FuNGI

C1HAL2

Protein Details

Accession

C1HAL2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
128-155	FYDGEKRQRGGRKKRKKNREEETNLQNW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
133-146	KRQRGGRKKRKKNR

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13.333, cyto 5.5, cyto_mito 4.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000467 G_patch_dom IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR040052 RBM17
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome
KEGG	pbl:PAAG_07666 -
Pfam	View protein in Pfam PF01585 G-patch
PROSITE	View protein in PROSITE PS50174 G_PATCH

Amino Acid Sequences

MASHPPPEGGLMSLYANLLDPSSDSSFAPGTISRAPVVFKQAGETEAQQNDAASKKQQISSASLRFQPTKRPQLASQKAKPKSGVPKAPVIGSATGTSPVVGTLAKPVAKTTLADWATTADDDDVNGFYDGEKRQRGGRKKRKKNREEETNLQNWDDIYDPSRPNIYEAYRHSEEKIREVREWKDRLYAHRMARTSSDMDSDEDYSRSPRNQRRFVPPGLNFAPPPNLNEPRPAQQDSEGSSESAPAPSAPIPDDATGEDAYARRLRLSQNIYPTPDTNPTNIPSPSVPLPSSYQPTPPPVTPSGQNFYSATISRAPVRYTLPPAPEEIPATEAELEATFAEEEDSKQEADGEAPRSLRPGQKGFAERLLTKYGWTKGSGLGASGEGIVKPLQVKLEKQKKKPDSEGGGFATPAGRAKIIGGKQKASDDGKFGRMSEVVVLHGMVDGMDLDAELEGGEGGGLMQEIGDECAEKYGRVERVFIDRNATGTIPVFVKFTSQLSALRAVNALEGRIFNGNTITARFFDVERYLHHYTSSDLAILNHSQSLLNWPPPRTSHLPLSPPSPPRSYLHLSFSTSALLSTPLKVSPFKFLQRAHIPYIGMRTSSTFAHAVPDRIAASQGKLLF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.11
3	0.1
4	0.09
5	0.08
6	0.07
7	0.07
8	0.12
9	0.14
10	0.15
11	0.15
12	0.17
13	0.17
14	0.17
15	0.19
16	0.15
17	0.16
18	0.18
19	0.2
20	0.19
21	0.19
22	0.21
23	0.22
24	0.28
25	0.27
26	0.24
27	0.25
28	0.26
29	0.26
30	0.27
31	0.28
32	0.27
33	0.25
34	0.27
35	0.23
36	0.22
37	0.24
38	0.24
39	0.23
40	0.2
41	0.25
42	0.28
43	0.31
44	0.35
45	0.35
46	0.39
47	0.46
48	0.49
49	0.47
50	0.47
51	0.48
52	0.51
53	0.5
54	0.53
55	0.54
56	0.58
57	0.6
58	0.6
59	0.63
60	0.69
61	0.77
62	0.77
63	0.76
64	0.75
65	0.75
66	0.74
67	0.68
68	0.65
69	0.65
70	0.65
71	0.65
72	0.58
73	0.62
74	0.59
75	0.57
76	0.51
77	0.43
78	0.34
79	0.27
80	0.24
81	0.17
82	0.16
83	0.15
84	0.13
85	0.1
86	0.09
87	0.08
88	0.07
89	0.06
90	0.1
91	0.14
92	0.15
93	0.15
94	0.16
95	0.18
96	0.19
97	0.19
98	0.16
99	0.22
100	0.21
101	0.21
102	0.2
103	0.19
104	0.2
105	0.19
106	0.18
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.1
111	0.08
112	0.09
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.12
117	0.15
118	0.2
119	0.22
120	0.22
121	0.29
122	0.38
123	0.49
124	0.56
125	0.64
126	0.69
127	0.79
128	0.88
129	0.92
130	0.94
131	0.94
132	0.93
133	0.93
134	0.9
135	0.87
136	0.85
137	0.8
138	0.71
139	0.6
140	0.5
141	0.38
142	0.31
143	0.24
144	0.16
145	0.12
146	0.17
147	0.17
148	0.18
149	0.21
150	0.2
151	0.2
152	0.23
153	0.23
154	0.24
155	0.27
156	0.35
157	0.35
158	0.36
159	0.36
160	0.38
161	0.37
162	0.39
163	0.43
164	0.37
165	0.39
166	0.42
167	0.46
168	0.49
169	0.51
170	0.44
171	0.44
172	0.43
173	0.45
174	0.48
175	0.5
176	0.45
177	0.48
178	0.47
179	0.41
180	0.41
181	0.39
182	0.33
183	0.26
184	0.24
185	0.19
186	0.19
187	0.2
188	0.2
189	0.17
190	0.16
191	0.15
192	0.15
193	0.17
194	0.2
195	0.27
196	0.33
197	0.42
198	0.5
199	0.55
200	0.62
201	0.66
202	0.66
203	0.67
204	0.6
205	0.58
206	0.52
207	0.48
208	0.39
209	0.34
210	0.34
211	0.25
212	0.27
213	0.26
214	0.28
215	0.27
216	0.31
217	0.33
218	0.34
219	0.39
220	0.37
221	0.31
222	0.3
223	0.31
224	0.29
225	0.3
226	0.24
227	0.2
228	0.18
229	0.18
230	0.15
231	0.13
232	0.1
233	0.06
234	0.07
235	0.08
236	0.09
237	0.08
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.12
