Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6PQM6

Protein Details
Accession W6PQM6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAKASSKKTSVKKTDSSKTKSIHydrophilic
358-386LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-263KKALKKAKK
364-376KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKASSKKTSVKKTDSSKTKSIPPQLIASVAAFLSDNFPQTSVAFTKEATKSGKQSDAKNVPSLLELFQASEQKSSVKKSASPSSSSSSSSSSDSDSDVEMGEATRSSSSSSSSSSSSSSSSDSDADDEDDDDKSPAAPTSAPSSAPAQKSAGVKRKAESSSESSSSSDSNSSSSSEDDSPKAKKAKTSPTPKEASSSSSSDSSSSDSDSSSSSSSDSSSDSSSDSSSDSSSESSSDSSSESESESESESEKESKKALKKAKKTPLPESDSSSDSESSSSGSTLAASPETETKPTKKAVETVQTTSSSASPAPGNGPAKKKHTGARPTPLALLSELPHDHPSNDYMSYAYADRAWKDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIAPGTTSYKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.81
4 0.79
5 0.74
6 0.75
7 0.75
8 0.75
9 0.71
10 0.64
11 0.61
12 0.54
13 0.5
14 0.42
15 0.34
16 0.26
17 0.18
18 0.16
19 0.11
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.17
29 0.16
30 0.18
31 0.17
32 0.17
33 0.24
34 0.25
35 0.3
36 0.31
37 0.33
38 0.35
39 0.4
40 0.49
41 0.45
42 0.49
43 0.55
44 0.58
45 0.57
46 0.55
47 0.51
48 0.42
49 0.4
50 0.36
51 0.26
52 0.2
53 0.17
54 0.14
55 0.16
56 0.2
57 0.19
58 0.18
59 0.18
60 0.19
61 0.22
62 0.25
63 0.28
64 0.27
65 0.3
66 0.36
67 0.45
68 0.45
69 0.45
70 0.45
71 0.45
72 0.44
73 0.42
74 0.37
75 0.3
76 0.28
77 0.26
78 0.24
79 0.2
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.11
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.12
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.18
132 0.23
133 0.23
134 0.24
135 0.2
136 0.22
137 0.27
138 0.33
139 0.38
140 0.37
141 0.38
142 0.38
143 0.43
144 0.41
145 0.38
146 0.35
147 0.32
148 0.32
149 0.32
150 0.32
151 0.26
152 0.25
153 0.23
154 0.2
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.18
167 0.18
168 0.23
169 0.27
170 0.25
171 0.28
172 0.33
173 0.41
174 0.47
175 0.56
176 0.57
177 0.6
178 0.62
179 0.57
180 0.53
181 0.44
182 0.39
183 0.31
184 0.27
185 0.21
186 0.2
187 0.2
188 0.17
189 0.17
190 0.15
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.18
241 0.24
242 0.29
243 0.37
244 0.46
245 0.51
246 0.59
247 0.68
248 0.76
249 0.77
250 0.77
251 0.78
252 0.77
253 0.75
254 0.67
255 0.63
256 0.55
257 0.49
258 0.44
259 0.37
260 0.28
261 0.21
262 0.19
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.13
276 0.14
277 0.17
278 0.19
279 0.22
280 0.25
281 0.29
282 0.32
283 0.29
284 0.33
285 0.37
286 0.43
287 0.44
288 0.44
289 0.44
290 0.41
291 0.39
292 0.36
293 0.29
294 0.21
295 0.17
296 0.15
297 0.11
298 0.11
299 0.13
300 0.18
301 0.22
302 0.27
303 0.33
304 0.37
305 0.42
306 0.46
307 0.49
308 0.49
309 0.55
310 0.59
311 0.61
312 0.65
313 0.64
314 0.61
315 0.59
316 0.53
317 0.45
318 0.36
319 0.29
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.18
324 0.21
325 0.21
326 0.21
327 0.2
328 0.22
329 0.2
330 0.2
331 0.18
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.16
339 0.17
340 0.19
341 0.19
342 0.18
343 0.2
344 0.24
345 0.28
346 0.34
347 0.35
348 0.35
349 0.4
350 0.41
351 0.45
352 0.49
353 0.51
354 0.54
355 0.62
356 0.7
357 0.76
358 0.85
359 0.86
360 0.9
361 0.91
362 0.9
363 0.9
364 0.89
365 0.88
366 0.88
367 0.82
368 0.72
369 0.62
370 0.57
371 0.46
372 0.38
373 0.28
374 0.19
375 0.2
376 0.2