Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H613

Protein Details
Accession C1H613    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-51QNPLKAKQYKALKRKWKSGTKLKLRECLRRIHydrophilic
321-340KETGNRRRASRKLRLAALKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-41AKQYKALKRKWKSGTK
327-332RRASRK
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 9.333, nucl 7.5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR045138  MeCP2/MBD4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG pbl:PAAG_06123  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
Amino Acid Sequences MEHAVRLFMNGGPKERAMVPQNPLKAKQYKALKRKWKSGTKLKLRECLRRIIDAETNPGDGGEDLSPRDIAPVLLAYLSQHHPPDPSPQEFRAWRATTQLMARQPKISPYFPQKPRSGASCLPFPPISATSFGLIQEKLAYDPFRLLIATIFLNRTRGEVAIPVLYSVFERYPTVSALAEAQEEDVVTMIRCLGLQNARARKCINLAKLWIENPPVKGKRYRKLHYPNKGDGLDIKPGECVDDGDSRVAWEIAHIPGLGSYALDSWRIFCRDELRGLASDWKGTEASGEFVPEWKSVVPKDKELRAYVAWMWLKEGWEWEKETGNRRRASRKLRLAALKGGIAVETNGRWLLETLTVETSAYFEKTVQGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.35
4 0.33
5 0.37
6 0.38
7 0.42
8 0.49
9 0.51
10 0.53
11 0.54
12 0.55
13 0.51
14 0.54
15 0.58
16 0.61
17 0.66
18 0.73
19 0.76
20 0.77
21 0.84
22 0.86
23 0.86
24 0.85
25 0.86
26 0.87
27 0.87
28 0.89
29 0.86
30 0.84
31 0.81
32 0.81
33 0.74
34 0.73
35 0.65
36 0.61
37 0.56
38 0.52
39 0.52
40 0.43
41 0.46
42 0.38
43 0.35
44 0.29
45 0.27
46 0.22
47 0.15
48 0.16
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.1
65 0.12
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.18
71 0.27
72 0.3
73 0.33
74 0.35
75 0.36
76 0.42
77 0.43
78 0.45
79 0.45
80 0.41
81 0.36
82 0.35
83 0.35
84 0.31
85 0.32
86 0.34
87 0.33
88 0.36
89 0.37
90 0.35
91 0.35
92 0.38
93 0.4
94 0.37
95 0.35
96 0.4
97 0.48
98 0.52
99 0.59
100 0.55
101 0.54
102 0.54
103 0.52
104 0.49
105 0.43
106 0.39
107 0.38
108 0.36
109 0.36
110 0.33
111 0.3
112 0.27
113 0.23
114 0.22
115 0.18
116 0.17
117 0.14
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.06
181 0.08
182 0.12
183 0.18
184 0.26
185 0.27
186 0.29
187 0.3
188 0.28
189 0.32
190 0.34
191 0.31
192 0.26
193 0.27
194 0.29
195 0.3
196 0.3
197 0.26
198 0.24
199 0.23
200 0.22
201 0.29
202 0.28
203 0.29
204 0.37
205 0.42
206 0.48
207 0.55
208 0.57
209 0.59
210 0.67
211 0.75
212 0.76
213 0.76
214 0.72
215 0.68
216 0.65
217 0.55
218 0.48
219 0.41
220 0.36
221 0.28
222 0.24
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.09
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.13
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.21
258 0.23
259 0.26
260 0.26
261 0.25
262 0.24
263 0.24
264 0.29
265 0.24
266 0.23
267 0.2
268 0.19
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.12
276 0.1
277 0.13
278 0.15
279 0.13
280 0.14
281 0.12
282 0.15
283 0.17
284 0.27
285 0.29
286 0.35
287 0.41
288 0.46
289 0.5
290 0.49
291 0.5
292 0.41
293 0.41
294 0.34
295 0.36
296 0.32
297 0.27
298 0.27
299 0.25
300 0.25
301 0.22
302 0.27
303 0.22
304 0.23
305 0.25
306 0.25
307 0.3
308 0.34
309 0.43
310 0.47
311 0.52
312 0.55
313 0.59
314 0.66
315 0.68
316 0.74
317 0.75
318 0.77
319 0.76
320 0.78
321 0.8
322 0.75
323 0.72
324 0.65
325 0.55
326 0.45
327 0.37
328 0.29
329 0.21
330 0.17
331 0.13
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.16
341 0.17
342 0.18
343 0.18
344 0.18
345 0.17
346 0.17
347 0.15
348 0.14
349 0.12
350 0.11