Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2V3G1

Protein Details
Accession A0A0A2V3G1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-253PAHSWCYRRRRVKSERIINPSHydrophilic
445-471PGYRSRYKSVVHKKVRKHGRNILSRSVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG pbl:PAAG_11204  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSPLGGDTKCECDSETGDGRSREATSIQDLEEELQTQPQSGSHPTGPLQPSISSALPDNISEETHATLSDSFAHHLEPDTSGPPNILLHHETREGHLEFLLWAPIWQLEDDVAKVHPDQLKQYKERLDVGSARRASQSNVKPLSGLSHTSTSATEAVQIQQSSRDKITYRRVGFRRVNALLMEDIVFLTIGSILLMVFGCLLMVTLTVDLSRLCSAQIGFAQAWDIWSDKQLPAHSWCYRRRRVKSERIINPSPLYHGRDYSERKVEGLDGKRRRWTREEDNRLMALKQDGFSWPEIEERFPHRQLGSLRQRWYTKLQNTHASNPPTDKRRQEGKCRASAGEPLPLSKPPTPLETSHRSPGGQPQPADDPATPNAKPRTPSPSSTVTSMCPVCNSVVEVEASSAFNAANNRMRWSRLCYPIIAWDRLDDRLTQFHPRLRRTLDDPGYRSRYKSVVHKKVRKHGRNILSRSVLHSTGYYGLRGHEILSAHVVSHFKDAIDSLAGINSVASKYGTVVYAQEVLVPELLEMLVQEDMGVDAKGACWILKESNKIGNLLNLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.33
3 0.32
4 0.36
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.35
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.23
13 0.25
14 0.24
15 0.22
16 0.21
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.14
26 0.17
27 0.19
28 0.24
29 0.22
30 0.25
31 0.25
32 0.33
33 0.34
34 0.33
35 0.31
36 0.26
37 0.27
38 0.28
39 0.28
40 0.21
41 0.2
42 0.21
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.13
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.15
66 0.16
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.15
73 0.17
74 0.18
75 0.19
76 0.22
77 0.26
78 0.25
79 0.26
80 0.31
81 0.28
82 0.25
83 0.23
84 0.2
85 0.16
86 0.17
87 0.15
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.15
103 0.18
104 0.18
105 0.26
106 0.34
107 0.41
108 0.43
109 0.49
110 0.5
111 0.5
112 0.53
113 0.47
114 0.44
115 0.43
116 0.44
117 0.46
118 0.41
119 0.39
120 0.37
121 0.36
122 0.33
123 0.36
124 0.38
125 0.39
126 0.41
127 0.39
128 0.37
129 0.36
130 0.37
131 0.3
132 0.26
133 0.19
134 0.19
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.18
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.13
147 0.19
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.24
152 0.23
153 0.3
154 0.4
155 0.42
156 0.44
157 0.5
158 0.53
159 0.59
160 0.63
161 0.61
162 0.59
163 0.51
164 0.49
165 0.39
166 0.38
167 0.28
168 0.24
169 0.19
170 0.1
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.02
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.08
212 0.09
213 0.06
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.13
219 0.15
220 0.18
221 0.25
222 0.29
223 0.34
224 0.41
225 0.48
226 0.56
227 0.63
228 0.66
229 0.69
230 0.74
231 0.77
232 0.8
233 0.81
234 0.81
235 0.79
236 0.75
237 0.67
238 0.59
239 0.48
240 0.41
241 0.34
242 0.3
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.25
247 0.3
248 0.31
249 0.33
250 0.29
251 0.29
252 0.28
253 0.28
254 0.28
255 0.3
256 0.34
257 0.35
258 0.38
259 0.44
260 0.47
261 0.49
262 0.46
263 0.47
264 0.49
265 0.54
266 0.61
267 0.58
268 0.58
269 0.55
270 0.51
271 0.44
272 0.33
273 0.24
274 0.16
275 0.12
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.18
287 0.22
288 0.22
289 0.24
290 0.21
291 0.25
292 0.27
293 0.35
294 0.39
295 0.4
296 0.42
297 0.45
298 0.46
299 0.44
300 0.48
301 0.47
302 0.43
303 0.45
304 0.47
305 0.51
306 0.52
307 0.55
308 0.56
309 0.49
310 0.44
311 0.4
312 0.41
313 0.38
314 0.41
315 0.38
316 0.38
317 0.46
318 0.51
319 0.57
320 0.62
321 0.63
322 0.64
323 0.63
324 0.58
325 0.5
326 0.49
327 0.4
328 0.35
329 0.29
330 0.24
331 0.23
332 0.23
333 0.26
334 0.22
335 0.24
336 0.2
337 0.24
338 0.25
339 0.26
340 0.32
341 0.35
342 0.36
343 0.37
344 0.36
345 0.33
346 0.31
347 0.38
348 0.39
349 0.37
350 0.33
351 0.32
352 0.34
353 0.35
354 0.37
355 0.28
356 0.23
357 0.21
358 0.26
359 0.23
360 0.25
361 0.28
362 0.28
363 0.3
364 0.3
365 0.35
366 0.35
367 0.38
368 0.37
369 0.4
370 0.38
371 0.39
372 0.38
373 0.3
374 0.31
375 0.29
376 0.24
377 0.18
378 0.17
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.06
392 0.08
393 0.09
394 0.12
395 0.18
396 0.19
397 0.23
398 0.24
399 0.27
400 0.28
401 0.35
402 0.39
403 0.41
404 0.42
405 0.38
406 0.38
407 0.45
408 0.47
409 0.41
410 0.33
411 0.28
412 0.28
413 0.29
414 0.29
415 0.21
416 0.18
417 0.22
418 0.24
419 0.29
420 0.31
421 0.34
422 0.41
423 0.43
424 0.47
425 0.46
426 0.48
427 0.47
428 0.53
429 0.56
430 0.56
431 0.56
432 0.58
433 0.61
434 0.57
435 0.54
436 0.47
437 0.43
438 0.39
439 0.46
440 0.49
441 0.53
442 0.62
443 0.69
444 0.74
445 0.8
446 0.87
447 0.85
448 0.84
449 0.83
450 0.82
451 0.84
452 0.81
453 0.79
454 0.74
455 0.66
456 0.61
457 0.55
458 0.45
459 0.36
460 0.3
461 0.24
462 0.24
463 0.24
464 0.2
465 0.16
466 0.17
467 0.18
468 0.18
469 0.17
470 0.14
471 0.14
472 0.14
473 0.17
474 0.16
475 0.14
476 0.17
477 0.17
478 0.15
479 0.18
480 0.18
481 0.14
482 0.15
483 0.15
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.08
498 0.1
499 0.11
500 0.1
501 0.11
502 0.13
503 0.15
504 0.14
505 0.16
506 0.15
507 0.15
508 0.15
509 0.14
510 0.12
511 0.1
512 0.1
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.08
527 0.09
528 0.08
529 0.09
530 0.12
531 0.2
532 0.26
533 0.31
534 0.34
535 0.41
536 0.42
537 0.43
538 0.41