Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CM13

Protein Details
Accession Q6CM13    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
357-381GNVDAQRHLKSRRKNNKGDKTLSLYHydrophilic
420-440IWYVPSPKIVQWKKPNQKKRNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-375KSRRKNNKGD
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG kla:KLLA0_E23849g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MSDNEETFNDSDVEGDELLQDWSLATKIIGDNKNVIPLRGEKDYEPDGTGMQGSMLFKAKKVMFDVLRQPDRGTIIKNQVKAYYDLDLHVATIKFPKGTFTNTVGSPNSDGTLTLQFHEFVYLVERGSVSPIIDLGINGEKEEYLLSLQDVYSFFKSQDELDEFFVYAYLKRMGYIVFPTNWKYGKQLSVYSRYNKGENRFQNTYLLLNGIFNLFTNISYSWLKDWATNINNIISFHPVKFASSGAIFESINKTITFYAPPKSQKQLLESHGVDLNAPVSSNYKIAFDVWKPNPSFKKSNRYLPDFQIVIHNKNSKKAEFPNLKDFKGIFQRLDHKFPFINDVDIAEEKVTKSNKTGNVDAQRHLKSRRKNNKGDKTLSLYARKMKRIKEGYRSFLLAVMDGGLVSIVKITETDFGSENIWYVPSPKIVQWKKPNQKKRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.09
4 0.09
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.06
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.09
14 0.13
15 0.22
16 0.25
17 0.26
18 0.32
19 0.32
20 0.41
21 0.39
22 0.36
23 0.3
24 0.33
25 0.36
26 0.35
27 0.36
28 0.28
29 0.34
30 0.36
31 0.35
32 0.3
33 0.26
34 0.22
35 0.2
36 0.2
37 0.14
38 0.11
39 0.11
40 0.1
41 0.12
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.25
46 0.26
47 0.27
48 0.3
49 0.35
50 0.32
51 0.38
52 0.47
53 0.49
54 0.52
55 0.5
56 0.47
57 0.42
58 0.43
59 0.39
60 0.34
61 0.31
62 0.37
63 0.41
64 0.44
65 0.44
66 0.43
67 0.43
68 0.42
69 0.37
70 0.3
71 0.26
72 0.23
73 0.22
74 0.19
75 0.17
76 0.18
77 0.16
78 0.13
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.19
84 0.18
85 0.22
86 0.26
87 0.26
88 0.29
89 0.28
90 0.32
91 0.3
92 0.29
93 0.26
94 0.22
95 0.18
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.14
107 0.08
108 0.11
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.08
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.11
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.12
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.18
149 0.18
150 0.17
151 0.17
152 0.17
153 0.12
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.13
163 0.14
164 0.13
165 0.15
166 0.18
167 0.21
168 0.22
169 0.21
170 0.2
171 0.21
172 0.24
173 0.24
174 0.27
175 0.28
176 0.35
177 0.38
178 0.39
179 0.42
180 0.4
181 0.42
182 0.4
183 0.4
184 0.42
185 0.43
186 0.47
187 0.43
188 0.42
189 0.41
190 0.37
191 0.33
192 0.24
193 0.19
194 0.12
195 0.09
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.07
204 0.06
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.15
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.1
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.14
244 0.13
245 0.17
246 0.22
247 0.26
248 0.29
249 0.32
250 0.36
251 0.35
252 0.37
253 0.39
254 0.37
255 0.4
256 0.36
257 0.34
258 0.31
259 0.29
260 0.24
261 0.18
262 0.16
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.14
274 0.14
275 0.23
276 0.25
277 0.31
278 0.31
279 0.38
280 0.43
281 0.46
282 0.53
283 0.5
284 0.58
285 0.57
286 0.66
287 0.66
288 0.68
289 0.66
290 0.62
291 0.61
292 0.5
293 0.45
294 0.44
295 0.4
296 0.36
297 0.37
298 0.4
299 0.35
300 0.42
301 0.45
302 0.37
303 0.4
304 0.43
305 0.47
306 0.5
307 0.54
308 0.58
309 0.58
310 0.57
311 0.54
312 0.49
313 0.44
314 0.45
315 0.42
316 0.33
317 0.33
318 0.42
319 0.44
320 0.5
321 0.45
322 0.39
323 0.38
324 0.37
325 0.38
326 0.3
327 0.28
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.19
332 0.19
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.17
337 0.18
338 0.17
339 0.19
340 0.26
341 0.32
342 0.37
343 0.4
344 0.43
345 0.51
346 0.54
347 0.55
348 0.55
349 0.53
350 0.53
351 0.58
352 0.57
353 0.57
354 0.65
355 0.72
356 0.74
357 0.8
358 0.86
359 0.89
360 0.9
361 0.87
362 0.81
363 0.79
364 0.76
365 0.72
366 0.67
367 0.61
368 0.6
369 0.61
370 0.63
371 0.62
372 0.6
373 0.64
374 0.67
375 0.71
376 0.73
377 0.74
378 0.72
379 0.7
380 0.67
381 0.57
382 0.5
383 0.42
384 0.31
385 0.23
386 0.17
387 0.12
388 0.1
389 0.09
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.1
399 0.11
400 0.14
401 0.14
402 0.15
403 0.17
404 0.17
405 0.16
406 0.13
407 0.13
408 0.11
409 0.12
410 0.14
411 0.17
412 0.19
413 0.23
414 0.33
415 0.39
416 0.49
417 0.58
418 0.67
419 0.74
420 0.82