Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6R811

Protein Details
Accession W6R811    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24ISKPASHTQKMKRPPPPFGQHydrophilic
385-404SPLHRDPPPLPKRRKRTVAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-399KRRK
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 8.5, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAISKPASHTQKMKRPPPPFGQAAVNGVKGQHLSSSPSSAAKRLPTGVSVNATSNFTNGAAHVASSNKGPLNRTRNQSQRPMDQSSRSGRPVTRTAAADQAHRVGKKAPEPYVKTTSYILKKYSKCPPSLIVHLHPTHFRFEQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRAGTVPHDLIEELLRGGVQFYEGCLIVRVVDHKSASAQARKASTTSSNENNTPFSLHNYNEHITPSAYVPYPKQNQLTSATQGTKADGTSIANQQTDGPATSEQTDDKSINLGQKNAPMKPRVFTTVLHPTARTLQAELTLLVTTPDPRARAPIQASSSSSATPGSNQPDRGHVAKRQKMLVEPEDLVECESKMIQALAPPLFLDPVHSIEAAQELFKHLESPLHRDPPPLPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPTASGPGGAAKAAAVDDAGGVAPFEPRFSRFKTLETIRMQHEEKAKREHELKLKQELAKRQQQEQERERRRAIEQRQAEEHAKEESRRQQLAAQQAQAQLAAQQQNRHIMAQPNGISQGQQSSPVVRNQTALATSSPLVGNMMPQAVPMTMTASGSGGSPPRPPSALQHAHPNVMSHPMAPSRSQQGPSRHGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPTQRMSHGSPTHSMGHTPVMNQGMIATPQMNGGMSFTPQQQMMLQRQQALLQAQQQGHIQHNQFTPQQLAQLQANAHAQQNIQSHQHQMLQQQQQQQQQQSSSSSSSSSSNNNINSNKHTRAQLMRAQYAQMQIVKQQQQGQHPQMQGQQTQPHQGNQQLNQQQQQMLMAAAQANGGMGQNGQPMNQAQRYTQLYQQRLLRMRHDMSTRYMAQYGPPNQYPSNIAQQYGPGLEKNAKAWVSEVMRRERDGGQQQQQQRAALQAQQMQAQGSMHSMGGMNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.77
3 0.78
4 0.78
5 0.81
6 0.8
7 0.78
8 0.72
9 0.66
10 0.63
11 0.55
12 0.55
13 0.49
14 0.42
15 0.34
16 0.3
17 0.28
18 0.22
19 0.2
20 0.17
21 0.15
22 0.19
23 0.21
24 0.25
25 0.25
26 0.3
27 0.31
28 0.31
29 0.34
30 0.33
31 0.34
32 0.34
33 0.34
34 0.32
35 0.34
36 0.34
37 0.34
38 0.31
39 0.31
40 0.29
41 0.3
42 0.26
43 0.23
44 0.2
45 0.16
46 0.15
47 0.12
48 0.13
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.18
56 0.18
57 0.21
58 0.24
59 0.32
60 0.39
61 0.46
62 0.51
63 0.57
64 0.64
65 0.69
66 0.75
67 0.73
68 0.74
69 0.73
70 0.74
71 0.7
72 0.65
73 0.65
74 0.62
75 0.62
76 0.55
77 0.54
78 0.48
79 0.49
80 0.5
81 0.48
82 0.45
83 0.41
84 0.4
85 0.43
86 0.41
87 0.38
88 0.35
89 0.36
90 0.36
91 0.33
92 0.33
93 0.31
94 0.35
95 0.39
96 0.43
97 0.45
98 0.49
99 0.55
100 0.61
101 0.63
102 0.58
103 0.53
104 0.5
105 0.5
106 0.48
107 0.47
108 0.45
109 0.47
110 0.5
111 0.55
112 0.62
113 0.6
114 0.55
115 0.55
116 0.56
117 0.53
118 0.57
119 0.56
120 0.51
121 0.52
122 0.52
123 0.5
124 0.48
125 0.44
126 0.41
127 0.36
128 0.33
129 0.3
130 0.3
131 0.36
132 0.33
133 0.37
134 0.36
135 0.4
136 0.37
137 0.34
138 0.33
139 0.28
140 0.27
141 0.22
142 0.19
143 0.15
144 0.15
145 0.18
146 0.19
147 0.17
148 0.18
149 0.16
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.09
178 0.11
179 0.12
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.21
185 0.26
186 0.29
187 0.29
188 0.3
189 0.33
190 0.33
191 0.32
192 0.3
193 0.3
194 0.3
195 0.33
196 0.35
197 0.37
198 0.38
199 0.39
200 0.38
201 0.33
202 0.3
203 0.25
204 0.24
205 0.24
206 0.22
207 0.25
208 0.28
209 0.28
210 0.27
211 0.27
212 0.23
213 0.2
214 0.2
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.17
220 0.24
221 0.29
222 0.33
223 0.35
224 0.33
225 0.35
226 0.39
227 0.4
228 0.35
229 0.35
230 0.32
231 0.3
232 0.29
233 0.27
234 0.23
235 0.19
236 0.16
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.18
245 0.18
246 0.17
247 0.14
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.13
255 0.15
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.21
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.27
265 0.31
266 0.33
267 0.35
268 0.33
269 0.33
270 0.33
271 0.34
272 0.32
273 0.3
274 0.27
275 0.29
276 0.35
277 0.37
278 0.36
279 0.33
280 0.3
281 0.32
282 0.34
283 0.28
284 0.19
285 0.15
286 0.16
287 0.17
288 0.15
289 0.12
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.17
300 0.18
301 0.23
302 0.25
303 0.28
304 0.29
305 0.29
306 0.31
307 0.28
308 0.28
309 0.23
310 0.2
311 0.16
312 0.13
313 0.13
314 0.15
315 0.18
316 0.2
317 0.23
318 0.23
319 0.26
320 0.29
321 0.3
322 0.3
323 0.31
324 0.38
325 0.41
326 0.43
327 0.42
328 0.41
329 0.41
330 0.43
331 0.39
332 0.32
333 0.27
334 0.25
335 0.23
336 0.21
337 0.19
338 0.13
339 0.1
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.1
355 0.08
356 0.1
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.1
363 0.09
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.11
371 0.13
372 0.2
373 0.24
374 0.29
375 0.29
376 0.3
377 0.33
378 0.4
379 0.48
380 0.5
381 0.55
382 0.58
383 0.67
384 0.74
385 0.81
386 0.74
387 0.74
388 0.74
389 0.71
390 0.65
391 0.57
392 0.49
393 0.4
394 0.35
395 0.26
396 0.16
397 0.08
398 0.05
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.05
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.03
429 0.02
430 0.02
431 0.03
432 0.03
433 0.02
434 0.02
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.08
441 0.11
442 0.14
443 0.2
444 0.2
445 0.22
446 0.27
447 0.3
448 0.35
449 0.35
450 0.35
451 0.31
452 0.34
453 0.33
454 0.31
455 0.36
456 0.33
457 0.34
458 0.38
459 0.37
460 0.36
461 0.39
462 0.41
463 0.42
464 0.45
465 0.46
466 0.45
467 0.49
468 0.49
469 0.5
470 0.51
471 0.49
472 0.49
473 0.47
474 0.46
475 0.47
476 0.5
477 0.55
478 0.56
479 0.6
480 0.6
481 0.62
482 0.58
483 0.55
484 0.52
485 0.53
486 0.5
487 0.48
488 0.46
489 0.44
490 0.46
491 0.46
492 0.45
493 0.36
494 0.31
495 0.25
496 0.22
497 0.19
498 0.22
499 0.26
500 0.3
501 0.3
502 0.3
503 0.3
504 0.32
505 0.4
506 0.38
507 0.32
508 0.29
509 0.29
510 0.28
511 0.25
512 0.2
513 0.13
514 0.13
515 0.17
516 0.16
517 0.17
518 0.18
519 0.23
520 0.24
521 0.23
522 0.22
523 0.22
524 0.23
525 0.25
526 0.25
527 0.21
528 0.22
529 0.21
530 0.18
531 0.14
532 0.15
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.13
537 0.15
538 0.18
539 0.2
540 0.18
541 0.18
542 0.17
543 0.18
544 0.15
545 0.14
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.11
574 0.13
575 0.14
