Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GU73

Protein Details
Accession C1GU73    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-264SSYIKGKEEKARREKARKEKAFVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-228KK
246-262KGKEEKARREKARKEKA
274-313PRGGRGGDSRGRGRGGDRGGRGGGRGRGGEFRGGPPRGGA
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11.5, nucl 6.5, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pbl:PAAG_02068  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MFCGVVENDANIADPVFLNPSPTKQNLYELLGNDPEEDSDREPSPPTSAVDKTGPRHGKRDGLSDPPRTSNQTSARSSNRGGRGGRYGGNEQAFRDREAGSRSNRGRPVDGPHQHIPTGVVKNRDDRGHLLRGDRANRSDRTVTSKQVEQGWGSNAGDSAWKDEQAGEAIAKNEQKGAEANAAEAVAEPEERVKSYDEYLAQQAEQRRQDLGVKEARKPNEGVKADKKWATAKELKRDEDESSYIKGKEEKARREKARKEKAFVEVDMRFVEQPRGGRGGDSRGRGRGGDRGGRGGGRGRGGEFRGGPPRGGASRVNPTGPSVRVDEKNFPALGGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.12
4 0.12
5 0.16
6 0.17
7 0.21
8 0.27
9 0.29
10 0.33
11 0.31
12 0.36
13 0.36
14 0.4
15 0.4
16 0.36
17 0.37
18 0.34
19 0.33
20 0.28
21 0.24
22 0.19
23 0.18
24 0.19
25 0.17
26 0.19
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.24
35 0.24
36 0.27
37 0.3
38 0.35
39 0.34
40 0.42
41 0.49
42 0.46
43 0.51
44 0.51
45 0.53
46 0.5
47 0.54
48 0.48
49 0.49
50 0.53
51 0.55
52 0.54
53 0.51
54 0.51
55 0.49
56 0.48
57 0.46
58 0.47
59 0.47
60 0.48
61 0.5
62 0.53
63 0.51
64 0.51
65 0.51
66 0.48
67 0.46
68 0.43
69 0.4
70 0.41
71 0.4
72 0.4
73 0.37
74 0.33
75 0.32
76 0.35
77 0.32
78 0.28
79 0.33
80 0.3
81 0.27
82 0.27
83 0.23
84 0.22
85 0.27
86 0.31
87 0.27
88 0.35
89 0.37
90 0.43
91 0.47
92 0.46
93 0.44
94 0.41
95 0.45
96 0.46
97 0.47
98 0.47
99 0.46
100 0.46
101 0.43
102 0.4
103 0.35
104 0.31
105 0.33
106 0.29
107 0.29
108 0.29
109 0.34
110 0.37
111 0.36
112 0.32
113 0.3
114 0.32
115 0.33
116 0.34
117 0.31
118 0.32
119 0.36
120 0.37
121 0.36
122 0.34
123 0.34
124 0.33
125 0.35
126 0.33
127 0.3
128 0.34
129 0.34
130 0.34
131 0.32
132 0.33
133 0.31
134 0.31
135 0.3
136 0.23
137 0.22
138 0.19
139 0.18
140 0.16
141 0.14
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.1
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.11
183 0.14
184 0.14
185 0.15
186 0.17
187 0.16
188 0.14
189 0.16
190 0.19
191 0.22
192 0.23
193 0.22
194 0.21
195 0.22
196 0.26
197 0.24
198 0.26
199 0.27
200 0.28
201 0.33
202 0.38
203 0.39
204 0.37
205 0.37
206 0.36
207 0.38
208 0.39
209 0.39
210 0.41
211 0.45
212 0.47
213 0.48
214 0.45
215 0.41
216 0.41
217 0.42
218 0.43
219 0.44
220 0.5
221 0.54
222 0.54
223 0.53
224 0.53
225 0.47
226 0.42
227 0.39
228 0.31
229 0.28
230 0.29
231 0.26
232 0.25
233 0.26
234 0.27
235 0.34
236 0.4
237 0.47
238 0.53
239 0.63
240 0.71
241 0.78
242 0.83
243 0.85
244 0.87
245 0.84
246 0.79
247 0.75
248 0.73
249 0.67
250 0.58
251 0.54
252 0.43
253 0.39
254 0.34
255 0.3
256 0.23
257 0.2
258 0.22
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.22
263 0.21
264 0.22
265 0.23
266 0.29
267 0.32
268 0.36
269 0.36
270 0.36
271 0.37
272 0.36
273 0.36
274 0.34
275 0.35
276 0.37
277 0.35
278 0.35
279 0.36
280 0.36
281 0.35
282 0.34
283 0.31
284 0.27
285 0.26
286 0.25
287 0.28
288 0.29
289 0.33
290 0.29
291 0.31
292 0.37
293 0.37
294 0.35
295 0.32
296 0.35
297 0.31
298 0.33
299 0.3
300 0.28
301 0.36
302 0.39
303 0.39
304 0.35
305 0.37
306 0.39
307 0.37
308 0.34
309 0.3
310 0.34
311 0.38
312 0.42
313 0.46
314 0.45
315 0.49
316 0.46
317 0.41