Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9HD26

Protein Details
Accession W9HD26    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58SPSPSMSAKKPPPSAKQPPHSASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5.5, cyto_mito 4.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPVGPIVHQNVANKVKRPVPPGIQTNGAITSSKSSPSPSMSAKKPPPSAKQPPHSASDRAITASTVRPVNRVRRETASQLQGRHSRNSAGLRSASLAADHSSHDAEPRPYIVTDSYILNKFAGRPPSLVCHLHTTHFRFDNQDGVFPYKSPMKIFLDHVRSRTIPHDLLSYFTEAGVPFYDGCLIVQVHDHKSLAQAKNVAKSTKGKGSVMPSSIHNYNQCLTPSPNVPFPKEGLVNGDGSSKSNDVAEKENAPVMPAPEEQKDKATKPRVFTMVLHPTPESLQMDLLIKASTPRGLGDGLGQPPSTPMSLIPPTPTAGSMPPPAKRQKREKTELDGSNIYAAEGQILLATNAPLVLEPTKNVEETIILMEAMSHPKHAEAPPQPKTRKRTVAEMAADEAAAAETERFMLVADERLAPNANGAQNGGAADGDASGGASAFEPRFERFKVLADISREHAEKKEQEKLKQLENDRKLQQAKQQQQQDAVALAQKQNAEQERLRREAAAREAQMRQAEAQRQAQARAQAANQNSQNNQNAQRVNGSQPQHGHPQNNVVTNGVNNAAVGTPQMANNMPPQAQPRFQAQITQPPASSPVAGQGTPQHMSSPMVGSVPMQQTNSGMANSPPRPSSVVQNPAAMSVPMAHNMSSRGSQQSHPSGTPRMPHSTPNMAQGTPINRPAMVATPRMSQASPPPAMMAQNSQPGQGMMMNGQGMNQMNPQYAAQLAQQRAVQQQQQMAMQNGLNSGNMSQMSPQQQQMMQAMQRQLIAQQQAQQQGNMMSPQQQQQQQQIAAQYAQQMQNMSGNQMRQFTPQMQAQFQQMMRMNQVNGQMGNSPMQRQVSGQMMPNGMNLQAFQAMQQQRQQQQAQQQGNMMSPQQQQQAHQQQQAQQQMGQMGQQNPIQAQMQQQARLLFNRMMPTVAQKYGGQELIPPDVIEKMKTQSMGQAQTLMQASMAQRRQQQQMMMQQQQQQQQQQQQQQMQQQQMQQQQLQQQMQQQMQGMNGMMGGPQGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.52
4 0.55
5 0.58
6 0.58
7 0.57
8 0.6
9 0.63
10 0.61
11 0.59
12 0.53
13 0.5
14 0.44
15 0.36
16 0.28
17 0.22
18 0.23
19 0.2
20 0.21
21 0.19
22 0.21
23 0.23
24 0.27
25 0.32
26 0.35
27 0.41
28 0.45
29 0.54
30 0.59
31 0.65
32 0.69
33 0.72
34 0.73
35 0.75
36 0.81
37 0.81
38 0.82
39 0.83
40 0.78
41 0.76
42 0.72
43 0.65
44 0.57
45 0.52
46 0.44
47 0.36
48 0.33
49 0.27
50 0.25
51 0.26
52 0.27
53 0.27
54 0.26
55 0.3
56 0.37
57 0.47
58 0.54
59 0.54
60 0.55
61 0.57
62 0.62
63 0.64
64 0.64
65 0.64
66 0.59
67 0.57
68 0.6
69 0.61
70 0.59
71 0.57
72 0.51
73 0.45
74 0.46
75 0.5
76 0.45
77 0.42
78 0.4
79 0.35
80 0.36
81 0.34
82 0.28
83 0.21
84 0.19
85 0.15
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.16
92 0.19
93 0.2
94 0.21
95 0.22
96 0.22
97 0.2
98 0.22
99 0.21
100 0.19
101 0.19
102 0.2
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.27
110 0.3
111 0.27
112 0.27
113 0.28
114 0.34
115 0.38
116 0.37
117 0.34
118 0.35
119 0.35
120 0.37
121 0.42
122 0.41
123 0.43
124 0.44
125 0.44
126 0.41
127 0.4
128 0.44
129 0.37
130 0.36
131 0.32
132 0.33
133 0.32
134 0.28
135 0.3
136 0.28
137 0.29
138 0.26
139 0.29
140 0.29
141 0.32
142 0.37
143 0.43
144 0.46
145 0.48
146 0.48
147 0.47
148 0.43
149 0.42
150 0.41
151 0.38
152 0.3
153 0.28
154 0.31
155 0.26
156 0.28
157 0.27
158 0.26
159 0.2
160 0.18
161 0.19
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.13
175 0.17
176 0.19
177 0.21
178 0.21
179 0.19
180 0.25
181 0.34
182 0.32
183 0.31
184 0.35
185 0.36
186 0.44
187 0.47
188 0.42
189 0.36
190 0.4
191 0.42
192 0.43
193 0.43
194 0.37
195 0.38
196 0.43
197 0.44
198 0.41
199 0.37
200 0.31
201 0.33
202 0.34
203 0.33
204 0.29
205 0.26
206 0.25
207 0.27
208 0.26
209 0.24
210 0.25
211 0.25
212 0.28
213 0.28
214 0.34
215 0.34
216 0.36
217 0.34
218 0.33
219 0.34
220 0.3
221 0.28
222 0.25
223 0.24
224 0.22
225 0.21
226 0.22
227 0.17
228 0.17
229 0.19