576 0.15
577 0.16
578 0.19
579 0.28
580 0.33
581 0.31
582 0.39
583 0.39
584 0.4
585 0.39
586 0.35
587 0.26
588 0.25
589 0.24
590 0.14
591 0.15
592 0.15
593 0.17
594 0.17
595 0.19
596 0.2
597 0.23
598 0.26
599 0.31
600 0.36
601 0.4
602 0.43
603 0.46
604 0.42
605 0.43
606 0.42
607 0.37
608 0.4
609 0.38
610 0.34
611 0.3
612 0.29
613 0.25
614 0.23
615 0.22
616 0.16
617 0.11
618 0.11
619 0.12
620 0.13
621 0.13
622 0.14
623 0.18
624 0.14
625 0.16
626 0.19
627 0.24
628 0.28
629 0.29
630 0.3
631 0.29
632 0.32
633 0.33
634 0.38
635 0.35
636 0.33
637 0.33
638 0.34
639 0.35
640 0.32
641 0.29
642 0.22
643 0.22
644 0.21
645 0.19
646 0.19
647 0.17
648 0.16
649 0.16
650 0.15
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.08
655 0.07
656 0.07
657 0.08
658 0.07
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.1
665 0.11
666 0.11
667 0.12
668 0.13
669 0.18
670 0.23
671 0.29
672 0.29
673 0.3
674 0.31
675 0.31
676 0.32
677 0.28
678 0.24
679 0.23
680 0.26
681 0.24
682 0.25
683 0.26
684 0.25
685 0.27
686 0.31
687 0.27
688 0.27
689 0.28
690 0.3
691 0.3
692 0.29
693 0.29
694 0.23
695 0.26
696 0.21
697 0.22
698 0.19
699 0.21
700 0.19
701 0.19
702 0.21
703 0.19
704 0.2
705 0.18
706 0.18
707 0.2
708 0.23
709 0.23
710 0.25
711 0.25
712 0.27
713 0.27
714 0.31
715 0.28
716 0.3
717 0.36
718 0.4
719 0.44
720 0.49
721 0.53
722 0.56
723 0.59
724 0.59
725 0.54
726 0.48
727 0.45
728 0.39
729 0.37
730 0.31
731 0.26
732 0.22
733 0.19
734 0.2
735 0.2
736 0.21
737 0.22
738 0.26
739 0.29
740 0.34
741 0.36
742 0.38
743 0.43
744 0.46
745 0.46
746 0.44
747 0.44
748 0.44
749 0.46
750 0.49
751 0.48
752 0.48
753 0.47
754 0.44
755 0.43
756 0.39
757 0.36
758 0.32
759 0.29
760 0.23
761 0.23
762 0.31
763 0.34
764 0.35
765 0.39
766 0.4
767 0.45
768 0.54
769 0.56
770 0.54
771 0.5
772 0.5
773 0.5
774 0.5
775 0.45
776 0.41
777 0.42
778 0.38
779 0.45
780 0.44
781 0.42
782 0.41
783 0.45
784 0.46
785 0.44
786 0.51
787 0.5
788 0.52
789 0.53
790 0.52
791 0.46
792 0.4
793 0.37
794 0.28
795 0.2
796 0.16
797 0.13
798 0.11
799 0.1
800 0.09
801 0.07
802 0.07
803 0.07
804 0.07
805 0.06
806 0.05
807 0.06
808 0.11
809 0.11
810 0.11
811 0.13
812 0.16
813 0.22
814 0.26
815 0.26
816 0.22
817 0.3
818 0.35
819 0.36
820 0.4
821 0.43
822 0.42
823 0.46
824 0.51
825 0.53
826 0.54
827 0.55
828 0.54
829 0.54
830 0.53
831 0.54
832 0.53
833 0.48
834 0.46
835 0.49
836 0.47
837 0.41
838 0.4
839 0.34
840 0.33
841 0.39
842 0.4
843 0.39
844 0.4
845 0.42
846 0.41
847 0.43
848 0.42
849 0.37
850 0.42
851 0.36
852 0.34
853 0.3
854 0.31
855 0.31
856 0.3
857 0.27
858 0.17
859 0.2
860 0.23
861 0.25
862 0.25
863 0.29
864 0.27
865 0.25
866 0.26
867 0.3
868 0.31
869 0.35
870 0.4
871 0.43
872 0.45
873 0.46
874 0.49
875 0.45
876 0.48
877 0.52
878 0.54
879 0.55
880 0.6
881 0.65
882 0.7
883 0.7
884 0.62
885 0.54
886 0.5
887 0.43
888 0.39
889 0.38
890 0.35
891 0.34
892 0.35
893 0.35
894 0.31
895 0.29
896 0.25
897 0.2
898 0.16
899 0.16
900 0.12
901 0.12