FuNGI

W6Q8Y6

Protein Details

Accession

W6Q8Y6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
100-121	EYLIPPKQRKKLTDPRTRPCIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14, cyto 7, pero 3, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MGDEMKFMLFSRAIQAEVTGVDQHQQNGVAERARKTIYDRIGPTLAHARLPSKFWPEIARTAAFLSNRSPSSKLNMTPYQAWYGDRPDLSRLRVIGSKGEYLIPPKQRKKLTDPRTRPCILLGYEGNTYYRILLGDGRIVGTPNAEFQEVLTTPSTQTMEDVGARQDGLLEATAAAAGGSETVGLINQPSVGIRQASVPASGYQLSMDPPERPLPKPRNDISHTLPRSDENSRVLTQPSDDNSQTQASAQSSDDDSQPAVAVQGDRTLSSTRSDDTLGPLSPAYQDSVLGTDLPSGGDQQQGDAVAAQGDITLSSTRRGNTLGPLSPDYQDSVLGIDSPSGGDQQHQRGPILEWQRYSELHRPVHEVQQGTLDYHPELKLRASEATLDNPDGDEELALMNVPEENVIPTFLAMAAKETEPFEPKTMLEEVNSLHQNQTWELVDPPKDRRLLSGKWVFKLKRGPHGEIIRHKSRWVVRGFTQEEGIDYEETFASVVKPMSYKALFAIGAALDLEIEQMDVKTAFLYGNIDHEIYVEQPHHMTDGTPRVCKLRKALYGLKQAPRIWYQTLTNFLRSLGFEPITADLGIFVRSSVYIAIYVDDLLIVGPSIAEIKRIKRSLRNRFQMTDLGPCSYYLGVSIQRDRQNRRLLLSQEAYIDNIAHQFGIDNCAPVSTPIETSPLPENSPDYTCSPDQRTSYQRIVGSLMYIMLGTRGDIAYAVSVASRSLSNPGPQHMKLARRILRYLKGTKNLRLTYQGQLQTLRGFTDADWGGCRATRRSTAGYLFKIGSGAISWQSKRQGVVALSTCEAEFLGQTQATKEAVWLRRLLNELNMDQGTTATIICGDNQGAIALASNPQYHSRTKHMEIQRKWQGEVQDNGTVKLKYIPTTEQIADGFTKPLARERFEWFRKGLGIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.16
4	0.16
5	0.17
6	0.12
7	0.11
8	0.14
9	0.16
10	0.17
11	0.18
12	0.19
13	0.19
14	0.21
15	0.24
16	0.26
17	0.29
18	0.31
19	0.34
20	0.33
21	0.33
22	0.35
23	0.4
24	0.41
25	0.45
26	0.45
27	0.46
28	0.48
29	0.46
30	0.45
31	0.45
32	0.39
33	0.33
34	0.33
35	0.31
36	0.3
37	0.34
38	0.36
39	0.34
40	0.34
41	0.34
42	0.39
43	0.4
44	0.43
45	0.44
46	0.4
47	0.34
48	0.35
49	0.36
50	0.31
51	0.28
52	0.25
53	0.26
54	0.27
55	0.29
56	0.3
57	0.28
58	0.34
59	0.39
60	0.4
61	0.42
62	0.45
63	0.47
64	0.49
65	0.5
66	0.47
67	0.42
68	0.4
69	0.35
70	0.34
71	0.35
72	0.32
73	0.3
74	0.32
75	0.35
76	0.36
77	0.37
78	0.32
79	0.31
80	0.33
81	0.33
82	0.33
83	0.31
84	0.31
85	0.28
86	0.3
87	0.27
88	0.28
89	0.35
90	0.38
91	0.45
92	0.51
93	0.58
94	0.64
95	0.69
96	0.74
97	0.77
98	0.78
99	0.79
100	0.82
101	0.82
102	0.83
103	0.79
104	0.69
105	0.61
106	0.56
107	0.47
108	0.43
109	0.36
110	0.3
111	0.3
112	0.3
113	0.28
114	0.22
115	0.21
116	0.14
117	0.13
118	0.1
119	0.1
120	0.12
121	0.12
122	0.14
123	0.14
124	0.15
125	0.14
126	0.15
127	0.14
128	0.13
129	0.12
130	0.11
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.11
135	0.17
136	0.16
137	0.18
138	0.17
139	0.16
140	0.16
141	0.2
142	0.2
143	0.14
144	0.14
145	0.13
146	0.14
147	0.14
148	0.15
149	0.13
150	0.13
151	0.13
152	0.12
153	0.11
154	0.09
155	0.09
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.04
163	0.03
164	0.03
165	0.03
166	0.03
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.06
178	0.08
179	0.09
180	0.09
181	0.1
182	0.13
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.14
187	0.15
188	0.15
189	0.14
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.14
195	0.13
196	0.15
197	0.22
198	0.25
199	0.27
200	0.36
201	0.42
