FuNGI

Q6CKX0

Protein Details

Accession

Q6CKX0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-122	GVAPRAKMNQQRARRFRSAR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	kla:KLLA0_F07469g -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPSFFRWLSRKYPKIISPVLEEYPVIEDGVQLPLDYSSANPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPETEDEMLLAVFEYTNRVLNMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSARDAKLQNEAREQVLREREDYGETIDENVKSKKTWDSNAITPGTPFMDKLATALRYWTSFKLATDPGWKNLQIIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRADTQYNPNTTHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFKILREDVFANNNYKKPKPQDMINLSEEEKQQLIQQDSEKPFLWLHISVLREYLSAELAIPHLSFQFDFERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRENSIDILVDIWKTVLPKTKTYLTCDGTLNLEPVEALLEQLGDRETDLFKKKYIQEVRKQEAHDRRKKLKSNPNVSQGKVDRNFMIPLENMPVYDVDGNAAEGSLNLSNKDFANMRKEINLANEGDGEAAKALKLKSEKNSGVVEFSSEELKNSVQLSKTANYDAATSLQEKLIAKKMAMRDEENAEELSLKRKSEDVDSAEKETSNEPEDDEADYDEDEGSTVPPAVIHTGIVKSGFIDTDESVRLYEPGYHDRYYQHKFHVPAKDIPALQKDVIRCYVEGISWVLLYYYQGCASWTWYYPYHYAPFAQDFKNIKNLDIHFDLGEPFLPYEQLMSVLPAASGHALPEIFRPLMSDPNSEIIDFYPEEFPVDMNGKKMAWQGIALLPFIDETRLLKTVREQYSKLSDSEKARNVRKKDALLISNKNVNYDLFMKNLYGENPVNVIEFRHFKSGLSGFVTQAEEGFELNSKLICPINGGGLPDLSTNLFLKLSYTQPVVAGRCKSLVLNGYIPPQPMLTPQDRDCIIYKYSNRWNPSMMKYNIVPVGPSGITQYQPRVGGYRSFFFHKEQTAYAQQPQQNREYMHSQQRQPQGSRYQQSRYNNGNYNNSNNGYSDNNNGNTGKYNRHYNNSRGNSNRYSNSNDRRREFRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.64
3	0.68
4	0.69
5	0.62
6	0.58
7	0.57
8	0.53
9	0.45
10	0.39
11	0.32
12	0.29
13	0.25
14	0.18
15	0.13
16	0.11
17	0.11
18	0.14
19	0.13
20	0.09
21	0.1
22	0.09
23	0.1
24	0.09
25	0.09
26	0.13
27	0.17
28	0.17
29	0.17
30	0.18
31	0.19
32	0.2
33	0.2
34	0.14
35	0.13
36	0.14
37	0.13
38	0.12
39	0.11
40	0.1
41	0.09
42	0.09
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.1
47	0.13
48	0.18
49	0.24
50	0.27
51	0.36
52	0.46
53	0.52
54	0.58
55	0.58
56	0.58
57	0.59
58	0.59
59	0.51
60	0.43
61	0.37
62	0.31
63	0.27
64	0.21
65	0.15
66	0.1
67	0.09
68	0.06
69	0.08
70	0.09
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.2
76	0.31
77	0.37
78	0.4
79	0.4
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.42
84	0.33
85	0.3
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.21
90	0.2
91	0.18
92	0.15
93	0.1
94	0.13
95	0.19
96	0.26
97	0.36
98	0.45
99	0.54
100	0.65
101	0.74
102	0.79
103	0.82
104	0.8
105	0.77
106	0.79
107	0.79
108	0.76
109	0.77
110	0.75
111	0.68
112	0.72
113	0.71
114	0.63
115	0.6
116	0.54
117	0.47
118	0.44
119	0.43
120	0.4
121	0.42
122	0.39
123	0.34
124	0.35
125	0.33
126	0.31
127	0.3
128	0.25
129	0.2
130	0.18
131	0.19
132	0.2
133	0.2
134	0.21
135	0.23
136	0.21
137	0.2
138	0.23
139	0.29
140	0.32
141	0.36
142	0.41
143	0.44
144	0.48
145	0.54
146	0.54
147	0.45
148	0.39
149	0.36
150	0.3
151	0.24
152	0.19
153	0.14
154	0.13
155	0.12
156	0.14
157	0.17
158	0.16
159	0.16
160	0.18
161	0.18
162	0.19
163	0.22
164	0.22
165	0.21
166	0.21
167	0.21
168	0.25
169	0.25
170	0.26
171	0.33
172	0.34
173	0.33
174	0.36
175	0.36
176	0.31
177	0.32
178	0.31
179	0.21
180	0.21
181	0.18
182	0.15
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.13
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.29
201	0.33
202	0.36
203	0.4
204	0.42
205	0.42
206	0.49
207	0.47
208	0.5
209	0.49
210	0.43
211	0.42
212	0.39
213	0.37
214	0.27
215	0.22
216	0.17
217	0.17
218	0.17
219	0.13
220	0.12
221	0.1
222	0.1
223	0.08
224	0.07
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.05
230	0.06
231	0.08
232	0.09
233	0.12
234	0.14
235	0.15
236	0.18
237	0.21
238	0.23
239	0.24
240	0.26
241	0.26
242	0.29
243	0.31
244	0.33
245	0.32
246	0.34
247	0.36
248	0.37
249	0.41
250	0.43
251	0.5
252	0.49
253	0.51
254	0.57
255	0.59
256	0.62
257	0.57
258	0.53
259	0.44
260	0.44
261	0.38
262	0.29
263	0.23
264	0.17
265	0.17
266	0.2
267	0.21
268	0.19
269	0.22
270	0.29
271	0.31
272	0.34
273	0.31
274	0.28
275	0.26
276	0.24
277	0.24
278	0.16
279	0.16
280	0.17
281	0.17
282	0.16
283	0.17
284	0.16
285	0.13
286	0.13
287	0.12
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.09
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.14
305	0.14
306	0.16
307	0.14
308	0.12
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.08
313	0.08
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.15
328	0.18
329	0.17
330	0.17
331	0.2
332	0.2
333	0.19
334	0.19
335	0.14
336	0.1
337	0.1
338	0.09
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.07
344	0.09
345	0.16
346	0.18
347	0.2
348	0.24
349	0.32
350	0.33
351	0.39
352	0.44
353	0.39
354	0.39
355	0.38
356	0.35
357	0.29
358	0.28
359	0.22
360	0.15
361	0.12
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.05
366	0.05
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.06
376	0.11
377	0.16
378	0.17
379	0.17
380	0.23
381	0.26
382	0.34
383	0.43
384	0.47
385	0.51
386	0.6
387	0.64
388	0.63
389	0.63
390	0.62
391	0.63
392	0.65
393	0.65
394	0.63
395	0.67
396	0.71
397	0.77
398	0.78
399	0.78
400	0.77
401	0.78
402	0.77
403	0.77
404	0.73
405	0.66
406	0.63
407	0.56
408	0.54
409	0.46
410	0.4
411	0.31
412	0.29
413	0.29
414	0.22
415	0.21
416	0.13
417	0.12
418	0.13
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.08
426	0.05
427	0.05
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.04
432	0.03
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.16
444	0.18
445	0.18
446	0.19
447	0.2
448	0.19
449	0.2
450	0.2
451	0.15
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.11
456	0.09
457	0.07
458	0.05
459	0.04
460	0.04
461	0.06
462	0.06
463	0.08
464	0.11
465	0.14
466	0.18
467	0.26
468	0.26
469	0.27
470	0.29
471	0.27
472	0.25
473	0.22
474	0.19
475	0.12
476	0.12
477	0.11
478	0.1
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.09
486	0.11
487	0.14
488	0.15
489	0.16
490	0.15
491	0.15
492	0.13
493	0.14
494	0.12
495	0.11
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.09
500	0.11
501	0.11
502	0.12
503	0.17
504	0.16
505	0.15
506	0.19
507	0.22
508	0.25
509	0.27
510	0.26
511	0.22
512	0.24
513	0.25
514	0.22
515	0.19
516	0.14
517	0.13
518	0.11
519	0.14
520	0.13
521	0.12
522	0.12
523	0.13
524	0.14
525	0.16
526	0.21
527	0.2
528	0.25
529	0.27
530	0.29
531	0.28
532	0.27
533	0.24
534	0.21
535	0.18
536	0.14
537	0.12
538	0.1
539	0.11
540	0.12
541	0.11
542	0.11
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.07
547	0.06
548	0.05
549	0.05
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.04
555	0.04
556	0.04
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.06
562	0.07
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.09
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.08
578	0.1
579	0.11
580	0.16
581	0.2
582	0.2
583	0.21
584	0.24
585	0.3
586	0.33
587	0.33
588	0.32
589	0.33
590	0.35
591	0.41
592	0.45
593	0.43
594	0.43
595	0.44
596	0.44
597	0.4
598	0.39
599	0.36
600	0.3
601	0.27
602	0.25
603	0.21
604	0.2
605	0.22
606	0.21
607	0.17
608	0.17
609	0.17
610	0.15
611	0.15
612	0.13
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.06
617	0.06
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.07
625	0.1
626	0.12
627	0.12
628	0.14
629	0.15
630	0.18
631	0.19
632	0.22
633	0.21
634	0.2
635	0.2
636	0.2
637	0.23
638	0.24
639	0.23
640	0.27
641	0.27
642	0.28
643	0.35
644	0.33
645	0.29
646	0.31
647	0.31
648	0.3
649	0.29
650	0.28
651	0.2
652	0.2
653	0.19
654	0.14
655	0.14
656	0.09
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.07
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.05
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.08
678	0.11
679	0.1
680	0.1
681	0.11
682	0.12
683	0.18
684	0.2
685	0.2
686	0.19
687	0.22
688	0.23
689	0.21
690	0.2
691	0.14
692	0.15
693	0.13
694	0.14
695	0.11
696	0.11
697	0.12
698	0.11
699	0.11
700	0.11
701	0.14
702	0.13
703	0.13
704	0.15
705	0.14
706	0.16
707	0.18
708	0.18
709	0.14
710	0.14
711	0.15
712	0.17
713	0.18
714	0.16
715	0.13
716	0.11
717	0.11
718	0.11
719	0.09
720	0.06
721	0.06
722	0.1
723	0.13
724	0.13
725	0.13
726	0.2
727	0.29
728	0.36
729	0.39
730	0.37
731	0.39
732	0.47
733	0.48
734	0.43
735	0.37
736	0.35
737	0.36
738	0.43
739	0.46
740	0.45
741	0.52
742	0.59
743	0.61
744	0.64
745	0.65
746	0.6
747	0.61
748	0.6
749	0.58
750	0.58
751	0.59
752	0.54
753	0.54
754	0.51
755	0.45
756	0.38
757	0.32
758	0.27
759	0.25
760	0.22
761	0.17
762	0.18
763	0.17
764	0.17
765	0.19
766	0.17
767	0.17
768	0.16
769	0.16
770	0.16
771	0.16
772	0.16
773	0.14
774	0.15
775	0.14
776	0.17
777	0.19
778	0.23
779	0.22
780	0.21
781	0.28
782	0.28
783	0.27
784	0.27
785	0.26
786	0.22
787	0.25
788	0.26
789	0.19
790	0.18
791	0.16
792	0.12
793	0.1
794	0.11
795	0.09
796	0.08
797	0.09
798	0.09
799	0.08
800	0.1
801	0.11
802	0.1
803	0.11
804	0.12
805	0.15
806	0.16
807	0.17
808	0.15
809	0.15
810	0.15
811	0.13
812	0.13
813	0.1
814	0.1
815	0.1
816	0.1
817	0.1
818	0.09
819	0.11
820	0.13
821	0.15
822	0.17
823	0.17
824	0.17
825	0.19
826	0.23
827	0.24
828	0.27
829	0.27
830	0.25
831	0.25
832	0.26
833	0.24
834	0.23
835	0.25
836	0.23
837	0.24
838	0.24
839	0.28
840	0.29
841	0.29
842	0.26
843	0.23
844	0.19
845	0.2
846	0.24
847	0.25
848	0.29
849	0.3
850	0.35
851	0.35
852	0.37
853	0.35
854	0.33
855	0.31
856	0.33
857	0.35
858	0.37
859	0.47
860	0.51
861	0.53
862	0.52
863	0.54
864	0.53
865	0.57
866	0.58
867	0.5
868	0.47
869	0.44
870	0.47
871	0.45
872	0.38
873	0.31
874	0.21
875	0.24
876	0.2
877	0.19
878	0.18
879	0.16
880	0.19
881	0.21
882	0.24
883	0.23
884	0.25
885	0.26
886	0.25
887	0.25
888	0.3
889	0.32
890	0.33
891	0.32
892	0.35
893	0.36
894	0.37
895	0.4
896	0.38
897	0.37
898	0.35
899	0.38
900	0.41
901	0.43
902	0.45
903	0.47
904	0.46
905	0.5
906	0.53
907	0.51
908	0.49
909	0.47
910	0.46
911	0.45
912	0.5
913	0.53
914	0.57
915	0.58
916	0.61
917	0.68
918	0.7
919	0.67
920	0.67
921	0.66
922	0.67
923	0.7
924	0.68
925	0.65
926	0.65
927	0.69
928	0.7
929	0.68
930	0.67
931	0.66
932	0.66
933	0.69
934	0.66
935	0.65
936	0.62
937	0.57
938	0.5
939	0.43
940	0.39
941	0.34
942	0.31
943	0.32
944	0.32
945	0.31
946	0.34
947	0.34
948	0.32
949	0.36
950	0.37
951	0.39
952	0.37
953	0.46
954	0.48
955	0.57
956	0.63
957	0.64
958	0.71
959	0.7
960	0.75
961	0.71
962	0.73
963	0.71
964	0.71
965	0.69
966	0.62
967	0.64
968	0.65
969	0.69
970	0.71
971	0.72
972	0.71

Q6CKX0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer