Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H5I7

Protein Details
Accession C1H5I7    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MAPHRRSRIASRRRREDDGDEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018545  Btz_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0035145  C:exon-exon junction complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0006417  P:regulation of translation  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pbl:PAAG_06028  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09405  Btz  
Amino Acid Sequences MAPHRRSRIASRRRREDDGDEEGSIDGDLEDDSLSEGTISAHEDDADEEGSDMSEDDTTGPVERLSTNGQVLTTNGDDRGERGQGEQRGERGQRQRRDESISPAKPVFGATVSDTEAMMDGLKLSEGAEGVQEIHFDDMKIELVATPKSANNRGYRRETFAERKRREHDEYIKERDSNPAFVPTRGRFFLHDKRNTRPIPPPVPNHTAFHTPPRPVPTAPRSSPPNRSFSSSVLVGNVPVIVFLPGMKDPIPYSAVPKKQHTRLPQHRPPLRRDKPVRISVPGQPPRYIFPSTERSFIFIPRALRPNQQFRQRGRGGFYGGGGRRTSVYGGSVYTPSVAMSRRSSFGRGTDAITSPVGSAISRVGGMPGEGRKPVVRLPPSIRPPLGSGFAPQPPAMVPQMTAPPLPSQYPMPPPPEFRENRLPQNIPMHQPRPQKTVSVADIESPVSFQYNPPQQQQEQPFRQQVPHPVNGGFIPDNNAYAPHGRRASHASQPSATPLSQIPERAIHAQPFQPYPYQPQTYYTEAGYQPAPIFYTTSNPEYPTYATTVRPGPPPATYAAQPQQMPFSVGPPLPHHPPPTHQQPAPDQEQAPSGTFAHEQNGTVYYYDTSQFANSAYPPQQNQVYSAPPPQQGVPPGGVVGMGGMMTPPGTTYYYPQPQNGTVYYT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.8
3 0.77
4 0.74
5 0.71
6 0.64
7 0.53
8 0.47
9 0.4
10 0.33
11 0.25
12 0.18
13 0.09
14 0.06
15 0.06
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.19
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.2
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.16
66 0.2
67 0.18
68 0.16
69 0.18
70 0.25
71 0.29
72 0.34
73 0.35
74 0.35
75 0.4
76 0.43
77 0.48
78 0.51
79 0.56
80 0.59
81 0.64
82 0.68
83 0.65
84 0.7
85 0.66
86 0.65
87 0.66
88 0.61
89 0.57
90 0.51
91 0.46
92 0.38
93 0.34
94 0.26
95 0.17
96 0.16
97 0.13
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.07
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.18
136 0.24
137 0.28
138 0.35
139 0.42
140 0.48
141 0.55
142 0.56
143 0.57
144 0.56
145 0.58
146 0.6
147 0.62
148 0.66
149 0.64
150 0.68
151 0.68
152 0.7
153 0.69
154 0.68
155 0.69
156 0.68
157 0.7
158 0.71
159 0.69
160 0.62
161 0.56
162 0.55
163 0.47
164 0.4
165 0.33
166 0.34
167 0.32
168 0.32
169 0.38
170 0.32
171 0.35
172 0.33
173 0.33
174 0.28
175 0.35
176 0.42
177 0.46
178 0.52
179 0.52
180 0.56
181 0.65
182 0.63
183 0.6
184 0.59
185 0.58
186 0.58
187 0.61
188 0.61
189 0.59
190 0.63
191 0.61
192 0.54
193 0.48
194 0.44
195 0.39
196 0.41
197 0.39
198 0.35
199 0.36
200 0.4
201 0.4
202 0.35
203 0.42
204 0.4
205 0.44
206 0.43
207 0.46
208 0.47
209 0.49
210 0.59
211 0.54
212 0.53
213 0.46
214 0.49
215 0.46
216 0.41
217 0.39
218 0.3
219 0.27
220 0.22
221 0.2
222 0.15
223 0.13
224 0.11
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.13
239 0.11
240 0.17
241 0.23
242 0.3
243 0.33
244 0.39
245 0.44
246 0.47
247 0.54
248 0.56
249 0.6
250 0.64
251 0.71
252 0.72
253 0.75
254 0.76
255 0.74
256 0.74
257 0.74
258 0.71
259 0.7
260 0.7
261 0.7
262 0.72
263 0.75
264 0.7
265 0.62
266 0.58
267 0.55
268 0.59
269 0.56
270 0.49
271 0.43
272 0.41
273 0.39
274 0.4
275 0.34
276 0.24
277 0.22
278 0.29
279 0.29
280 0.31
281 0.29
282 0.27
283 0.27
284 0.27
285 0.24
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.25
290 0.24
291 0.29
292 0.33
293 0.4
294 0.43
295 0.5
296 0.53
297 0.52
298 0.59
299 0.57
300 0.54
301 0.48
302 0.44
303 0.37
304 0.3
305 0.28
306 0.25
307 0.22
308 0.22
309 0.18
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.08
315 0.09
316 0.07
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.15
330 0.16
331 0.18
332 0.17
333 0.17
334 0.19
335 0.18
336 0.18
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.1
343 0.1
344 0.08
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.15
362 0.2
363 0.21
364 0.24
365 0.29
366 0.37
367 0.41
368 0.43
369 0.4
370 0.34
371 0.34
372 0.31
373 0.29
374 0.2
375 0.17
376 0.17
377 0.18
378 0.18
379 0.16
380 0.14
381 0.12
382 0.14
383 0.13
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.12
396 0.15
397 0.21
398 0.24
399 0.27
400 0.28
401 0.31
402 0.34
403 0.41
404 0.39
405 0.39
406 0.46
407 0.46
408 0.51
409 0.54
410 0.51
411 0.46
412 0.52
413 0.5
414 0.45
415 0.47
416 0.43
417 0.43
418 0.51
419 0.51
420 0.48
421 0.46
422 0.42
423 0.38
424 0.41
425 0.36
426 0.31
427 0.28
428 0.23
429 0.23
430 0.22
431 0.19
432 0.13
433 0.11
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.14
438 0.22
439 0.25
440 0.29
441 0.34
442 0.34
443 0.42
444 0.49
445 0.52
446 0.49
447 0.53
448 0.54
449 0.51
450 0.53
451 0.49
452 0.5
453 0.46
454 0.44
455 0.4
456 0.35
457 0.34
458 0.31
459 0.31
460 0.22
461 0.16
462 0.16
463 0.14
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.12
468 0.17
469 0.18
470 0.2
471 0.23
472 0.23
473 0.26
474 0.32
475 0.35
476 0.38
477 0.41
478 0.38
479 0.36
480 0.36
481 0.37
482 0.33
483 0.29
484 0.22
485 0.18
486 0.19
487 0.2
488 0.2
489 0.18
490 0.18
491 0.21
492 0.23
493 0.25
494 0.24
495 0.25
496 0.27
497 0.29
498 0.28
499 0.28
500 0.27
501 0.26
502 0.31
503 0.35
504 0.36
505 0.33
506 0.36
507 0.38
508 0.39
509 0.39
510 0.32
511 0.3
512 0.26
513 0.28
514 0.24
515 0.2
516 0.17
517 0.16
518 0.16
519 0.11
520 0.12
521 0.11
522 0.16
523 0.18
524 0.21
525 0.22
526 0.23
527 0.24
528 0.24
529 0.25
530 0.22
531 0.23
532 0.21
533 0.2
534 0.22
535 0.26
536 0.27
537 0.29
538 0.3
539 0.28
540 0.27
541 0.28
542 0.28
543 0.27
544 0.25
545 0.28
546 0.31
547 0.34
548 0.33
549 0.32
550 0.32
551 0.3
552 0.32
553 0.24
554 0.21
555 0.2
556 0.21
557 0.23
558 0.24
559 0.28
560 0.3
561 0.35
562 0.38
563 0.36
564 0.39
565 0.44
566 0.5
567 0.53
568 0.49
569 0.5
570 0.54
571 0.58
572 0.59
573 0.56
574 0.47
575 0.4
576 0.42
577 0.38
578 0.32
579 0.27
580 0.22
581 0.19
582 0.2
583 0.2
584 0.2
585 0.19
586 0.18
587 0.17
588 0.19
589 0.17
590 0.16
591 0.16
592 0.13
593 0.14
594 0.14
595 0.13
596 0.13
597 0.12
598 0.13
599 0.12
600 0.14
601 0.13
602 0.19
603 0.23
604 0.27
605 0.28
606 0.32
607 0.36
608 0.35
609 0.37
610 0.35
611 0.35
612 0.34
613 0.38
614 0.39
615 0.37
616 0.38
617 0.36
618 0.37
619 0.35
620 0.35
621 0.31
622 0.26
623 0.24
624 0.21
625 0.19
626 0.14
627 0.1
628 0.07
629 0.05
630 0.04
631 0.03
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.05
636 0.07
637 0.09
638 0.1
639 0.15
640 0.25
641 0.34
642 0.37
643 0.4
644 0.42
645 0.43
646 0.47