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.18
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.22
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.19
248 0.23
249 0.23
250 0.28
251 0.31
252 0.32
253 0.39
254 0.46
255 0.46
256 0.47
257 0.52
258 0.49
259 0.47
260 0.46
261 0.46
262 0.46
263 0.43
264 0.4
265 0.34
266 0.31
267 0.3
268 0.31
269 0.23
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.13
275 0.13
276 0.1
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.12
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.15
293 0.16
294 0.13
295 0.09
296 0.08
297 0.12
298 0.14
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.12
306 0.12
307 0.14
308 0.18
309 0.2
310 0.23
311 0.29
312 0.38
313 0.45
314 0.52
315 0.6
316 0.64
317 0.71
318 0.76
319 0.76
320 0.75
321 0.76
322 0.71
323 0.65
324 0.56
325 0.47
326 0.4
327 0.34
328 0.25
329 0.16
330 0.12
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.07
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.12
366 0.13
367 0.2
368 0.25
369 0.33
370 0.41
371 0.5
372 0.55
373 0.59
374 0.64
375 0.65
376 0.67
377 0.6
378 0.6
379 0.56
380 0.59
381 0.54
382 0.49
383 0.42
384 0.32
385 0.29
386 0.21
387 0.16
388 0.08
389 0.05
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.06
400 0.07
401 0.09
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.02
423 0.02
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.06
429 0.07
430 0.08
431 0.11
432 0.12
433 0.15
434 0.14
435 0.17
436 0.19
437 0.2
438 0.22
439 0.22
440 0.23
441 0.22
442 0.24
443 0.22
444 0.19
445 0.19
446 0.2
447 0.23
448 0.25
449 0.32
450 0.33
451 0.36
452 0.44
453 0.45
454 0.47
455 0.48
456 0.49
457 0.5
458 0.5
459 0.53
460 0.46
461 0.49
462 0.46
463 0.42
464 0.43
465 0.43
466 0.47
467 0.48
468 0.52
469 0.48
470 0.47
471 0.45
472 0.39
473 0.3
474 0.22
475 0.17
476 0.12
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.1
481 0.13
482 0.14
483 0.16
484 0.17
485 0.23
486 0.26
487 0.28
488 0.28
489 0.26
490 0.25
491 0.25
492 0.28
493 0.26
494 0.22
495 0.23
496 0.23
497 0.25
498 0.24
499 0.21
500 0.18
501 0.17
502 0.19
503 0.19
504 0.21
505 0.23
506 0.24
507 0.25
508 0.25
509 0.25
510 0.22
511 0.2
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.22
516 0.23
517 0.22
518 0.23
519 0.25
520 0.26
521 0.25
522 0.28
523 0.28
524 0.27
525 0.25
526 0.26
527 0.24
528 0.25
529 0.28
530 0.26
531 0.23
532 0.25
533 0.27
534 0.32
535 0.34
536 0.32
537 0.26
538 0.32
539 0.32
540 0.33
541 0.3
542 0.23
543 0.2
544 0.19
545 0.19
546 0.12
547 0.09
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.09
560 0.11
561 0.11
562 0.12
563 0.15
564 0.17
565 0.19
566 0.2
567 0.22
568 0.24
569 0.23
570 0.27
571 0.25
572 0.31
573 0.34
574 0.33
575 0.29
576 0.25
577 0.28
578 0.23
579 0.22
580 0.13
581 0.13
582 0.13
583 0.13
584 0.14
585 0.14
586 0.17
587 0.17
588 0.17
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.14
593 0.12
594 0.09
595 0.09
596 0.09
597 0.09
598 0.13
599 0.14
600 0.15
601 0.14
602 0.13
603 0.14
604 0.16
605 0.16
606 0.11
607 0.1
608 0.1
609 0.16
610 0.17
611 0.19
612 0.17
613 0.17
614 0.2
615 0.21
616 0.26
617 0.27
618 0.33
619 0.33
620 0.35
621 0.33
622 0.31
623 0.31
624 0.23
625 0.16
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.09
