Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HBH7

Protein Details
Accession C1HBH7    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-328TLARLGKGHKHKPKWQTKNKNKHNDSKNVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-260RKAREAA
262-262K
304-318GKGHKHKPKWQTKNK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG pbl:PAAG_08118  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MATSIPGRSKRAGEDFARAHHIEVDSDSVGPSSLKKPRFDLRNPSALAPDDLEEDAVLDADEIGHRGQRVRRNAVNIEGYDSDSENEGFDARAESRARAEKRHSAGDPDDMFAELEDDFSSYKGDDATTTGTKKQVRFLRDDEIEGQVDDSHAGGTVSIDLDTVGKGKEAERDEDEESESEVDEQERAAIAPDMDKELGAGGKKTHVPLLDAFNMRAEQEEGRFDEAGNYVRKAVDPDDIHDTWLEGVSKKDMRKAREAAEKREEERRRVQLEQDSLLTADILGTLIKTMERGETILETLARLGKGHKHKPKWQTKNKNKHNDSKNVEQDERMGEDPAEVARKSAIEDITGAADVLLSRGQTEIYDAERELLMRLYKRETGEDWVDPNPTMESKRESSVGEMDTPPLWEYRWSDSRDGGEPHGPYEASMMQSWNAAGYFGEGVEFRKVGSVDSWTSVADFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.49
4 0.53
5 0.46
6 0.4
7 0.37
8 0.34
9 0.27
10 0.25
11 0.25
12 0.19
13 0.19
14 0.18
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.14
19 0.18
20 0.25
21 0.3
22 0.33
23 0.39
24 0.47
25 0.56
26 0.61
27 0.65
28 0.64
29 0.68
30 0.67
31 0.62
32 0.57
33 0.49
34 0.43
35 0.33
36 0.27
37 0.2
38 0.18
39 0.16
40 0.13
41 0.11
42 0.1
43 0.08
44 0.07
45 0.05
46 0.04
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.08
52 0.09
53 0.14
54 0.21
55 0.29
56 0.37
57 0.44
58 0.49
59 0.54
60 0.56
61 0.57
62 0.56
63 0.49
64 0.44
65 0.37
66 0.34
67 0.28
68 0.25
69 0.2
70 0.15
71 0.15
72 0.11
73 0.1
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.1
78 0.09
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.21
83 0.3
84 0.32
85 0.36
86 0.41
87 0.45
88 0.48
89 0.54
90 0.49
91 0.46
92 0.46
93 0.48
94 0.42
95 0.34
96 0.3
97 0.24
98 0.23
99 0.17
100 0.16
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.12
115 0.15
116 0.17
117 0.19
118 0.24
119 0.28
120 0.29
121 0.35
122 0.37
123 0.37
124 0.41
125 0.43
126 0.45
127 0.42
128 0.43
129 0.37
130 0.34
131 0.3
132 0.25
133 0.22
134 0.13
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.13
156 0.15
157 0.18
158 0.19
159 0.23
160 0.24
161 0.24
162 0.25
163 0.19
164 0.17
165 0.14
166 0.12
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.06
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.14
196 0.18
197 0.21
198 0.21
199 0.2
200 0.19
201 0.19
202 0.17
203 0.15
204 0.12
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.14
223 0.13
224 0.15
225 0.21
226 0.21
227 0.21
228 0.2
229 0.18
230 0.13
231 0.14
232 0.12
233 0.07
234 0.07
235 0.1
236 0.14
237 0.15
238 0.21
239 0.25
240 0.28
241 0.34
242 0.37
243 0.4
244 0.46
245 0.5
246 0.5
247 0.54
248 0.53
249 0.48
250 0.54
251 0.52
252 0.46
253 0.5
254 0.5
255 0.46
256 0.45
257 0.47
258 0.43
259 0.43
260 0.39
261 0.32
262 0.25
263 0.21
264 0.19
265 0.15
266 0.09
267 0.06
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.16
292 0.25
293 0.35
294 0.44
295 0.5
296 0.58
297 0.69
298 0.78
299 0.82
300 0.84
301 0.86
302 0.87
303 0.91
304 0.93
305 0.94
306 0.9
307 0.89
308 0.86
309 0.85
310 0.8
311 0.78
312 0.76
313 0.71
314 0.65
315 0.56
316 0.49
317 0.42
318 0.38
319 0.29
320 0.21
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.14
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.15
332 0.14
333 0.11
334 0.12
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.09
351 0.1
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.18
362 0.21
363 0.25
364 0.27
365 0.29
366 0.29
367 0.31
368 0.33
369 0.33
370 0.32
371 0.3
372 0.3
373 0.27
374 0.26
375 0.21
376 0.19
377 0.19
378 0.19
379 0.23
380 0.24
381 0.26
382 0.28
383 0.26
384 0.27
385 0.3
386 0.29
387 0.27
388 0.25
389 0.24
390 0.23
391 0.23
392 0.2
393 0.16
394 0.15
395 0.15
396 0.18
397 0.24
398 0.31
399 0.34
400 0.36
401 0.39
402 0.42
403 0.43
404 0.43
405 0.39
406 0.37
407 0.33
408 0.32
409 0.31
410 0.27
411 0.22
412 0.22
413 0.21
414 0.17
415 0.18
416 0.18
417 0.16
418 0.17
419 0.17
420 0.14
421 0.12
422 0.1
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.11
430 0.14
431 0.14
432 0.12
433 0.16
434 0.16
435 0.16
436 0.18
437 0.21
438 0.2
439 0.23
440 0.24
441 0.2