Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6PZY0

Protein Details
Accession W6PZY0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
391-411RAEQRRERRREDERQLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-241KFKHKKIPRGPPSPP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSTSIAAGLFKSLPKPKYSGEEEELPQHAQPRGPRVVGADQIDETQVVLRRTGPPPYGNRAGWRPRAPEDFGDGGAFPEILVAQYPLDMGRKGKSSKSNALALQVDAEGKVKYDAIARRGHADNRTVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLEKPSEEEIQAQMERTKAALTTLVEGASSAQKPKNVKGGQRAEPTFVRYTPANQMGNTGRQNDRIMKIVERQLDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVQLRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRMLAQKAREDRAGPSARVSRARSRSRSASRSVSVYSSRSATPSEDDEAARDRAEQRRERRREDERQLRQSRMGTERRIQTMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSSESMWDSRLFNRTSGMQSGFNEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQADADDEDAGEGEMSKLEKTKRFEVLGRAKEGFRGAAEAEERQGPVQFEKDTADPFGIDNMIADVTSGQKRYGIQEAEDVDRKSKRPRVDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.38
4 0.45
5 0.5
6 0.51
7 0.48
8 0.52
9 0.51
10 0.52
11 0.51
12 0.44
13 0.38
14 0.35
15 0.32
16 0.29
17 0.32
18 0.35
19 0.38
20 0.37
21 0.37
22 0.37
23 0.4
24 0.42
25 0.39
26 0.34
27 0.29
28 0.29
29 0.28
30 0.23
31 0.18
32 0.16
33 0.18
34 0.16
35 0.16
36 0.18
37 0.24
38 0.27
39 0.33
40 0.33
41 0.36
42 0.41
43 0.49
44 0.53
45 0.49
46 0.52
47 0.55
48 0.6
49 0.62
50 0.62
51 0.59
52 0.58
53 0.62
54 0.6
55 0.53
56 0.51
57 0.44
58 0.38
59 0.34
60 0.27
61 0.22
62 0.19
63 0.16
64 0.09
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.09
75 0.11
76 0.12
77 0.15
78 0.21
79 0.24
80 0.31
81 0.38
82 0.44
83 0.51
84 0.54
85 0.57
86 0.52
87 0.54
88 0.49
89 0.4
90 0.33
91 0.25
92 0.21
93 0.15
94 0.15
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.15
101 0.19
102 0.22
103 0.27
104 0.28
105 0.33
106 0.36
107 0.4
108 0.37
109 0.39
110 0.38
111 0.37
112 0.42
113 0.36
114 0.34
115 0.3
116 0.29
117 0.24
118 0.21
119 0.25
120 0.21
121 0.25
122 0.31
123 0.35
124 0.34
125 0.36
126 0.36
127 0.29
128 0.32
129 0.28
130 0.22
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.18
135 0.17
136 0.12
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.17
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.15
148 0.15
149 0.14
150 0.13
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.19
166 0.22
167 0.25
168 0.34
169 0.34
170 0.39
171 0.46
172 0.52
173 0.56
174 0.61
175 0.59
176 0.53
177 0.5
178 0.48
179 0.41
180 0.33
181 0.28
182 0.2
183 0.22
184 0.25
185 0.3
186 0.27
187 0.25
188 0.29
189 0.29
190 0.34
191 0.33
192 0.31
193 0.26
194 0.27
195 0.3
196 0.3
197 0.29
198 0.27
199 0.27
200 0.25
201 0.28
202 0.3
203 0.32
204 0.28
205 0.29
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.23
212 0.24
213 0.34
214 0.39
215 0.4
216 0.49
217 0.52
218 0.58
219 0.66
220 0.76
221 0.75
222 0.77
223 0.79
224 0.78
225 0.76
226 0.71
227 0.65
228 0.56
229 0.52
230 0.48
231 0.49
232 0.49
233 0.49
234 0.47
235 0.48
236 0.5
237 0.45
238 0.42
239 0.42
240 0.41
241 0.39
242 0.36
243 0.34
244 0.32
245 0.32
246 0.3
247 0.28
248 0.21
249 0.16
250 0.18
251 0.19
252 0.27
253 0.3
254 0.38
255 0.42
256 0.47
257 0.52
258 0.49
259 0.49
260 0.42
261 0.41
262 0.37
263 0.4
264 0.37
265 0.37
266 0.39
267 0.35
268 0.32
269 0.32
270 0.28
271 0.19
272 0.17
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.11
287 0.12
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.18
303 0.18
304 0.2
305 0.22
306 0.2
307 0.24
308 0.29
309 0.29
310 0.25
311 0.29
312 0.29
313 0.32
314 0.34
315 0.33
316 0.3
317 0.36
318 0.42
319 0.42
320 0.39
321 0.41
322 0.44
323 0.48
324 0.49
325 0.42
326 0.37
327 0.33
328 0.37
329 0.34
330 0.29
331 0.26
332 0.26
333 0.26
334 0.27
335 0.26
336 0.22
337 0.28
338 0.3
339 0.26
340 0.27
341 0.3
342 0.31
343 0.35
344 0.38
345 0.37
346 0.43
347 0.51
348 0.52
349 0.53
350 0.59
351 0.62
352 0.62
353 0.59
354 0.55
355 0.49
356 0.47
357 0.43
358 0.36
359 0.31
360 0.28
361 0.24
362 0.2
363 0.19
364 0.17
365 0.17
366 0.15
367 0.15
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.17
373 0.19
374 0.19
375 0.16
376 0.16
377 0.18
378 0.22
379 0.31
380 0.37
381 0.44
382 0.54
383 0.61
384 0.66
385 0.71
386 0.73
387 0.76
388 0.79
389 0.8
390 0.78
391 0.82
392 0.8
393 0.75
394 0.69
395 0.62
396 0.57
397 0.55
398 0.51
399 0.46
400 0.47
401 0.5
402 0.49
403 0.48
404 0.42
405 0.39
406 0.42
407 0.47
408 0.46
409 0.46
410 0.43
411 0.48
412 0.5
413 0.48
414 0.39
415 0.31
416 0.26
417 0.22
418 0.22
419 0.17
420 0.14
421 0.12
422 0.14
423 0.13
424 0.13
425 0.13
426 0.14
427 0.13
428 0.15
429 0.15
430 0.17
431 0.22
432 0.23
433 0.24
434 0.26
435 0.26
436 0.29
437 0.34
438 0.31
439 0.24
440 0.25
441 0.26
442 0.26
443 0.28
444 0.28
445 0.24
446 0.24
447 0.3
448 0.29
449 0.26
450 0.26
451 0.21
452 0.22
453 0.2
454 0.24
455 0.19
456 0.18
457 0.18
458 0.19
459 0.21
460 0.18
461 0.21
462 0.17
463 0.2
464 0.21
465 0.21
466 0.19
467 0.17
468 0.18
469 0.18
470 0.2
471 0.18
472 0.19
473 0.21
474 0.21
475 0.25
476 0.3
477 0.3
478 0.3
479 0.29
480 0.27
481 0.22
482 0.21
483 0.17
484 0.11
485 0.06
486 0.05
487 0.06
488 0.07
489 0.08
490 0.12
491 0.18
492 0.24
493 0.3
494 0.36
495 0.41
496 0.44
497 0.48
498 0.54
499 0.59
500 0.59
501 0.58
502 0.55
503 0.49
504 0.48
505 0.45
506 0.36
507 0.26
508 0.22
509 0.17
510 0.18
511 0.2
512 0.18
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.18
517 0.2
518 0.18
519 0.19
520 0.22
521 0.2
522 0.2
523 0.22
524 0.24
525 0.23
526 0.23
527 0.21
528 0.18
529 0.17
530 0.18
531 0.15
532 0.13
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.07
539 0.11
540 0.15
541 0.16
542 0.16
543 0.18
544 0.2
545 0.24
546 0.32
547 0.29
548 0.27
549 0.32
550 0.35
551 0.39
552 0.43
553 0.41
554 0.38
555 0.41
556 0.44
557 0.47
558 0.51
559 0.54