Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9IT88

Protein Details
Accession W9IT88    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-122DESEKWDKRLKKKTTRRDNNAFADHydrophilic
209-228RAEEQRLKKRKERMAQNGDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAPSPTGKKDEAQQMNVDNMSKAQDRLARFKALQARAKTSSEKNLKEATLESQRLATDPSQITALHRKHAIASHKLLKADVEEAGGDFERKRAWDWTVDESEKWDKRLKKKTTRRDNNAFADHTQEANKIYKRQLKNIDMNMEQYEKDKKALIEKAAASGGLDIVETEDGELIAVDKDGSFYSTADSTTFAENKPDKAAVDRLVADLQRAEEQRLKKRKERMAQNGDDGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.46
4 0.4
5 0.29
6 0.23
7 0.24
8 0.22
9 0.2
10 0.21
11 0.24
12 0.27
13 0.35
14 0.38
15 0.4
16 0.38
17 0.44
18 0.48
19 0.51
20 0.55
21 0.52
22 0.54
23 0.53
24 0.56
25 0.55
26 0.5
27 0.52
28 0.54
29 0.52
30 0.49
31 0.5
32 0.46
33 0.43
34 0.4
35 0.36
36 0.35
37 0.34
38 0.3
39 0.27
40 0.27
41 0.26
42 0.27
43 0.21
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.18
49 0.21
50 0.27
51 0.28
52 0.25
53 0.26
54 0.25
55 0.26
56 0.32
57 0.35
58 0.31
59 0.36
60 0.4
61 0.42
62 0.42
63 0.4
64 0.35
65 0.3
66 0.25
67 0.19
68 0.12
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.19
82 0.22
83 0.26
84 0.3
85 0.31
86 0.29
87 0.3
88 0.36
89 0.32
90 0.31
91 0.32
92 0.34
93 0.42
94 0.53
95 0.59
96 0.62
97 0.71
98 0.8
99 0.85
100 0.89
101 0.88
102 0.87
103 0.84
104 0.79
105 0.73
106 0.63
107 0.52
108 0.46
109 0.37
110 0.29
111 0.22
112 0.17
113 0.15
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.22
118 0.3
119 0.31
120 0.37
121 0.44
122 0.45
123 0.5
124 0.51
125 0.5
126 0.42
127 0.42
128 0.36
129 0.29
130 0.23
131 0.19
132 0.19
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.2
138 0.24
139 0.24
140 0.24
141 0.23
142 0.24
143 0.22
144 0.21
145 0.15
146 0.11
147 0.1
148 0.05
149 0.05
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.13
176 0.14
177 0.13
178 0.2
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.23
183 0.2
184 0.23
185 0.26
186 0.22
187 0.23
188 0.22
189 0.21
190 0.23
191 0.22
192 0.19
193 0.16
194 0.15
195 0.17
196 0.17
197 0.19
198 0.22
199 0.29
200 0.39
201 0.48
202 0.53
203 0.55
204 0.64
205 0.7
206 0.74
207 0.79
208 0.8
209 0.8
210 0.78
211 0.77
212 0.69
213 0.6
214 0.5
215 0.4
216 0.3
217 0.2
218 0.16
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.22
223 0.23
224 0.29
225 0.37
226 0.47
227 0.49
228 0.56
229 0.64
230 0.65
231 0.72
232 0.73
233 0.76
234 0.7
235 0.69
236 0.69
237 0.62
238 0.6
239 0.56
240 0.54
241 0.49
242 0.47
243 0.47
244 0.43
245 0.43
246 0.38