FuNGI

W6QL63

Protein Details

Accession

W6QL63

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-49	LMRMRRPKAADPLVRPKRRPVPRPAGATP	Hydrophilic
134-156	ESQFTRPVRLHRRDPRSRTHDPN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
23-45	RMRRPKAADPLVRPKRRPVPRPA
406-428	EKREREARRVLGKGVRKALKRRE
461-502	RKKAEEEKNQKEALSKGGNTPSGRPKHTDALKKASAAGSRKR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSTPTNPSNARTPTGPNGAPLMRMRRPKAADPLVRPKRRPVPRPAGATPAGNGVATKTLPSRPQRPHNQAIFPSERPMLELSNNHMAANGFSGPLLSDKYVDYPVVTTKRALMEGLKHHIARFASKKSVDPRDESQFTRPVRLHRRDPRSRTHDPNSGRSEIDGQPMDEAEREAFDARKAAREKERAENLSQIAPALGSTSKRPNAPKQKTQQVFKSDMTPEEIARARIKYEEALPWHLEDFDNQHTWVGNYEAALSETHAIFVLDNGKMRMIPAEKWYKFNAKSNFKALTIDEAEKFMAKRVKDPRWFMEKQQQLEQEKELETYAKQRKVYAGKQGTTAGKGAGLEAGEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEDAKDAEKRIKEDQLKANVFNLKDEKEYDAEEMREKREREARRVLGKGVRKALKRRERNFDYSSGSDVNPYTDEESSDDSETERAKEEERKKAEEEKNQKEALSKGGNTPSGRPKHTDALKKASAAGSRKRLGSPNASDASGTDTSRKKAKNMHLPASQPPSRPISPSALQGKKRVRNIAGGAGSGSDGDTAAGSGAEMTEGGKIKKLKLNPPTSVSRGGTPQGSRGASPLPRLSGSRANSPDGPRGLRMSTPVSGNQTFPTAGEIHAAIPASGILSSDLLKVFRPRIGESKENHRRFIAIVKDVSVYGKEDRMLRPGPWKGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.46
3	0.39
4	0.4
5	0.38
6	0.39
7	0.39
8	0.4
9	0.4
10	0.48
11	0.5
12	0.54
13	0.59
14	0.61
15	0.66
16	0.67
17	0.69
18	0.69
19	0.76
20	0.78
21	0.81
22	0.77
23	0.77
24	0.77
25	0.78
26	0.78
27	0.78
28	0.78
29	0.77
30	0.83
31	0.76
32	0.73
33	0.65
34	0.58
35	0.48
36	0.41
37	0.33
38	0.25
39	0.22
40	0.15
41	0.16
42	0.14
43	0.15
44	0.15
45	0.19
46	0.27
47	0.34
48	0.43
49	0.49
50	0.6
51	0.69
52	0.74
53	0.79
54	0.79
55	0.79
56	0.74
57	0.73
58	0.69
59	0.59
60	0.55
61	0.47
62	0.4
63	0.34
64	0.32
65	0.26
66	0.24
67	0.25
68	0.26
69	0.32
70	0.33
71	0.31
72	0.3
73	0.28
74	0.24
75	0.24
76	0.19
77	0.1
78	0.09
79	0.1
80	0.09
81	0.1
82	0.12
83	0.09
84	0.1
85	0.11
86	0.13
87	0.15
88	0.15
89	0.14
90	0.13
91	0.2
92	0.23
93	0.24
94	0.22
95	0.23
96	0.26
97	0.26
98	0.25
99	0.21
100	0.24
101	0.29
102	0.35
103	0.36
104	0.34
105	0.34
106	0.37
107	0.34
108	0.35
109	0.36
110	0.35
111	0.38
112	0.39
113	0.45
114	0.49
115	0.58
116	0.54
117	0.53
118	0.53
119	0.55
120	0.57
121	0.54
122	0.5
123	0.48
124	0.46
125	0.47
126	0.44
127	0.45
128	0.52
129	0.57
130	0.62
131	0.65
132	0.74
133	0.77
134	0.81
135	0.82
136	0.8
137	0.81
138	0.79
139	0.77
140	0.75
141	0.69
142	0.72
143	0.67
144	0.61
145	0.52
146	0.44
147	0.42
148	0.35
149	0.36
150	0.28
151	0.22
152	0.2
153	0.2
154	0.2
155	0.15
156	0.14
157	0.09
158	0.08
159	0.09
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.14
164	0.14
165	0.21
166	0.23
167	0.28
168	0.35
169	0.41
170	0.45
171	0.5
172	0.58
173	0.54
174	0.53
175	0.52
176	0.45
177	0.4
178	0.36
179	0.26
180	0.18
181	0.15
182	0.12
183	0.09
184	0.09
185	0.08
186	0.11
187	0.18
188	0.21
189	0.26
190	0.31
191	0.4
192	0.5
193	0.57
194	0.64
195	0.66
196	0.73
197	0.75
198	0.76
199	0.73
200	0.68
201	0.65
202	0.57
203	0.54
204	0.45
205	0.4
206	0.38
207	0.31
208	0.25
209	0.24
210	0.25
211	0.21
212	0.22
213	0.21
214	0.17
215	0.17
216	0.18
217	0.16
218	0.17
219	0.19
220	0.19
221	0.23
222	0.23
223	0.22
224	0.22
225	0.21
226	0.18
227	0.14
228	0.15
229	0.15
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.15
234	0.15
235	0.15
236	0.12
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.09
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.1
258	0.12
259	0.11
260	0.12
261	0.18
262	0.28
263	0.29
264	0.31
265	0.34
266	0.38
267	0.39
268	0.46
269	0.48
270	0.46
271	0.48
272	0.5
273	0.49
274	0.42
275	0.41
276	0.34
277	0.29
278	0.25
279	0.23
280	0.18
281	0.17
282	0.17
