Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W9IK40

Protein Details
Accession W9IK40    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-262DVAGRVRSGRTPRKRRRRHAQTETQPETSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-252VRSGRTPRKRRRRH
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MVEKRPPSPGFISNPFIKRRNLEWTLDSPSPSQPPTTADIESGSATVEDHLSHFKAHLSSHILSQSPLSISSYTSLYTENFGSSAGAHFVIHQHDHPIAGTHYDLRLQINETSSASWAIMYGLPGDPQSIRLNRNATETRIHCLWNHLIETASTSTGSLLIWDTGTYSILPRQSKHAPATDPSSPTSSPGPSFAPTQQALLHAAFQNRKIRLRLHGSRLPDPYVLNLRLTRSEDVAGRVRSGRTPRKRRRRHAQTETQPETSGDDSESDESEDVPSNTDAGTNADNLSAMEREIRELEDEEVRRTNAYPGASNTIGSVHQRRWYLSLDRPACGFVEQRTKNRSVWELEDGTETKNKQSDNGRLSYPFHVRGPDHERSVLTGRLGADILQDEGVDKFIQRQGWKPVLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.59
3 0.58
4 0.56
5 0.54
6 0.52
7 0.56
8 0.54
9 0.52
10 0.5
11 0.51
12 0.52
13 0.5
14 0.47
15 0.39
16 0.39
17 0.38
18 0.34
19 0.3
20 0.25
21 0.26
22 0.29
23 0.3
24 0.26
25 0.23
26 0.23
27 0.22
28 0.21
29 0.18
30 0.13
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.09
37 0.12
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.16
42 0.17
43 0.17
44 0.2
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.29
49 0.26
50 0.25
51 0.25
52 0.23
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.11
64 0.13
65 0.13
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.11
77 0.13
78 0.15
79 0.14
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.14
91 0.15
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.12
103 0.1
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.11
115 0.16
116 0.18
117 0.2
118 0.24
119 0.27
120 0.27
121 0.34
122 0.33
123 0.3
124 0.33
125 0.33
126 0.33
127 0.31
128 0.31
129 0.25
130 0.27
131 0.28
132 0.23
133 0.23
134 0.18
135 0.17
136 0.16
137 0.18
138 0.14
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.2
160 0.24
161 0.28
162 0.3
163 0.32
164 0.29
165 0.3
166 0.34
167 0.32
168 0.3
169 0.26
170 0.26
171 0.22
172 0.22
173 0.21
174 0.18
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.16
180 0.15
181 0.17
182 0.16
183 0.17
184 0.16
185 0.15
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.12
190 0.15
191 0.15
192 0.18
193 0.23
194 0.24
195 0.27
196 0.27
197 0.28
198 0.31
199 0.39
200 0.41
201 0.42
202 0.44
203 0.45
204 0.48
205 0.48
206 0.43
207 0.36
208 0.3
209 0.25
210 0.26
211 0.23
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.19
216 0.22
217 0.2
218 0.16
219 0.17
220 0.16
221 0.18
222 0.22
223 0.2
224 0.19
225 0.2
226 0.19
227 0.22
228 0.29
229 0.36
230 0.42
231 0.53
232 0.62
233 0.72
234 0.82
235 0.88
236 0.91
237 0.92
238 0.93
239 0.92
240 0.92
241 0.9
242 0.9
243 0.85
244 0.75
245 0.64
246 0.53
247 0.45
248 0.35
249 0.25
250 0.15
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.09
278 0.08
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.22
289 0.22
290 0.21
291 0.21
292 0.22
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.2
297 0.25
298 0.24
299 0.24
300 0.21
301 0.19
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.2
306 0.24
307 0.26
308 0.27
309 0.29
310 0.33
311 0.35
312 0.38
313 0.45
314 0.42
315 0.41
316 0.41
317 0.39
318 0.34
319 0.3
320 0.25
321 0.2
322 0.28
323 0.32
324 0.39
325 0.44
326 0.47
327 0.47
328 0.5
329 0.49
330 0.43
331 0.43
332 0.42
333 0.38
334 0.35
335 0.38
336 0.34
337 0.32
338 0.32
339 0.28
340 0.25
341 0.27
342 0.26
343 0.28
344 0.35
345 0.42
346 0.43
347 0.46
348 0.45
349 0.44
350 0.48
351 0.49
352 0.47
353 0.41
354 0.37
355 0.39
356 0.37
357 0.42
358 0.47
359 0.47
360 0.44
361 0.43
362 0.42
363 0.41
364 0.44
365 0.39
366 0.31
367 0.28
368 0.25
369 0.23
370 0.23
371 0.19
372 0.16
373 0.14
374 0.15
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.1
381 0.09
382 0.13
383 0.17
384 0.23
385 0.25
386 0.31
387 0.39