202	0.49
203	0.57
204	0.58
205	0.6
206	0.61
207	0.64
208	0.6
209	0.62
210	0.55
211	0.48
212	0.46
213	0.38
214	0.39
215	0.36
216	0.33
217	0.26
218	0.29
219	0.28
220	0.29
221	0.29
222	0.25
223	0.24
224	0.24
225	0.23
226	0.24
227	0.23
228	0.23
229	0.23
230	0.24
231	0.22
232	0.18
233	0.18
234	0.14
235	0.15
236	0.14
237	0.13
238	0.15
239	0.16
240	0.16
241	0.14
242	0.13
243	0.11
244	0.11
245	0.09
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.09
251	0.09
252	0.09
253	0.11
254	0.12
255	0.12
256	0.14
257	0.15
258	0.13
259	0.14
260	0.16
261	0.15
262	0.17
263	0.19
264	0.17
265	0.16
266	0.15
267	0.14
268	0.13
269	0.13
270	0.11
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.08
291	0.07
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.04
299	0.05
300	0.06
301	0.08
302	0.1
303	0.1
304	0.12
305	0.13
306	0.13
307	0.17
308	0.21
309	0.22
310	0.23
311	0.25
312	0.25
313	0.25
314	0.24
315	0.2
316	0.16
317	0.13
318	0.11
319	0.09
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.07
330	0.11
331	0.16
332	0.19
333	0.2
334	0.2
335	0.2
336	0.22
337	0.26
338	0.29
339	0.27
340	0.24
341	0.26
342	0.27
343	0.27
344	0.3
345	0.31
346	0.32
347	0.32
348	0.33
349	0.36
350	0.36
351	0.42
352	0.4
353	0.34
354	0.27
355	0.28
356	0.27
357	0.23
358	0.21
359	0.15
360	0.12
361	0.14
362	0.14
363	0.1
364	0.11
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.1
370	0.12
371	0.13
372	0.15
373	0.16
374	0.15
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.08
380	0.05
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.04
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.08
405	0.09
406	0.11
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.12
411	0.14
412	0.15
413	0.14
414	0.12
415	0.12
416	0.11
417	0.15
418	0.16
419	0.13
420	0.12
421	0.13
422	0.13
423	0.12
424	0.14
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.13
429	0.16
430	0.17
431	0.2
432	0.22
433	0.24
434	0.23
435	0.26
436	0.29
437	0.27
438	0.33
439	0.38
440	0.36
441	0.37
442	0.43
443	0.39
444	0.38
445	0.45
446	0.39
447	0.41
448	0.43
449	0.44
450	0.45
451	0.5
452	0.52
453	0.51
454	0.55
455	0.51
456	0.46
457	0.44
458	0.42
459	0.39
460	0.4
461	0.35
462	0.32
463	0.29
464	0.38
465	0.39
466	0.34
467	0.32
468	0.25
469	0.23
470	0.2
471	0.19
472	0.1
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.05
479	0.04
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.11
486	0.11
487	0.11
488	0.1
489	0.11
490	0.11
491	0.1
492	0.11
493	0.07
494	0.07
495	0.06
496	0.06
497	0.03
498	0.03
499	0.03
500	0.02
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.06
512	0.06
513	0.08
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.08
526	0.07
527	0.07
528	0.1
529	0.18
530	0.2
531	0.21
532	0.21
533	0.26
534	0.28
535	0.3
536	0.32
537	0.32
538	0.34
539	0.39
540	0.46
541	0.49
542	0.57
543	0.6
544	0.6
545	0.56
546	0.53
547	0.5
548	0.45
549	0.4
550	0.32
551	0.28
552	0.26
553	0.23
554	0.3
555	0.28
556	0.27
557	0.24
558	0.23
559	0.22
560	0.2
561	0.2
562	0.15
563	0.14
564	0.12
565	0.13
566	0.13
567	0.13
568	0.12
569	0.1
570	0.07
571	0.07
572	0.08
573	0.07
574	0.06
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.02
592	0.02
593	0.02
594	0.04
595	0.04
596	0.08
597	0.11
598	0.15
599	0.23
600	0.27
601	0.31
602	0.38
603	0.49
604	0.57
605	0.65
606	0.7
607	0.68
608	0.66
609	0.66
610	0.62
611	0.53
612	0.49
613	0.39
614	0.31
615	0.26
616	0.24
617	0.23
618	0.17
619	0.15
620	0.09
621	0.1
622	0.12
623	0.14
624	0.18
625	0.23
626	0.3
627	0.37
628	0.42
629	0.48
630	0.53
631	0.53
632	0.53
633	0.53
634	0.49
635	0.5
636	0.46
637	0.39
638	0.33
639	0.31
640	0.27
641	0.21
642	0.19
643	0.12
644	0.11
645	0.09
646	0.07
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.11
651	0.11
652	0.1
653	0.1
654	0.11
655	0.11
656	0.11
657	0.12
658	0.09
659	0.1
660	0.1
661	0.13
662	0.13
663	0.16
664	0.2
665	0.2
666	0.19
667	0.19
668	0.2
669	0.2
670	0.22
671	0.22
672	0.19
673	0.22
674	0.23
675	0.27
676	0.3
677	0.32
678	0.33
679	0.36
680	0.4
681	0.42
682	0.44
683	0.44
684	0.4
685	0.37
686	0.36
687	0.3
688	0.25
689	0.19
690	0.15
691	0.1
692	0.08
693	0.07
694	0.06
695	0.05
696	0.05
697	0.06
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.1
712	0.12
713	0.17
714	0.19
715	0.24
716	0.29
717	0.29
718	0.36
719	0.38
720	0.42
721	0.44
722	0.52
723	0.53
724	0.51
725	0.57
726	0.56
727	0.58
728	0.59
729	0.61
730	0.59
731	0.62
732	0.63
733	0.65
734	0.67
735	0.62
736	0.57
737	0.55
738	0.51
739	0.47
740	0.5
741	0.47
742	0.4
743	0.39
744	0.38
745	0.34
746	0.31
747	0.26
748	0.18
749	0.15
750	0.13
751	0.19
752	0.19
753	0.17
754	0.18
755	0.18
756	0.18
757	0.19
758	0.22
759	0.17
760	0.21
761	0.25
762	0.28
763	0.32
764	0.36
765	0.41
766	0.45
767	0.45
768	0.43
769	0.39
770	0.34
771	0.3
772	0.25
773	0.18
774	0.12
775	0.12
776	0.13
777	0.18
778	0.19
779	0.23
780	0.28
781	0.3
782	0.3
783	0.3
784	0.31
785	0.27
786	0.33
787	0.32
788	0.3
789	0.29
790	0.29
791	0.27
792	0.21
793	0.2
794	0.13
795	0.09
796	0.08
797	0.1
798	0.1
799	0.11
800	0.12
801	0.14
802	0.15
803	0.14
804	0.16
805	0.21
806	0.25
807	0.28
808	0.31
809	0.3
810	0.34
811	0.37
812	0.36
813	0.33
814	0.33
815	0.3
816	0.32
817	0.31
818	0.26
819	0.23
820	0.22
821	0.17
822	0.12
823	0.11
824	0.06
825	0.07
826	0.08
827	0.08
828	0.1
829	0.1
830	0.09
831	0.1
832	0.1
833	0.08
834	0.08
835	0.08
836	0.07
837	0.09
838	0.11
839	0.12
840	0.14
841	0.18
842	0.22
843	0.26
844	0.3
845	0.36
846	0.42
847	0.45
848	0.53
849	0.59
850	0.66
851	0.67
852	0.72
853	0.74
854	0.69
855	0.67
856	0.61
857	0.58
858	0.56
859	0.56
860	0.5
861	0.48
862	0.46
863	0.45
864	0.46
865	0.39
866	0.32
867	0.33
868	0.3
869	0.25
870	0.29
871	0.31
872	0.3
873	0.36
874	0.36
875	0.33
876	0.3
877	0.3
878	0.28
879	0.25
880	0.23
881	0.18
882	0.2
883	0.18
884	0.27
885	0.3
886	0.31
887	0.34
888	0.4
889	0.5
890	0.53
891	0.58
892	0.51
893	0.49

W6Q8Y6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer