Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HCI5

Protein Details
Accession C1HCI5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
205-226QYQHQQRQKLQQQQRQQQQQQQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-386KSPPRGGPGSHRRKGSGRRR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 2, pero 2, plas 1, extr 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013258  Striatin_N  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
KEGG pbl:PAAG_08476  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08232  Striatin  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MAGNGGMGGVVDGAVNMSHQQGTEYTLQGVMRFLQTEWHRHERDRNAWEIERAEMKSRIGRLEGDARTSKRMHETLGKHVKMLEAALKKEREKVRSLTAGEPVNLEKDPKELAKENLKVLPTQQPKSRSTLVDAKNAVNPDVRQDSEREKSRMYLGKCSQEVAYHIIPGSHPPPDLLDQQELSEHGYQNHQMQRSSLEEAYAQQQYQHQQRQKLQQQQRQQQQQQQHNHVNMGREPSMHQTLPSNYSETPNLGRPQLNHASQAPVEGHSFPQQRSHSISMDHRKPPFDYSSIADEEVESITHTFNSYGKQIPITESPHPVMSKEPVSDDADGWNFDENPINELTPAGGQLHRPDTNAFPNANFIPPKSPPRGGPGSHRRKGSGRRRSEGNTDTRDLAALSGLSPDALNFKVRFALRGHLDVVRSVIFTGGGSPSEPEICTCGDDGTIKRWIIPASYGSFSSYNTSSNNDLDITSYFTHRGHIGPVTCLASCPPSPNFSSGGRVLGDGWIFSGGQDASVKVWERGRVDPKASLDTHTDSVWALCVLPGTVGSIFGDQCSHYGGVDRILLASGASDGRILIWAVSTPPQLASPQAGSRRGGGGSRRANSISSGSNFPSSPQPSTATAIPFHYTLIHHIIRPDSPSPTCISPLSLSGVSFVVSYADACIIIYDTRSGEEIVGMASLETYDGTRSTGVNSVIASTMGFDGTANLDPNRALAEEEAVVHGATGTSGGVEGVIISGYEDRYIRFFDANSGQCTYTMLAHPAAISSLSLSPDGRELVSAGHDASLRFWSLEKRNCTQEITSHRLMRGEGICSVVWSQDGRWVVSGGGDGVVKVFSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.05
3 0.05
4 0.07
5 0.08
6 0.08
7 0.1
8 0.1
9 0.15
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.2
14 0.2
15 0.19
16 0.2
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.2
22 0.24
23 0.32
24 0.38
25 0.46
26 0.48
27 0.52
28 0.61
29 0.62
30 0.68
31 0.66
32 0.64
33 0.62
34 0.61
35 0.6
36 0.52
37 0.47
38 0.43
39 0.39
40 0.38
41 0.34
42 0.34
43 0.35
44 0.37
45 0.35
46 0.32
47 0.31
48 0.31
49 0.38
50 0.36
51 0.37
52 0.41
53 0.41
54 0.44
55 0.43
56 0.42
57 0.41
58 0.4
59 0.39
60 0.41
61 0.43
62 0.49
63 0.58
64 0.55
65 0.48
66 0.47
67 0.44
68 0.35
69 0.33
70 0.3
71 0.25
72 0.28
73 0.35
74 0.39
75 0.39
76 0.47
77 0.51
78 0.48
79 0.49
80 0.5
81 0.51
82 0.54
83 0.56
84 0.51
85 0.5
86 0.48
87 0.42
88 0.39
89 0.32
90 0.28
91 0.24
92 0.22
93 0.17
94 0.16
95 0.19
96 0.19
97 0.23
98 0.25
99 0.31
100 0.39
101 0.42
102 0.43
103 0.45
104 0.44
105 0.39
106 0.38
107 0.42
108 0.4
109 0.42
110 0.45
111 0.47
112 0.48
113 0.54
114 0.56
115 0.48
116 0.47
117 0.51
118 0.49
119 0.5
120 0.5
121 0.45
122 0.44
123 0.43
124 0.38
125 0.32
126 0.28
127 0.26
128 0.28
129 0.27
130 0.25
131 0.27
132 0.33
133 0.38
134 0.45
135 0.42
136 0.39
137 0.4
138 0.46
139 0.49
140 0.45
141 0.47
142 0.45
143 0.5
144 0.49
145 0.49
146 0.42
147 0.36
148 0.36
149 0.31
150 0.26
151 0.19
152 0.19
153 0.18
154 0.17
155 0.2
156 0.19
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.17
161 0.2
162 0.23
163 0.23
164 0.23
165 0.22
166 0.22
167 0.23
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.17
172 0.15
173 0.18
174 0.19
175 0.25
176 0.3
177 0.29
178 0.26
179 0.26
180 0.29
181 0.29
182 0.31
183 0.25
184 0.2
185 0.18
186 0.19
187 0.23
188 0.21
189 0.18
190 0.15
191 0.18
192 0.24
193 0.32
194 0.39
195 0.41
196 0.47
197 0.54
198 0.63
199 0.68
200 0.73
201 0.74
202 0.73
203 0.78
204 0.8
205 0.82
206 0.82
207 0.8
208 0.76
209 0.76
210 0.77
211 0.75
212 0.74
213 0.72
214 0.63
215 0.6
216 0.56
217 0.5
218 0.43
219 0.39
220 0.31
221 0.25
222 0.25
223 0.26
224 0.28
225 0.25
226 0.23
227 0.22
228 0.24
229 0.27
230 0.27
231 0.24
232 0.2
233 0.23
234 0.23
235 0.21
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.23
240 0.24
241 0.23
242 0.3
243 0.34
244 0.33
245 0.31
246 0.3
247 0.3
248 0.28
249 0.29
250 0.22
251 0.16
252 0.17
253 0.15
254 0.15
255 0.19
256 0.22
257 0.21
258 0.27
259 0.27
260 0.29
261 0.33
262 0.35
263 0.3
264 0.31
265 0.39
266 0.41
267 0.47
268 0.5
269 0.47
270 0.45
271 0.45
272 0.46
273 0.41
274 0.33
275 0.28
276 0.25
277 0.27
278 0.26
279 0.24
280 0.2
281 0.17
282 0.15
283 0.13
284 0.11
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.15
298 0.17
299 0.2
300 0.23
301 0.23
302 0.24
303 0.24
304 0.25
305 0.25
306 0.22
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.16
311 0.16
312 0.17
313 0.19
314 0.19
315 0.17
316 0.17
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.12
321 0.1
322 0.09
323 0.13
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.1
337 0.14
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.18
342 0.22
343 0.24
344 0.22
345 0.18
346 0.2
347 0.2
348 0.21
349 0.19
350 0.15
351 0.16
352 0.19
353 0.24
354 0.25
355 0.26
356 0.25
357 0.31
358 0.35
359 0.33
360 0.39
361 0.45
362 0.51
363 0.54
364 0.54
365 0.5
366 0.51
367 0.6
368 0.61
369 0.6
370 0.57
371 0.56
372 0.6
373 0.6
374 0.61
375 0.56
376 0.53
377 0.46
378 0.41
379 0.38
380 0.33
381 0.3
382 0.23
383 0.17
384 0.1
385 0.06
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.06
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.12
398 0.12
399 0.15
400 0.14
401 0.18
402 0.17
403 0.19
404 0.2
405 0.18
406 0.18
407 0.16
408 0.16
409 0.11
410 0.1
411 0.08
412 0.07
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.11
433 0.15
434 0.14
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.14
441 0.12
442 0.13
443 0.13
444 0.13
445 0.14
446 0.14
447 0.15
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.14
455 0.12
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.11
468 0.13
469 0.13
470 0.13
471 0.14
472 0.15
473 0.14
474 0.13
475 0.12
476 0.12
477 0.11
478 0.14
479 0.13
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.2
484 0.18
485 0.21
486 0.19
487 0.19
488 0.17
489 0.16
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.08
494 0.08
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.07
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.13
508 0.15
509 0.18
510 0.24
511 0.29
512 0.3
513 0.32
514 0.33
515 0.33
516 0.35
517 0.33
518 0.29
519 0.26
520 0.25
521 0.24
522 0.21
523 0.19
524 0.14
525 0.14
526 0.12
527 0.09
528 0.06
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.06
543 0.07
544 0.09
545 0.08
546 0.07
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.04
566 0.04
567 0.05
568 0.06
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.1
574 0.1
575 0.11
576 0.11
577 0.12
578 0.17
579 0.21
580 0.23
581 0.23
582 0.24
583 0.25
584 0.23
585 0.24
586 0.22
587 0.27
588 0.31
589 0.33
590 0.34
591 0.33
592 0.33
593 0.31
594 0.31
595 0.26
596 0.22
597 0.23
598 0.21
599 0.23
600 0.22
601 0.22
602 0.27
603 0.25
604 0.25
605 0.24
606 0.26
607 0.26
608 0.29
609 0.3
610 0.24
611 0.23
612 0.23
613 0.22
614 0.19
615 0.17
616 0.16
617 0.14
618 0.15
619 0.2
620 0.2
621 0.19
622 0.21
623 0.22
624 0.22
625 0.26
626 0.25
627 0.23
628 0.22
629 0.23
630 0.25
631 0.24
632 0.25
633 0.21
634 0.21
635 0.18
636 0.18
637 0.21
638 0.18
639 0.17
640 0.16
641 0.15
642 0.13
643 0.12
644 0.1
645 0.07
646 0.06
647 0.07
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.05
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.08
664 0.07
665 0.07
666 0.06
667 0.05
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.1
679 0.14
680 0.14
681 0.15
682 0.14
683 0.14
684 0.14
685 0.14
686 0.12
687 0.08
688 0.08
689 0.07
690 0.07
691 0.06
692 0.06
693 0.08
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.12
699 0.13
700 0.13
701 0.11
702 0.1
703 0.08
704 0.1
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.1
709 0.1
710 0.09
711 0.08
712 0.06
713 0.05
714 0.05
715 0.04
716 0.03
717 0.04
718 0.04
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.03
724 0.03
725 0.04
726 0.05
727 0.06
728 0.08
729 0.09
730 0.09
731 0.11
732 0.14
733 0.15
734 0.16
735 0.16
736 0.2
737 0.28
738 0.31
739 0.32
740 0.33
741 0.31
742 0.29
743 0.31
744 0.26
745 0.21
746 0.19
747 0.18
748 0.16
749 0.16
750 0.16
751 0.15
752 0.14
753 0.11
754 0.09
755 0.09
756 0.1
757 0.11
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.14
762 0.16
763 0.14
764 0.12
765 0.11
766 0.11
767 0.13
768 0.13
769 0.11
770 0.12
771 0.13
772 0.13
773 0.14
774 0.15
775 0.14
776 0.14
777 0.15
778 0.22
779 0.3
780 0.39
781 0.43
782 0.46
783 0.52
784 0.55
785 0.57
786 0.51
787 0.5
788 0.51
789 0.52
790 0.54
791 0.52
792 0.5
793 0.48
794 0.46
795 0.45
796 0.39
797 0.34
798 0.28
799 0.26
800 0.24
801 0.24
802 0.24
803 0.17
804 0.16
805 0.14
806 0.14
807 0.17
808 0.19
809 0.19
810 0.19
811 0.19
812 0.18
813 0.18
814 0.18
815 0.13
816 0.12
817 0.11
818 0.09
819 0.09