Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1HDX9

Protein Details
Accession C1HDX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-75YLTGFHKRKVQRAKHAQEKAEKRAKEEKREQRRRIREERRTEVERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-70KRKVQRAKHAQEKAEKRAKEEKREQRRRIREERR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8.5, cyto_mito 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019186  Nucleolar_protein_12  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG pbl:PAAG_08972  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09805  Nop25  
Amino Acid Sequences MSSNLRKCKVAAPSTNVVQEILFDPSARQMYLTGFHKRKVQRAKHAQEKAEKRAKEEKREQRRRIREERRTEVERAIAENKALVREINSDFGSEEGGKGEGEDEEWDGIADPTPVDYEKEYIDEDKYTAVTVEEVDTSRKWLWRKDDEEQEDARGGGKENDHEQNDHGEKSEDGSKPAETSMEQDESEEQEYEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.57
3 0.5
4 0.41
5 0.32
6 0.26
7 0.21
8 0.18
9 0.15
10 0.12
11 0.12
12 0.16
13 0.18
14 0.16
15 0.15
16 0.12
17 0.14
18 0.2
19 0.24
20 0.3
21 0.31
22 0.33
23 0.41
24 0.44
25 0.52
26 0.57
27 0.61
28 0.62
29 0.71
30 0.78
31 0.8
32 0.83
33 0.8
34 0.79
35 0.77
36 0.75
37 0.73
38 0.64
39 0.59
40 0.62
41 0.64
42 0.64
43 0.67
44 0.68
45 0.72
46 0.82
47 0.85
48 0.86
49 0.89
50 0.88
51 0.88
52 0.88
53 0.87
54 0.85
55 0.84
56 0.81
57 0.75
58 0.68
59 0.58
60 0.5
61 0.41
62 0.34
63 0.28
64 0.21
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.11
73 0.12
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.09
81 0.08
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.09
123 0.09
124 0.13
125 0.14
126 0.18
127 0.2
128 0.25
129 0.32
130 0.4
131 0.46
132 0.5
133 0.58
134 0.59
135 0.61
136 0.56
137 0.5
138 0.42
139 0.36
140 0.3
141 0.2
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.21
147 0.27
148 0.28
149 0.28
150 0.28
151 0.34
152 0.35
153 0.32
154 0.28
155 0.23
156 0.21
157 0.24
158 0.3
159 0.23
160 0.22
161 0.24
162 0.23
163 0.23
164 0.23
165 0.21
166 0.14
167 0.17
168 0.2
169 0.21
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.23
174 0.25
175 0.22