631 0.09
632 0.1
633 0.12
634 0.12
635 0.13
636 0.15
637 0.16
638 0.18
639 0.23
640 0.27
641 0.28
642 0.28
643 0.29
644 0.29
645 0.29
646 0.32
647 0.3
648 0.3
649 0.29
650 0.31
651 0.33
652 0.38
653 0.37
654 0.39
655 0.38
656 0.31
657 0.31
658 0.31
659 0.3
660 0.25
661 0.27
662 0.2
663 0.18
664 0.18
665 0.18
666 0.21
667 0.2
668 0.19
669 0.18
670 0.2
671 0.21
672 0.22
673 0.21
674 0.17
675 0.2
676 0.25
677 0.24
678 0.22
679 0.22
680 0.21
681 0.22
682 0.21
683 0.18
684 0.14
685 0.2
686 0.2
687 0.19
688 0.19
689 0.18
690 0.18
691 0.15
692 0.13
693 0.08
694 0.09
695 0.09
696 0.08
697 0.08
698 0.1
699 0.09
700 0.1
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.12
705 0.12
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.12
710 0.17
711 0.17
712 0.19
713 0.2
714 0.21
715 0.24
716 0.26
717 0.26
718 0.23
719 0.24
720 0.24
721 0.26
722 0.27
723 0.25
724 0.24
725 0.21
726 0.19
727 0.17
728 0.16
729 0.13
730 0.11
731 0.09
732 0.1
733 0.09
734 0.09
735 0.09
736 0.13
737 0.19
738 0.21
739 0.22
740 0.23
741 0.23
742 0.26
743 0.26
744 0.26
745 0.23
746 0.25
747 0.25
748 0.24
749 0.23
750 0.21
751 0.2
752 0.2
753 0.21
754 0.18
755 0.22
756 0.26
757 0.33
758 0.33
759 0.32
760 0.29
761 0.27
762 0.27
763 0.22
764 0.18
765 0.17
766 0.19
767 0.23
768 0.28
769 0.32
770 0.34
771 0.39
772 0.45
773 0.4
774 0.4
775 0.37
776 0.33
777 0.28
778 0.26
779 0.23
780 0.22
781 0.22
782 0.21
783 0.2
784 0.19
785 0.23
786 0.22
787 0.21
788 0.19
789 0.2
790 0.21
791 0.23
792 0.23
793 0.22
794 0.25
795 0.25
796 0.27
797 0.29
798 0.3
799 0.3
800 0.3
801 0.3
802 0.32
803 0.29
804 0.32
805 0.32
806 0.3
807 0.32
808 0.33
809 0.31
810 0.29
811 0.33
812 0.28
813 0.24
814 0.23
815 0.21
816 0.19
817 0.23
818 0.21
819 0.19
820 0.2
821 0.21
822 0.2
823 0.19
824 0.22
825 0.22
826 0.23
827 0.25
828 0.25
829 0.25
830 0.25
831 0.25
832 0.22
833 0.18
834 0.16
835 0.13
836 0.1
837 0.1
838 0.1
839 0.1
840 0.18
841 0.2
842 0.23
843 0.29
844 0.35
845 0.38
846 0.46
847 0.48
848 0.44
849 0.5
850 0.57
851 0.56
852 0.5
853 0.48
854 0.42
855 0.41
856 0.37
857 0.29
858 0.24
859 0.22
860 0.25
861 0.28
862 0.29
863 0.3
864 0.4
865 0.5
866 0.51
867 0.53
868 0.53
869 0.53
870 0.59
871 0.64
872 0.55
873 0.46
874 0.41
875 0.38
876 0.34
877 0.31
878 0.29
879 0.24
880 0.26
881 0.26
882 0.25
883 0.23
884 0.25
885 0.23
886 0.18
887 0.21
888 0.25
889 0.28
890 0.29
891 0.32
892 0.33
893 0.34
894 0.35
895 0.35
896 0.3
897 0.29
898 0.31
899 0.29
900 0.26
901 0.24
902 0.29
903 0.3
904 0.28
905 0.27
906 0.24
907 0.27
908 0.3
909 0.3
910 0.23
911 0.21
912 0.23
913 0.24
914 0.24
915 0.21
916 0.17
917 0.21
918 0.22
919 0.2
920 0.2
921 0.2
922 0.22
923 0.24
924 0.24
925 0.26
926 0.32
927 0.35
928 0.33
929 0.33
930 0.3
931 0.33
932 0.33
933 0.26
934 0.19
935 0.18
936 0.19
937 0.25
938 0.29
939 0.29
940 0.35
941 0.41
942 0.48
943 0.49
944 0.51
945 0.5
946 0.56
947 0.6
948 0.6
949 0.6
950 0.61
951 0.63
952 0.65
953 0.65
954 0.62
955 0.61
956 0.63
957 0.66
958 0.67
959 0.7
960 0.69
961 0.69
962 0.7
963 0.7
964 0.67
965 0.63
966 0.61
967 0.6
968 0.61
969 0.6
970 0.54
971 0.52
972 0.52
973 0.55
974 0.53
975 0.49
976 0.48
977 0.49
978 0.48
979 0.46
980 0.42
981 0.35
982 0.33
983 0.31
984 0.25
985 0.18
986 0.16
987 0.13
988 0.1