283	0.16
284	0.16
285	0.15
286	0.16
287	0.14
288	0.21
289	0.29
290	0.38
291	0.43
292	0.47
293	0.49
294	0.54
295	0.56
296	0.52
297	0.53
298	0.49
299	0.45
300	0.47
301	0.47
302	0.41
303	0.41
304	0.38
305	0.31
306	0.26
307	0.24
308	0.18
309	0.13
310	0.11
311	0.19
312	0.24
313	0.26
314	0.26
315	0.27
316	0.32
317	0.37
318	0.4
319	0.41
320	0.4
321	0.37
322	0.38
323	0.41
324	0.36
325	0.31
326	0.28
327	0.18
328	0.12
329	0.11
330	0.1
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.03
337	0.03
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.07
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.07
357	0.05
358	0.04
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.07
363	0.09
364	0.12
365	0.14
366	0.17
367	0.19
368	0.26
369	0.29
370	0.35
371	0.41
372	0.45
373	0.46
374	0.44
375	0.44
376	0.4
377	0.36
378	0.32
379	0.28
380	0.2
381	0.19
382	0.2
383	0.18
384	0.16
385	0.17
386	0.16
387	0.15
388	0.15
389	0.18
390	0.19
391	0.2
392	0.25
393	0.25
394	0.27
395	0.33
396	0.37
397	0.4
398	0.47
399	0.5
400	0.51
401	0.52
402	0.51
403	0.5
404	0.51
405	0.49
406	0.47
407	0.47
408	0.45
409	0.51
410	0.58
411	0.62
412	0.66
413	0.68
414	0.71
415	0.72
416	0.75
417	0.7
418	0.64
419	0.59
420	0.49
421	0.45
422	0.37
423	0.3
424	0.24
425	0.21
426	0.17
427	0.13
428	0.13
429	0.12
430	0.1
431	0.11
432	0.11
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.13
437	0.12
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.13
442	0.12
443	0.14
444	0.23
445	0.3
446	0.37
447	0.41
448	0.44
449	0.45
450	0.55
451	0.59
452	0.6
453	0.63
454	0.61
455	0.63
456	0.6
457	0.57
458	0.5
459	0.44
460	0.4
461	0.34
462	0.27
463	0.26
464	0.28
465	0.32
466	0.3
467	0.34
468	0.37
469	0.38
470	0.39
471	0.39
472	0.39
473	0.44
474	0.5
475	0.54
476	0.51
477	0.53
478	0.53
479	0.5
480	0.48
481	0.42
482	0.4
483	0.37
484	0.39
485	0.39
486	0.39
487	0.41
488	0.42
489	0.43
490	0.42
491	0.44
492	0.42
493	0.41
494	0.4
495	0.38
496	0.35
497	0.3
498	0.32
499	0.26
500	0.22
501	0.21
502	0.22
503	0.24
504	0.32
505	0.33
506	0.32
507	0.39
508	0.48
509	0.53
510	0.58
511	0.63
512	0.61
513	0.63
514	0.65
515	0.65
516	0.6
517	0.5
518	0.46
519	0.44
520	0.4
521	0.39
522	0.36
523	0.34
524	0.32
525	0.38
526	0.44
527	0.45
528	0.47
529	0.53
530	0.59
531	0.6
532	0.65
533	0.64
534	0.57
535	0.56
536	0.56
537	0.55
538	0.47
539	0.4
540	0.33
541	0.26
542	0.24
543	0.17
544	0.14
545	0.06
546	0.05
547	0.05
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.04
558	0.07
559	0.09
560	0.1
561	0.15
562	0.17
563	0.22
564	0.28
565	0.34
566	0.4
567	0.48
568	0.56
569	0.56
570	0.6
571	0.62
572	0.6
573	0.6
574	0.53
575	0.46
576	0.41
577	0.38
578	0.38
579	0.32
580	0.32
581	0.31
582	0.31
583	0.28
584	0.26
585	0.3
586	0.28
587	0.32
588	0.31
589	0.28
590	0.28
591	0.3
592	0.33
593	0.35
594	0.36
595	0.4
596	0.4
597	0.41
598	0.45
599	0.47
600	0.49
601	0.46
602	0.45
603	0.38
604	0.39
605	0.36
606	0.32
607	0.32
608	0.29
609	0.28
610	0.28
611	0.29
612	0.33
613	0.32
614	0.32
615	0.3
616	0.28
617	0.25
618	0.22
619	0.22
620	0.16
621	0.15
622	0.15
623	0.14
624	0.12
625	0.14
626	0.14
627	0.1
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.07
633	0.06
634	0.07
635	0.08
636	0.1
637	0.11
638	0.11
639	0.14
640	0.19
641	0.21
642	0.23
643	0.26
644	0.28
645	0.36
646	0.43
647	0.48
648	0.47
649	0.56
650	0.64
651	0.65
652	0.64
653	0.56
654	0.5
655	0.45
656	0.49
657	0.45
658	0.41
659	0.38
660	0.37
661	0.37
662	0.36
663	0.35
664	0.29
665	0.24
666	0.2
667	0.21
668	0.22
669	0.26
670	0.28
671	0.33
672	0.35
673	0.35
674	0.41

W6QL63

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer