Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GPL1

Protein Details
Accession C1GPL1    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
322-341GTPVRRKKRKGALTNPSAYSHydrophilic
423-447EDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEAIGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-331RRKKRK
428-441HAKRKGAKGKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG pbl:PAAG_00456  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPSRRQWIDKKSATTYQLFHRSQNDPLIHDAEADDRVLHRVSGAPITESPSIPLKTTKTTAKNLAELEKEFGGAKVRKNEGEAANYGIYYDDSQYDYMQHLRDLGRSGDGQSRFIEAVPVKGKGKARIVKLEDALRETSLDDGDDLGSVYDDILSTASNYSRKRTYQDQQNVPDSIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAFVDTDDAGDLFESLVQGGPDAEVDPSEWRDTFIEDDDEGWESDVTEKAPEQQSVSTTYAESPAKGPMDDVQIPDTVAGEGDWLRNFAQYKKDIKSKSSPPLIHGDTGSVLRAGTVASTMFTAGGTPVRRKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERIEALYALDEEGEDYDGVSMADDMSVVSGMSKVSEVPSLVSGGTPLRSDFNQIMDGFLEGWEDRGVHAKRKGAKGKRGKNGNEAIGMKMLDEIRQGLGPAKLPGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.57
3 0.56
4 0.59
5 0.54
6 0.52
7 0.51
8 0.5
9 0.5
10 0.55
11 0.48
12 0.4
13 0.42
14 0.41
15 0.34
16 0.31
17 0.27
18 0.21
19 0.19
20 0.17
21 0.14
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.12
27 0.14
28 0.16
29 0.19
30 0.19
31 0.2
32 0.2
33 0.25
34 0.27
35 0.23
36 0.23
37 0.26
38 0.26
39 0.24
40 0.28
41 0.27
42 0.3
43 0.34
44 0.41
45 0.41
46 0.47
47 0.54
48 0.54
49 0.55
50 0.53
51 0.53
52 0.48
53 0.43
54 0.4
55 0.31
56 0.28
57 0.23
58 0.21
59 0.24
60 0.24
61 0.28
62 0.32
63 0.36
64 0.36
65 0.38
66 0.44
67 0.4
68 0.4
69 0.36
70 0.32
71 0.29
72 0.27
73 0.25
74 0.18
75 0.15
76 0.12
77 0.12
78 0.09
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.14
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.17
88 0.17
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.2
95 0.24
96 0.24
97 0.24
98 0.22
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.23
103 0.16
104 0.21
105 0.22
106 0.24
107 0.23
108 0.28
109 0.31
110 0.32
111 0.41
112 0.4
113 0.42
114 0.48
115 0.51
116 0.51
117 0.51
118 0.5
119 0.42
120 0.39
121 0.36
122 0.27
123 0.23
124 0.19
125 0.16
126 0.12
127 0.1
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.06
144 0.08
145 0.13
146 0.14
147 0.18
148 0.22
149 0.24
150 0.28
151 0.35
152 0.42
153 0.47
154 0.56
155 0.6
156 0.61
157 0.64
158 0.6
159 0.52
160 0.45
161 0.34
162 0.25
163 0.18
164 0.13
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.17
239 0.19
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.17
244 0.16
245 0.15
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.11
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.13
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.1
270 0.11
271 0.13
272 0.18
273 0.23
274 0.29
275 0.33
276 0.4
277 0.4
278 0.43
279 0.49
280 0.5
281 0.53
282 0.56
283 0.52
284 0.47
285 0.52
286 0.49
287 0.43
288 0.35
289 0.28
290 0.2
291 0.2
292 0.17
293 0.1
294 0.08
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.09
309 0.11
310 0.17
311 0.25
312 0.36
313 0.43
314 0.48
315 0.57
316 0.63
317 0.72
318 0.76
319 0.78
320 0.78
321 0.8
322 0.81
323 0.72
324 0.64
325 0.54
326 0.44
327 0.35
328 0.25
329 0.18
330 0.14
331 0.14
332 0.12
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.14
337 0.19
338 0.21
339 0.22
340 0.23
341 0.24
342 0.25
343 0.32
344 0.31
345 0.27
346 0.25
347 0.23
348 0.22
349 0.21
350 0.21
351 0.14
352 0.14
353 0.12
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.13
395 0.13
396 0.18
397 0.19
398 0.2
399 0.23
400 0.23
401 0.23
402 0.2
403 0.2
404 0.16
405 0.14
406 0.13
407 0.08
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.18
413 0.21
414 0.27
415 0.32
416 0.37
417 0.44
418 0.54
419 0.64
420 0.65
421 0.73
422 0.76
423 0.82
424 0.85
425 0.87
426 0.83
427 0.82
428 0.8
429 0.74
430 0.7
431 0.62
432 0.54
433 0.47
434 0.41
435 0.31
436 0.27
437 0.23
438 0.17
439 0.17
440 0.16
441 0.15
442 0.16
443 0.16
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.23