Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GT61

Protein Details
Accession C1GT61    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-254QARIEKERKEKEEKEKKEKVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-251KERKEKEEKEKKE
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 11, cysk 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027040  PSMD4  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG pbl:PAAG_01706  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13519  VWA_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50234  VWFA  
CDD cd01452  VWA_26S_proteasome_subunit  
Amino Acid Sequences MVLEATMIIVDNSESSRNGDYLPTRFQAQADAINLIHAAKTQANPESSVGLMSMAGKGPEVLVTLTADIGKILDGLHRTKIRGQAHLVSSIQVAGLALKHRRERAQRQRIIVFTCSPIAEDEKILIKLAKRMKKYNVSVDFVAFGDLDDETIKKLEAFNENVNGADGSHLAVIPPGPNLLSDSLVATPILGGDGTGIGRGGGDEEGEGGVDIGFDPAADPELAFALRMSLEEEQARIEKERKEKEEKEKKEKVALEGIAEEGGESQPLLDENGEPSRSGSNEDKKDDRDKGNGGDKMDTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.15
4 0.15
5 0.16
6 0.2
7 0.23
8 0.26
9 0.3
10 0.3
11 0.3
12 0.31
13 0.3
14 0.29
15 0.27
16 0.27
17 0.23
18 0.23
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.16
23 0.14
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.13
28 0.16
29 0.21
30 0.22
31 0.23
32 0.24
33 0.23
34 0.2
35 0.19
36 0.15
37 0.11
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.07
61 0.09
62 0.11
63 0.18
64 0.2
65 0.22
66 0.25
67 0.33
68 0.34
69 0.36
70 0.38
71 0.38
72 0.37
73 0.4
74 0.36
75 0.28
76 0.25
77 0.21
78 0.17
79 0.1
80 0.08
81 0.05
82 0.06
83 0.09
84 0.12
85 0.16
86 0.2
87 0.23
88 0.3
89 0.38
90 0.48
91 0.56
92 0.64
93 0.65
94 0.67
95 0.68
96 0.65
97 0.59
98 0.5
99 0.4
100 0.31
101 0.27
102 0.21
103 0.17
104 0.15
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.12
113 0.1
114 0.16
115 0.24
116 0.28
117 0.3
118 0.35
119 0.42
120 0.49
121 0.52
122 0.56
123 0.53
124 0.51
125 0.47
126 0.42
127 0.37
128 0.28
129 0.24
130 0.14
131 0.09
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.08
143 0.11
144 0.14
145 0.15
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.13
151 0.1
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.2
225 0.24
226 0.33
227 0.42
228 0.47
229 0.55
230 0.62
231 0.7
232 0.76
233 0.8
234 0.81
235 0.81
236 0.78
237 0.77
238 0.72
239 0.65
240 0.62
241 0.53
242 0.44
243 0.36
244 0.32
245 0.24
246 0.2
247 0.16
248 0.09
249 0.08
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.11
259 0.17
260 0.17
261 0.17
262 0.18
263 0.2
264 0.2
265 0.25
266 0.3
267 0.35
268 0.42
269 0.48
270 0.52
271 0.54
272 0.62
273 0.65
274 0.61
275 0.58
276 0.56
277 0.57
278 0.61
279 0.59
280 0.53