242	0.1
243	0.12
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.08
248	0.1
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.12
253	0.13
254	0.2
255	0.25
256	0.27
257	0.32
258	0.35
259	0.37
260	0.37
261	0.36
262	0.32
263	0.31
264	0.29
265	0.23
266	0.22
267	0.21
268	0.23
269	0.22
270	0.21
271	0.16
272	0.17
273	0.17
274	0.17
275	0.16
276	0.14
277	0.16
278	0.17
279	0.2
280	0.18
281	0.2
282	0.19
283	0.23
284	0.23
285	0.21
286	0.23
287	0.22
288	0.23
289	0.23
290	0.25
291	0.25
292	0.22
293	0.23
294	0.19
295	0.19
296	0.19
297	0.17
298	0.15
299	0.13
300	0.13
301	0.14
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.16
306	0.17
307	0.2
308	0.22
309	0.22
310	0.21
311	0.23
312	0.22
313	0.21
314	0.2
315	0.15
316	0.13
317	0.11
318	0.12
319	0.09
320	0.08
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.04
330	0.05
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.11
339	0.12
340	0.13
341	0.14
342	0.14
343	0.16
344	0.18
345	0.2
346	0.21
347	0.21
348	0.22
349	0.26
350	0.29
351	0.29
352	0.31
353	0.31
354	0.27
355	0.27
356	0.28
357	0.23
358	0.21
359	0.24
360	0.22
361	0.21
362	0.21
363	0.2
364	0.18
365	0.2
366	0.19
367	0.15
368	0.12
369	0.11
370	0.1
371	0.09
372	0.08
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.1
380	0.12
381	0.16
382	0.25
383	0.36
384	0.44
385	0.5
386	0.6
387	0.64
388	0.69
389	0.72
390	0.7
391	0.67
392	0.62
393	0.6
394	0.52
395	0.45
396	0.37
397	0.31
398	0.23
399	0.16
400	0.14
401	0.1
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.14
406	0.18
407	0.25
408	0.26
409	0.28
410	0.29
411	0.31
412	0.35
413	0.32
414	0.29
415	0.26
416	0.27
417	0.29
418	0.28
419	0.27
420	0.24
421	0.2
422	0.2
423	0.17
424	0.14
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.08
429	0.08
430	0.07
431	0.05
432	0.04
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.02
443	0.02
444	0.02
445	0.02
446	0.02
447	0.02
448	0.02
449	0.02
450	0.02
451	0.02
452	0.03
453	0.04
454	0.04
455	0.05
456	0.05
457	0.08
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.16
462	0.21
463	0.22
464	0.23
465	0.22
466	0.31
467	0.35
468	0.34
469	0.33
470	0.28
471	0.28
472	0.29
473	0.27
474	0.19
475	0.15
476	0.17
477	0.13
478	0.13
479	0.12
480	0.1
481	0.12
482	0.12
483	0.13
484	0.13
485	0.13
486	0.15
487	0.16
488	0.22
489	0.2
490	0.2
491	0.19
492	0.18
493	0.19
494	0.17
495	0.15
496	0.11
497	0.11
498	0.12
499	0.14
500	0.14
501	0.11
502	0.12
503	0.13
504	0.13
505	0.15
506	0.14
507	0.13
508	0.14
509	0.15
510	0.14
511	0.16
512	0.19
513	0.19
514	0.2
515	0.27
516	0.28
517	0.27
518	0.28
519	0.25
520	0.23
521	0.25
522	0.23
523	0.16
524	0.13
525	0.14
526	0.16
527	0.17
528	0.16
529	0.13
530	0.13
531	0.12
532	0.12
533	0.19
534	0.2
535	0.27
536	0.31
537	0.33
538	0.36
539	0.38
540	0.45
541	0.44
542	0.45
543	0.46
544	0.48
545	0.53
546	0.51
547	0.54
548	0.54
549	0.54
550	0.54
551	0.48
552	0.44
553	0.41
554	0.46
555	0.48
556	0.45
557	0.46
558	0.45
559	0.45
560	0.43
561	0.41
562	0.35
563	0.28
564	0.24
565	0.17
566	0.16
567	0.14
568	0.14
569	0.16
570	0.16
571	0.18
572	0.22
573	0.23
574	0.28
575	0.33
576	0.38
577	0.44
578	0.44
579	0.51
580	0.57
581	0.61
582	0.57
583	0.55
584	0.49
585	0.44
586	0.49
587	0.41
588	0.32
589	0.28
590	0.26
591	0.24
592	0.23
593	0.24
594	0.19
595	0.17
596	0.24
597	0.26
598	0.25
599	0.24
600	0.27
601	0.24
602	0.24
603	0.27
604	0.21
605	0.21

C1HAL2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer