Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GXR6

Protein Details
Accession C1GXR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
505-532QWEMHVKGRRHKRAVRSAEKRKERDEYFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-528KGRRHKRAVRSAEKRKER
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG pbl:PAAG_03639  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
PF12874  zf-met  
Amino Acid Sequences MLNLLRPLGMSSKVPAEPLIAVIGATGTGKSQLAIDLAARFNGEIINGDAMQMYRGLPIITNQIPVEVRQAIPHHLLGCIGFDQEPWRISHFKRECLRTIKEIRSRGKLPVLVGGTHYYTQAVLFKESILDRGEEGKSKSEGDGEEGEKVMAENTVEASKTTLRSEDFPILYESPEVILQKLREVDPVMASRWHPRDTRKIRRSLEIYLQTGKPASEIYQEQQRLKDATRKAHNSFEPDLSEEDSTAVTSTTSSANVTEAGQLRFPTLLFWVHTKDQELTHRLSQRVDNMADKGLVAEAESLFNYLNEKKAQGVDIDRTRGIWVSIGFKELEPYFHALSSSSSSSSSVNGGSGNAAAMTAVGATTPEQLARLKQTCLVSIKTATRQYSRQQIKWIRGRLWNALTDARATRQLYVLDSTDVTSNADAWDTAVRKPAERVVGAFLAGDSAGCPVPWELSETAREIFERELKILVGGAEGGEGGGRQRTVYRCSTCDMCGITVQSDEQWEMHVKGRRHKRAVRSAEKRKERDEYFEMRRERGEKGQGEPVNVDEGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.18
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.09
11 0.07
12 0.07
13 0.06
14 0.05
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.13
30 0.11
31 0.09
32 0.1
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.17
47 0.17
48 0.2
49 0.19
50 0.22
51 0.22
52 0.22
53 0.25
54 0.21
55 0.2
56 0.21
57 0.24
58 0.24
59 0.26
60 0.28
61 0.24
62 0.21
63 0.22
64 0.17
65 0.17
66 0.14
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.15
72 0.17
73 0.16
74 0.2
75 0.24
76 0.25
77 0.35
78 0.38
79 0.44
80 0.5
81 0.54
82 0.58
83 0.61
84 0.64
85 0.62
86 0.66
87 0.66
88 0.66
89 0.69
90 0.67
91 0.67
92 0.65
93 0.61
94 0.59
95 0.52
96 0.45
97 0.43
98 0.39
99 0.31
100 0.31
101 0.28
102 0.23
103 0.21
104 0.2
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.17
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.21
123 0.22
124 0.22
125 0.23
126 0.22
127 0.21
128 0.2
129 0.19
130 0.22
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.11
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.11
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.17
152 0.21
153 0.25
154 0.23
155 0.23
156 0.25
157 0.23
158 0.22
159 0.2
160 0.16
161 0.11
162 0.13
163 0.12
164 0.09
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.23
179 0.25
180 0.28
181 0.28
182 0.32
183 0.42
184 0.5
185 0.61
186 0.61
187 0.67
188 0.66
189 0.7
190 0.69
191 0.62
192 0.6
193 0.54
194 0.49
195 0.43
196 0.41
197 0.34
198 0.31
199 0.26
200 0.18
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.12
205 0.13
206 0.2
207 0.24
208 0.25
209 0.25
210 0.27
211 0.25
212 0.26
213 0.31
214 0.28
215 0.33
216 0.4
217 0.45
218 0.45
219 0.5
220 0.5
221 0.48
222 0.46
223 0.4
224 0.33
225 0.28
226 0.26
227 0.21
228 0.19
229 0.13
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.09
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.09
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.12
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.2
265 0.21
266 0.21
267 0.24
268 0.28
269 0.27
270 0.28
271 0.27
272 0.26
273 0.27
274 0.25
275 0.22
276 0.19
277 0.19
278 0.17
279 0.15
280 0.12
281 0.08
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.14
301 0.18
302 0.2
303 0.22
304 0.2
305 0.2
306 0.2
307 0.18
308 0.16
309 0.11
310 0.1
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.13
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.11
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.13
328 0.11
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.03
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.16
358 0.18
359 0.18
360 0.22
361 0.23
362 0.25
363 0.28
364 0.28
365 0.23
366 0.25
367 0.27
368 0.29
369 0.33
370 0.32
371 0.33
372 0.35
373 0.38
374 0.44
375 0.48
376 0.45
377 0.5
378 0.54
379 0.6
380 0.64
381 0.65
382 0.6
383 0.6
384 0.6
385 0.57
386 0.54
387 0.47
388 0.41
389 0.37
390 0.32
391 0.28
392 0.26
393 0.21
394 0.23
395 0.22
396 0.2
397 0.2
398 0.21
399 0.2
400 0.21
401 0.2
402 0.16
403 0.15
404 0.15
405 0.14
406 0.13
407 0.12
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.2
418 0.2
419 0.21
420 0.23
421 0.27
422 0.27
423 0.26
424 0.27
425 0.24
426 0.24
427 0.23
428 0.21
429 0.16
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.08
440 0.08
441 0.12
442 0.12
443 0.14
444 0.16
445 0.18
446 0.19
447 0.18
448 0.18
449 0.16
450 0.18
451 0.21
452 0.21
453 0.19
454 0.19
455 0.19
456 0.19
457 0.18
458 0.15
459 0.1
460 0.08
461 0.07
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.06
469 0.07
470 0.07
471 0.13
472 0.17
473 0.22
474 0.31
475 0.34
476 0.35
477 0.39
478 0.42
479 0.38
480 0.38
481 0.35
482 0.28
483 0.26
484 0.26
485 0.22
486 0.2
487 0.19
488 0.16
489 0.16
490 0.16
491 0.13
492 0.14
493 0.16
494 0.18
495 0.24
496 0.3
497 0.32
498 0.41
499 0.52
500 0.6
501 0.66
502 0.72
503 0.76
504 0.8
505 0.86
506 0.88
507 0.88
508 0.89
509 0.9
510 0.92
511 0.88
512 0.84
513 0.82
514 0.74
515 0.72
516 0.68
517 0.67
518 0.65
519 0.68
520 0.65
521 0.58
522 0.6
523 0.55
524 0.52
525 0.51
526 0.52
527 0.47
528 0.48
529 0.55
530 0.52
531 0.52
532 0.48
533 0.41