
850 0.34
851 0.26
852 0.22
853 0.16
854 0.14
855 0.13
856 0.12
857 0.12
858 0.11
859 0.14
860 0.14
861 0.15
862 0.18
863 0.22
864 0.28
865 0.35
866 0.34
867 0.31