Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6QMX6

Protein Details
Accession W6QMX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-261IQKAEEVRLKKRKERRGGDDDADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-254LKKRKERR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MVRTRNADKSAKDEASQEQFIEPPTENTSESPVATSEDKAETRTDETKDDAASKARERMNRFKALQARAKNATERNLKETAAESQRLTTDPALLNTLSRKHAFASHNLLKADTEAEGEDFERKRAWDWTVDESEKWDRRMEKKQRHRDDVAFQDYTQDARKIYKRQLREMAPNLESYEKDKLAAIERAAANGDLEIVETEDGEMIAIDKNGSFYSTADSTGFTESKPDRAAVDRLVNDIQKAEEVRLKKRKERRGGDDDADVTYINEKNRQFNQKLARFYNKYTTEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.42
4 0.36
5 0.29
6 0.28
7 0.28
8 0.28
9 0.22
10 0.18
11 0.21
12 0.22
13 0.22
14 0.22
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.21
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.16
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.24
30 0.28
31 0.28
32 0.25
33 0.28
34 0.29
35 0.29
36 0.28
37 0.25
38 0.25
39 0.27
40 0.28
41 0.32
42 0.35
43 0.4
44 0.45
45 0.54
46 0.56
47 0.61
48 0.59
49 0.6
50 0.63
51 0.64
52 0.65
53 0.6
54 0.59
55 0.55
56 0.56
57 0.55
58 0.5
59 0.51
60 0.51
61 0.48
62 0.47
63 0.44
64 0.41
65 0.36
66 0.35
67 0.33
68 0.29
69 0.29
70 0.24
71 0.23
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.24
89 0.24
90 0.27
91 0.33
92 0.35
93 0.38
94 0.38
95 0.37
96 0.3
97 0.29
98 0.25
99 0.15
100 0.1
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.13
111 0.15
112 0.16
113 0.17
114 0.2
115 0.24
116 0.28
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.33
121 0.3
122 0.29
123 0.27
124 0.27
125 0.32
126 0.43
127 0.5
128 0.53
129 0.62
130 0.71
131 0.76
132 0.78
133 0.77
134 0.7
135 0.66
136 0.62
137 0.56
138 0.46
139 0.37
140 0.32
141 0.28
142 0.25
143 0.21
144 0.15
145 0.1
146 0.14
147 0.19
148 0.22
149 0.3
150 0.35
151 0.38
152 0.43
153 0.5
154 0.5
155 0.53
156 0.54
157 0.51
158 0.45
159 0.42
160 0.37
161 0.31
162 0.27
163 0.22
164 0.2
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.17
170 0.19
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.12
206 0.13
207 0.16
208 0.16
209 0.12
210 0.18
211 0.17
212 0.21
213 0.21
214 0.21
215 0.19
216 0.23
217 0.26
218 0.24
219 0.3
220 0.27
221 0.29
222 0.31
223 0.29
224 0.26
225 0.24
226 0.2
227 0.16
228 0.16
229 0.16
230 0.18
231 0.22
232 0.31
233 0.39
234 0.46
235 0.52
236 0.61
237 0.69
238 0.75
239 0.8
240 0.8
241 0.8
242 0.81
243 0.75
244 0.7
245 0.61
246 0.51
247 0.42
248 0.32
249 0.24
250 0.2
251 0.2
252 0.17
253 0.22
254 0.23
255 0.3
256 0.38
257 0.47
258 0.46
259 0.52
260 0.61
261 0.62
262 0.68
263 0.68
264 0.7
265 0.64
266 0.67
267 0.68
268 0.61
269 0.58
270 0.54
271 0.53
272 0.52
273 0.49
274 0.48
275 0.43
276 0.43
277 0.41