Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Q8M6

Protein Details
Accession W6Q8M6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-27VTDSSSKKRKSGKNASGPSSKRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-27KKRKSGKNASGPSSKRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPALVTDSSSKKRKSGKNASGPSSKRRAVAEDNFAEKLSTIQELENQIAESRKGYNNIATLLSMLNVENNAEKPEMAVAVSLCRVFSRLIAGGNLTESSRAAENEKIVVAWLKERCLDYQNALVAIMREADASSQIAALALSMRIVKERLAHIPGAENNVWSTGFFKDIFAAIIEAHNGQDLQSEAITKFVKEYEDVRYHTFTQMADYASTKRSPEVLEILIKILQACDEVPGPEHKFENFYAKRDTKNKRLVSANSHRKQAQEAWLAILRNNLSQSQRKNLLRMMVHNIEPWFNRPELLMDFLTDSYNVGGATSLLALSGLFYLIQEKNLDYPQFYAKLYSLLDSELLHSKHRSRFFRLLNTFLSSTHLPSTLVASFIKRLARLALNAPPSAIVVIVPFMYNFFKEHPTTTFMMHRSIRDKDLLAEVEKEGMDDPFDPNEPDPNMTNAIESSLWEIETLQSHFHPNVAAIARIISEQFTKQSYSLEDFLDHTYAGMVTADLGVEERNLKKIPVVEYMIPKRIFTDRLLEEDGGVDSGPGCFMRDLWEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.73
3 0.76
4 0.78
5 0.85
6 0.85
7 0.85
8 0.81
9 0.78
10 0.76
11 0.68
12 0.61
13 0.55
14 0.54
15 0.53
16 0.56
17 0.57
18 0.54
19 0.54
20 0.51
21 0.49
22 0.42
23 0.33
24 0.27
25 0.19
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.17
30 0.2
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.17
38 0.2
39 0.22
40 0.24
41 0.26
42 0.28
43 0.29
44 0.3
45 0.29
46 0.24
47 0.21
48 0.18
49 0.16
50 0.13
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.1
65 0.08
66 0.1
67 0.12
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.16
96 0.14
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.21
101 0.22
102 0.24
103 0.25
104 0.27
105 0.23
106 0.26
107 0.26
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.17
112 0.15
113 0.13
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.05
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.12
135 0.15
136 0.19
137 0.21
138 0.21
139 0.2
140 0.24
141 0.25
142 0.27
143 0.24
144 0.2
145 0.17
146 0.18
147 0.17
148 0.13
149 0.13
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.12
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.15
181 0.18
182 0.23
183 0.25
184 0.27
185 0.29
186 0.29
187 0.29
188 0.28
189 0.21
190 0.18
191 0.18
192 0.16
193 0.14
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.17
198 0.15
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.14
210 0.12
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.26
227 0.24
228 0.25
229 0.31
230 0.33
231 0.38
232 0.45
233 0.5
234 0.49
235 0.57
236 0.57
237 0.54
238 0.57
239 0.54
240 0.55
241 0.59
242 0.6
243 0.54
244 0.56
245 0.52
246 0.47
247 0.46
248 0.41
249 0.37
250 0.3
251 0.27
252 0.26
253 0.27
254 0.26
255 0.24
256 0.22
257 0.16
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.19
263 0.2
264 0.24
265 0.31
266 0.31
267 0.33
268 0.32
269 0.34
270 0.3
271 0.31
272 0.32
273 0.27
274 0.26
275 0.26
276 0.25
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.16
281 0.14
282 0.13
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.15
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.09
293 0.09
294 0.05
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.14
318 0.14
319 0.11
320 0.13
321 0.15
322 0.16
323 0.16
324 0.15
325 0.13
326 0.15
327 0.15
328 0.14
329 0.11
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.11
334 0.13
335 0.14
336 0.15
337 0.17
338 0.22
339 0.28
340 0.36
341 0.39
342 0.41
343 0.49
344 0.52
345 0.6
346 0.58
347 0.56
348 0.5
349 0.49
350 0.42
351 0.34
352 0.32
353 0.23
354 0.21
355 0.18
356 0.16
357 0.13
358 0.13
359 0.15
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.12
365 0.15
366 0.16
367 0.14
368 0.14
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.2
373 0.23
374 0.24
375 0.24
376 0.24
377 0.2
378 0.19
379 0.17
380 0.13
381 0.07
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.11
392 0.15
393 0.16
394 0.19
395 0.19
396 0.23
397 0.24
398 0.25
399 0.29
400 0.26
401 0.31
402 0.31
403 0.33
404 0.33
405 0.35
406 0.35
407 0.32
408 0.32
409 0.27
410 0.3
411 0.28
412 0.25
413 0.23
414 0.21
415 0.2
416 0.19
417 0.17
418 0.13
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.11
423 0.11
424 0.12
425 0.13
426 0.14
427 0.19
428 0.19
429 0.2
430 0.2
431 0.2
432 0.23
433 0.21
434 0.21
435 0.16
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.14
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.13
449 0.17
450 0.17
451 0.17
452 0.16
453 0.14
454 0.18
455 0.18
456 0.17
457 0.14
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.14
462 0.1
463 0.11
464 0.12
465 0.14
466 0.15
467 0.17
468 0.17
469 0.19
470 0.21
471 0.24
472 0.25
473 0.23
474 0.23
475 0.23
476 0.24
477 0.23
478 0.19
479 0.14
480 0.12
481 0.11
482 0.1
483 0.08
484 0.06
485 0.05
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.11
493 0.12
494 0.17
495 0.18
496 0.18
497 0.21
498 0.26
499 0.29
500 0.31
501 0.35
502 0.36
503 0.45
504 0.51
505 0.56
506 0.51
507 0.47
508 0.44
509 0.43
510 0.41
511 0.34
512 0.36
513 0.31
514 0.36
515 0.4
516 0.37
517 0.32
518 0.31
519 0.29
520 0.2
521 0.17
522 0.11
523 0.07
524 0.07
525 0.08
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.09