FuNGI

C1H4R1

Protein Details

Accession

C1H4R1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
113-142	DEEKDKPVSKRRKKEIITPRKGRRRSGRTE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
116-140	KDKPVSKRRKKEIITPRKGRRRSGR

Subcellular Location(s)

nucl 26, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
KEGG	pbl:PAAG_05751 -
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MVSARSNSSYSSNFLTKQNNAHGSPLTRVGGQVVQRNIPQSTTVDSAARRNAPGNKKRAKFEPATDDEPLSSTDESEELSSHAGLSPSPEPRRRSYGWSAKVSARKSSQEAEDEEKDKPVSKRRKKEIITPRKGRRRSGRTESSPVGSPEERLRKTFLDPPGKDIFPLSSQPDRATKNPTVYGSNIHTAPKNMPPSRFKHPPSTFDDDDLVPRSSQASAKGPEFQTPLVISTDFTISSSITVPSHLGDILDDLSSSPLSSISSSISLHLSQEEKQHLDSATQMPKTTICPMCDQVVDPRFVDELQNLSGLNYRKKAQFCRNHTRKAAEREWVDRGYPTIDWENLHKRIEKHYAELDQILTCKKPSFYRNVLESARSGERRGNLRLTVHGDGVDKISTGYYGPWGAKKMMDAIIGHFALKFNSLAPTDTLIKAAGVSGFVQSVMVPELAVMLIKEDMSIGDTDARLILTDSMEIGNLLNEQPDDVIKRVVRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.4
3	0.4
4	0.45
5	0.51
6	0.52
7	0.49
8	0.5
9	0.49
10	0.45
11	0.43
12	0.41
13	0.34
14	0.27
15	0.26
16	0.25
17	0.26
18	0.27
19	0.31
20	0.29
21	0.31
22	0.33
23	0.36
24	0.34
25	0.3
26	0.28
27	0.23
28	0.24
29	0.23
30	0.23
31	0.23
32	0.25
33	0.29
34	0.33
35	0.34
36	0.31
37	0.34
38	0.42
39	0.49
40	0.56
41	0.61
42	0.64
43	0.67
44	0.71
45	0.72
46	0.71
47	0.67
48	0.66
49	0.65
50	0.62
51	0.61
52	0.58
53	0.51
54	0.43
55	0.38
56	0.32
57	0.25
58	0.18
59	0.14
60	0.12
61	0.12
62	0.12
63	0.12
64	0.11
65	0.09
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.1
70	0.09
71	0.09
72	0.12
73	0.16
74	0.23
75	0.3
76	0.37
77	0.4
78	0.45
79	0.52
80	0.51
81	0.55
82	0.57
83	0.6
84	0.62
85	0.63
86	0.62
87	0.61
88	0.65
89	0.59
90	0.56
91	0.5
92	0.46
93	0.44
94	0.44
95	0.41
96	0.39
97	0.4
98	0.4
99	0.4
100	0.39
101	0.36
102	0.34
103	0.31
104	0.32
105	0.33
106	0.36
107	0.43
108	0.51
109	0.6
110	0.68
111	0.77
112	0.75
113	0.81
114	0.82
115	0.82
116	0.83
117	0.82
118	0.84
119	0.83
120	0.85
121	0.84
122	0.83
123	0.81
124	0.8
125	0.79
126	0.79
127	0.75
128	0.77
129	0.71
130	0.63
131	0.56
132	0.48
133	0.43
134	0.33
135	0.28
136	0.29
137	0.36
138	0.34
139	0.33
140	0.35
141	0.32
142	0.35
143	0.4
144	0.41
145	0.43
146	0.42
147	0.46
148	0.48
149	0.46
150	0.42
151	0.36
152	0.29
153	0.2
154	0.23
155	0.22
156	0.2
157	0.21
158	0.23
159	0.28
160	0.29
161	0.3
162	0.34
163	0.32
164	0.33
165	0.35
166	0.35
167	0.32
168	0.29
169	0.31
170	0.26
171	0.26
172	0.23
173	0.21
174	0.2
175	0.19
176	0.21
177	0.23
178	0.29
179	0.3
180	0.34
181	0.38
182	0.42
183	0.48
184	0.54
185	0.51
186	0.53
187	0.54
188	0.55
189	0.56
190	0.6
191	0.52
192	0.45
193	0.44
194	0.34
195	0.32
196	0.29
197	0.22
198	0.14
199	0.13
200	0.13
201	0.12
202	0.13
203	0.14
204	0.15
205	0.17
206	0.18
207	0.23
208	0.22
209	0.24
210	0.24
211	0.21
212	0.18
213	0.16
214	0.16
215	0.12
216	0.12
217	0.09
218	0.08
219	0.09
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.15
259	0.16
260	0.16
261	0.16
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.17
266	0.18
267	0.21
268	0.2
269	0.2
270	0.18
271	0.19
272	0.2
273	0.25
274	0.23
275	0.2
276	0.22
277	0.23
278	0.25
279	0.24
280	0.23
281	0.24
282	0.23
283	0.23
284	0.2
285	0.2
286	0.18
287	0.18
288	0.18
289	0.12
290	0.11
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.13
296	0.15
297	0.18
298	0.18
299	0.21
300	0.25
301	0.3
302	0.38
303	0.44
304	0.51
305	0.57
306	0.66
307	0.71
308	0.74
309	0.73
310	0.72
311	0.69
312	0.68
313	0.63
314	0.59
315	0.54
316	0.5
317	0.51
318	0.45
319	0.38
320	0.3
321	0.27
322	0.22
323	0.19
324	0.18
325	0.15
326	0.15
327	0.16
328	0.21
329	0.27
330	0.29
331	0.31
332	0.32
333	0.32
334	0.37
335	0.46
336	0.42
337	0.38
338	0.4
339	0.4
340	0.37
341	0.37
342	0.31
343	0.23
344	0.23
345	0.2
346	0.16
347	0.15
348	0.15
349	0.16
350	0.21
351	0.25
352	0.32
353	0.37
354	0.43
355	0.46
356	0.5
357	0.49
358	0.45
359	0.41
360	0.37
361	0.37
362	0.31
363	0.29
364	0.26
365	0.3
366	0.33
367	0.37
368	0.36
369	0.33
370	0.34
371	0.37
372	0.39
373	0.35
374	0.31
375	0.28
376	0.25
377	0.23
378	0.23
379	0.18
380	0.13
381	0.11
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.11
388	0.13
389	0.15
390	0.17
391	0.18
392	0.19
393	0.19
394	0.21
395	0.21
396	0.22
397	0.19
398	0.19
399	0.24
400	0.23
401	0.22
402	0.19
403	0.17
404	0.15
405	0.16
406	0.13
407	0.09
408	0.13
409	0.13
410	0.14
411	0.15
412	0.19
413	0.21
414	0.21
415	0.21
416	0.17
417	0.16
418	0.15
419	0.14
420	0.1
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.11
447	0.11
448	0.11
449	0.12
450	0.12
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.09
455	0.09
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.08
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.1
468	0.13
469	0.16
470	0.16
471	0.23

C1H4R1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer