FuNGI

W9J0N1

Protein Details

Accession

W9J0N1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
98-121	AADERKARGRSRFRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-79	AGRFRPKNIRRD
93-119	KASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDA

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 6, cyto_nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MNRGRAAARGSRRGAAAASSRAAGESNAGSSTPAVADTPGSATPVPQRIAATSTRGGATTRATRAPAAGRFRPKNIRRDEAARDSLARQEEQKASERAADERKARGRSRFRSKRSRGDAMGRGGFGRVISGASGPFSSGAAGSGGRGSGGWFGGGGSGGGGFGGGGGKGFKSDSKPGFAQASRSREARINADKLHVHTPEEDLDSEDEAMIEALNSRAVSVLPMGIYRREHKDEGVIVATTAELEAAENAQAIPPTPSKEEESLWVDGEADESLLTDESAEDGGIWKNNSKTPVIKKEPGLDDSMDLDIEAKADAGDKDKQASETPAPQTKKPKQDPEEAMIQTDLEILANELGAVEISEGEDGKTEGPSNKDGRMYLFQFPPVLPPLKPITQPSSINKVKPEPGEGEDNVLESTPAAADTEPVDLTNDKNTTGFNVPGFEDPEQKAGFMSSLLSTGGMVGQLKVRKSGRVELDWGGSTMELNPATGMNFLTTAVIIEENDEKPRPGVIGGESIGMGKIMGRFVLAPKWDDEEDWEVSSEDLRIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.37
3	0.34
4	0.29
5	0.27
6	0.25
7	0.24
8	0.23
9	0.22
10	0.17
11	0.15
12	0.12
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.11
18	0.12
19	0.1
20	0.09
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.09
25	0.12
26	0.11
27	0.13
28	0.12
29	0.14
30	0.2
31	0.25
32	0.25
33	0.25
34	0.25
35	0.25
36	0.28
37	0.29
38	0.28
39	0.24
40	0.25
41	0.23
42	0.23
43	0.22
44	0.21
45	0.24
46	0.25
47	0.27
48	0.28
49	0.29
50	0.29
51	0.32
52	0.36
53	0.37
54	0.39
55	0.42
56	0.5
57	0.52
58	0.59
59	0.67
60	0.68
61	0.7
62	0.71
63	0.7
64	0.66
65	0.68
66	0.69
67	0.67
68	0.64
69	0.57
70	0.51
71	0.45
72	0.44
73	0.4
74	0.33
75	0.27
76	0.29
77	0.31
78	0.32
79	0.37
80	0.34
81	0.32
82	0.35
83	0.34
84	0.33
85	0.35
86	0.38
87	0.35
88	0.42
89	0.47
90	0.51
91	0.54
92	0.59
93	0.63
94	0.66
95	0.74
96	0.77
97	0.79
98	0.83
99	0.86
100	0.87
101	0.85
102	0.83
103	0.77
104	0.75
105	0.73
106	0.68
107	0.62
108	0.51
109	0.43
110	0.36
111	0.3
112	0.21
113	0.15
114	0.09
115	0.07
116	0.06
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.06
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.03
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.02
149	0.02
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.04
156	0.05
157	0.07
158	0.11
159	0.19
160	0.21
161	0.25
162	0.26
163	0.28
164	0.33
165	0.31
166	0.35
167	0.34
168	0.38
169	0.36
170	0.36
171	0.36
172	0.35
173	0.36
174	0.36
175	0.36
176	0.35
177	0.33
178	0.36
179	0.36
180	0.35
181	0.37
182	0.3
183	0.25
184	0.22
185	0.22
186	0.2
187	0.2
188	0.17
189	0.14
190	0.14
191	0.13
192	0.12
193	0.1
194	0.08
195	0.06
196	0.06
197	0.04
198	0.04
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.05
210	0.06
211	0.07
212	0.09
213	0.11
214	0.14
215	0.19
216	0.22
217	0.23
218	0.23
219	0.25
220	0.24
221	0.23
222	0.21
223	0.16
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.07
228	0.06
229	0.04
230	0.02
231	0.02
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.06
241	0.07
242	0.09
243	0.1
244	0.12
245	0.14
246	0.16
247	0.16
248	0.17
249	0.2
250	0.19
251	0.17
252	0.16
253	0.14
254	0.12
255	0.12
256	0.08
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.05
271	0.06
272	0.07
273	0.08
274	0.1
275	0.12
276	0.14
277	0.15
278	0.2
279	0.26
280	0.36
281	0.4
282	0.43
283	0.43
284	0.47
285	0.48
286	0.44
287	0.38
288	0.29
289	0.23
290	0.21
291	0.19
292	0.12
293	0.1
294	0.08
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.05
302	0.08
303	0.1
304	0.1
305	0.12
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.18
310	0.17
311	0.21
312	0.25
313	0.3
314	0.32
315	0.35
316	0.44
317	0.48
318	0.56
319	0.58
320	0.63
321	0.61
322	0.68
323	0.69
324	0.62
325	0.63
326	0.52
327	0.45
328	0.35
329	0.3
330	0.21
331	0.16
332	0.13
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.02
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.1
355	0.12
356	0.17
357	0.19
358	0.22
359	0.23
360	0.23
361	0.25
362	0.29
363	0.29
364	0.29
365	0.28
366	0.27
367	0.26
368	0.26
369	0.25
370	0.23
371	0.22
372	0.17
373	0.19
374	0.23
375	0.25
376	0.27
377	0.28
378	0.3
379	0.33
380	0.37
381	0.38
382	0.43
383	0.44
384	0.44
385	0.44
386	0.43
387	0.43
388	0.4
389	0.39
390	0.33
391	0.32
392	0.35
393	0.32
394	0.31
395	0.26
396	0.25
397	0.21
398	0.17
399	0.14
400	0.09
401	0.09
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.06
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.11
414	0.16
415	0.16
416	0.15
417	0.15
418	0.15
419	0.18
420	0.2
421	0.21
422	0.16
423	0.17
424	0.18
425	0.2
426	0.23
427	0.2
428	0.22
429	0.21
430	0.25
431	0.23
432	0.22
433	0.2
434	0.17
435	0.16
436	0.11
437	0.12
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.12
449	0.15
450	0.16
451	0.23
452	0.24
453	0.28
454	0.32
455	0.39
456	0.41
457	0.42
458	0.45
459	0.41
460	0.43
461	0.39
462	0.35
463	0.27
464	0.2
465	0.17
466	0.13
467	0.15
468	0.11
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.09
485	0.13
486	0.14
487	0.18
488	0.19
489	0.19
490	0.19
491	0.21
492	0.19
493	0.16
494	0.17
495	0.15
496	0.19
497	0.18
498	0.19
499	0.18
500	0.17
501	0.16
502	0.13
503	0.11
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.1
510	0.13
511	0.19
512	0.2
513	0.2
514	0.22
515	0.27
516	0.27
517	0.26
518	0.29
519	0.28
520	0.28
521	0.27
522	0.26
523	0.21
524	0.21
525	0.21

W9J0N1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer