FuNGI

C1GPF1

Protein Details

Accession

C1GPF1

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-30	GGDHSAEKKMKRKRISEKIDRPNKKAAF	Basic
64-89	VPLTAYTKPRQKRLPKHNATRSVEIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-27	KKMKRKRISEKIDRPNKK
464-497	VKSKAEAGARRIAKLRVPVEFPKVSRGAGVRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12, cyto 7, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	pbl:PAAG_00396 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MGGGDHSAEKKMKRKRISEKIDRPNKKAAFAPVEATVKVQFVENTNGLLPVIASTPGINVPSSVPLTAYTKPRQKRLPKHNATRSVEILNSELLLQSSAHPKLDFVGKEGENELDMLWNHYVAIYDPDAGTLQLAEARKMTVRGCVRRLPRKNINGGEEDGEGVAKSNWAQRTALTEAFGTKQSRKAIQSLAANALLSSAPAGSDPSAVESALLSSIPKEAVTSLQKTTQAEIQAVKPLPQPNLSATHPSDVYAIETLVPNGLATLRTMHVKDWQDAIAAGEPVLSSSRFVAHRVEHVVRSKNKTMLQLLRFIMILIELSRSLKPSRGVGAATPGPAGTKKLPPREDLRRILSGIPASKGAAAAPTDPQTPLLPDSFLDALRRKFVPQGSFLSKSDITLLHTTICALSLHIPPETGFAASELATDPADLRDDLRLEYQTIQQYFRELGCKVDKPRESEFAKWGVKSKAEAGARRIAKLRVPVEFPKVSRGAGVRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.76
3	0.82
4	0.87
5	0.89
6	0.9
7	0.91
8	0.93
9	0.91
10	0.85
11	0.84
12	0.76
13	0.69
14	0.63
15	0.61
16	0.57
17	0.5
18	0.48
19	0.43
20	0.43
21	0.39
22	0.36
23	0.28
24	0.22
25	0.2
26	0.19
27	0.15
28	0.16
29	0.22
30	0.2
31	0.21
32	0.21
33	0.21
34	0.19
35	0.17
36	0.14
37	0.08
38	0.09
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.08
43	0.1
44	0.11
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.14
49	0.15
50	0.14
51	0.13
52	0.14
53	0.18
54	0.22
55	0.28
56	0.33
57	0.41
58	0.47
59	0.54
60	0.62
61	0.69
62	0.75
63	0.8
64	0.83
65	0.84
66	0.9
67	0.91
68	0.92
69	0.87
70	0.81
71	0.73
72	0.65
73	0.55
74	0.45
75	0.36
76	0.26
77	0.2
78	0.15
79	0.12
80	0.09
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.15
85	0.16
86	0.18
87	0.17
88	0.17
89	0.19
90	0.25
91	0.23
92	0.19
93	0.25
94	0.24
95	0.25
96	0.26
97	0.24
98	0.18
99	0.18
100	0.15
101	0.11
102	0.11
103	0.12
104	0.11
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.08
110	0.11
111	0.09
112	0.1
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.09
118	0.06
119	0.06
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.11
126	0.13
127	0.14
128	0.18
129	0.25
130	0.31
131	0.35
132	0.41
133	0.49
134	0.57
135	0.65
136	0.67
137	0.69
138	0.7
139	0.74
140	0.72
141	0.68
142	0.6
143	0.54
144	0.46
145	0.37
146	0.29
147	0.21
148	0.15
149	0.11
150	0.08
151	0.07
152	0.05
153	0.06
154	0.11
155	0.12
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.19
160	0.23
161	0.22
162	0.18
163	0.17
164	0.17
165	0.18
166	0.21
167	0.18
168	0.17
169	0.21
170	0.23
171	0.27
172	0.28
173	0.3
174	0.28
175	0.31
176	0.32
177	0.29
178	0.28
179	0.24
180	0.22
181	0.19
182	0.17
183	0.12
184	0.08
185	0.06
186	0.04
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.05
192	0.05
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.09
209	0.12
210	0.15
211	0.15
212	0.18
213	0.2
214	0.2
215	0.21
216	0.2
217	0.17
218	0.16
219	0.17
220	0.15
221	0.18
222	0.18
223	0.18
224	0.19
225	0.2
226	0.2
227	0.2
228	0.21
229	0.17
230	0.21
231	0.21
232	0.21
233	0.2
234	0.2
235	0.18
236	0.18
237	0.16
238	0.12
239	0.12
240	0.08
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.06
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.16
258	0.18
259	0.19
260	0.19
261	0.19
262	0.17
263	0.17
264	0.17
265	0.11
266	0.09
267	0.08
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.07
272	0.06
273	0.05
274	0.05
275	0.09
276	0.09
277	0.11
278	0.13
279	0.13
280	0.16
281	0.21
282	0.23
283	0.23
284	0.28
285	0.34
286	0.37
287	0.42
288	0.43
289	0.42
290	0.43
291	0.43
292	0.44
293	0.44
294	0.41
295	0.41
296	0.38
297	0.34
298	0.3
299	0.26
300	0.2
301	0.12
302	0.11
303	0.05
304	0.06
305	0.05
306	0.07
307	0.08
308	0.1
309	0.11
310	0.14
311	0.15
312	0.16
313	0.19
314	0.19
315	0.19
316	0.17
317	0.22
318	0.2
319	0.19
320	0.17
321	0.14
322	0.13
323	0.13
324	0.15
325	0.13
326	0.19
327	0.26
328	0.34
329	0.37
330	0.4
331	0.47
332	0.55
333	0.6
334	0.59
335	0.57
336	0.52
337	0.51
338	0.48
339	0.43
340	0.36
341	0.3
342	0.24
343	0.2
344	0.17
345	0.16
346	0.15
347	0.12
348	0.11
349	0.09
350	0.09
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.15
356	0.13
357	0.14
358	0.15
359	0.14
360	0.13
361	0.11
362	0.15
363	0.14
364	0.15
365	0.17
366	0.2
367	0.2
368	0.24
369	0.25
370	0.23
371	0.27
372	0.31
373	0.31
374	0.31
375	0.36
376	0.39
377	0.42
378	0.41
379	0.42
380	0.37
381	0.33
382	0.32
383	0.25
384	0.23
385	0.21
386	0.21
387	0.16
388	0.16
389	0.16
390	0.14
391	0.14
392	0.1
393	0.08
394	0.12
395	0.14
396	0.15
397	0.15
398	0.16
399	0.15
400	0.17
401	0.17
402	0.13
403	0.1
404	0.09
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.13
418	0.14
419	0.15
420	0.18
421	0.18
422	0.18
423	0.21
424	0.25
425	0.29
426	0.3
427	0.3
428	0.28
429	0.29
430	0.29
431	0.29
432	0.28
433	0.21
434	0.25
435	0.3
436	0.36
437	0.4
438	0.47
439	0.5
440	0.51
441	0.57
442	0.59
443	0.57
444	0.55
445	0.54
446	0.53
447	0.53
448	0.49
449	0.5
450	0.46
451	0.44
452	0.42
453	0.4
454	0.4
455	0.42
456	0.45
457	0.43
458	0.48
459	0.47
460	0.48
461	0.49
462	0.44
463	0.42
464	0.46
465	0.45
466	0.41
467	0.45
468	0.47
469	0.5
470	0.53
471	0.5
472	0.49
473	0.47
474	0.42
475	0.4
476	0.4
477	0.43

C1GPF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer