FuNGI

W6QAJ0

Protein Details

Accession

W6QAJ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-105	AKPVMKHKPKAVGRRSKQERDEI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
82-100	PAKPVMKHKPKAVGRRSKQ
125-140	RGRGGTARRAGFRGRG
272-281	KKAEKEKAAK

Subcellular Location(s)

mito 18, nucl 6.5, cyto_nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAASRGSARGGAANRGARTDTTTPTPAGGDTTQNAPTATSAPGPASRASVQRLQSLNKRTPSGSIAPSSRPPSALGGEPAKPVMKHKPKAVGRRSKQERDEIERLEQERYNERLKEAAAIQRGRGGTARRAGFRGRGGPMAMGMSGFGGRGGKLGRGGYGGGSGGGYGGSAGGAGSGYNRSGLTGVNRGRAYDSSDDEENALRVSIDHINLDSDEEDWDTPKDFKGKQPSRSSGERGLRPVRVERHEHEERVISVNMESSTSRTADLRKKAEKEKAAKDVGRTPTKVKPEPRDDDTTMPDAIPHADDDDLLPEHNVRVRSAQSMSPTKRSTTELRSIQPTPEPEIPDPRSLLHTKEEIDEYDRHMEDLAIIKDLLVPKESKNATTEAETTEGAAEGKPAAVEGQEGDQPNEEKEEEQEEDNPLHGQMFLMQFPPMTPYLRVAGSSQDNQHQAAATAPPPNEIKREAGDDVEIVGSTQATELKENSVITAGHPWSLPTGRVGKLNVHQSGRVTLDWGGISMELDRGAPVGFVQEAVILSKVPPESEEDIPKHVWSMGQLSGKFTVTPNWDEML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.41
3	0.39
4	0.37
5	0.34
6	0.35
7	0.3
8	0.34
9	0.33
10	0.31
11	0.31
12	0.33
13	0.32
14	0.31
15	0.31
16	0.25
17	0.24
18	0.22
19	0.2
20	0.19
21	0.22
22	0.23
23	0.23
24	0.23
25	0.19
26	0.19
27	0.17
28	0.17
29	0.15
30	0.14
31	0.15
32	0.18
33	0.19
34	0.19
35	0.21
36	0.23
37	0.25
38	0.29
39	0.33
40	0.33
41	0.38
42	0.41
43	0.43
44	0.48
45	0.53
46	0.56
47	0.55
48	0.56
49	0.49
50	0.49
51	0.48
52	0.46
53	0.42
54	0.4
55	0.38
56	0.39
57	0.44
58	0.45
59	0.41
60	0.36
61	0.33
62	0.31
63	0.3
64	0.29
65	0.28
66	0.28
67	0.28
68	0.28
69	0.29
70	0.27
71	0.25
72	0.27
73	0.33
74	0.39
75	0.43
76	0.48
77	0.56
78	0.62
79	0.72
80	0.78
81	0.78
82	0.75
83	0.81
84	0.84
85	0.83
86	0.8
87	0.79
88	0.76
89	0.74
90	0.73
91	0.66
92	0.62
93	0.58
94	0.55
95	0.5
96	0.44
97	0.38
98	0.38
99	0.38
100	0.39
101	0.35
102	0.34
103	0.32
104	0.3
105	0.31
106	0.27
107	0.29
108	0.3
109	0.3
110	0.29
111	0.32
112	0.31
113	0.28
114	0.29
115	0.26
116	0.25
117	0.31
118	0.34
119	0.32
120	0.34
121	0.36
122	0.36
123	0.37
124	0.37
125	0.32
126	0.3
127	0.28
128	0.26
129	0.24
130	0.2
131	0.16
132	0.1
133	0.08
134	0.06
135	0.06
136	0.05
137	0.05
138	0.05
139	0.05
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.12
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.07
152	0.06
153	0.06
154	0.05
155	0.04
156	0.04
157	0.03
158	0.03
159	0.02
160	0.02
161	0.02
162	0.02
163	0.02
164	0.02
165	0.03
166	0.04
167	0.05
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.08
173	0.1
174	0.17
175	0.19
176	0.24
177	0.24
178	0.24
179	0.26
180	0.25
181	0.27
182	0.22
183	0.23
184	0.2
185	0.21
186	0.21
187	0.2
188	0.19
189	0.15
190	0.12
191	0.1
192	0.06
193	0.06
194	0.08
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.12
202	0.09
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.15
213	0.16
214	0.21
215	0.32
216	0.38
217	0.45
218	0.53
219	0.57
220	0.58
221	0.6
222	0.59
223	0.56
224	0.56
225	0.5
226	0.48
227	0.46
228	0.42
229	0.4
230	0.41
231	0.38
232	0.36
233	0.38
234	0.35
235	0.4
236	0.41
237	0.4
238	0.36
239	0.32
240	0.28
241	0.27
242	0.24
243	0.16
244	0.12
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.1
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.09
254	0.15
255	0.21
256	0.27
257	0.32
258	0.37
259	0.41
260	0.47
261	0.53
262	0.54
263	0.55
264	0.54
265	0.55
266	0.54
267	0.5
268	0.46
269	0.47
270	0.46
271	0.43
272	0.38
273	0.35
274	0.36
275	0.41
276	0.44
277	0.44
278	0.45
279	0.49
280	0.53
281	0.54
282	0.55
283	0.5
284	0.47
285	0.44
286	0.37
287	0.3
288	0.24
289	0.19
290	0.13
291	0.12
292	0.1
293	0.07
294	0.06
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.07
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.11
308	0.12
309	0.14
310	0.16
311	0.17
312	0.2
313	0.27
314	0.29
315	0.33
316	0.34
317	0.32
318	0.32
319	0.35
320	0.34
321	0.32
322	0.38
323	0.36
324	0.37
325	0.41
326	0.4
327	0.38
328	0.36
329	0.31
330	0.28
331	0.27
332	0.28
333	0.25
334	0.32
335	0.33
336	0.31
337	0.3
338	0.26
339	0.27
340	0.25
341	0.26
342	0.21
343	0.2
344	0.19
345	0.2
346	0.21
347	0.17
348	0.2
349	0.19
350	0.19
351	0.21
352	0.2
353	0.19
354	0.18
355	0.16
356	0.14
357	0.18
358	0.15
359	0.11
360	0.11
361	0.11
362	0.13
363	0.14
364	0.14
365	0.11
366	0.12
367	0.12
368	0.2
369	0.2
370	0.2
371	0.2
372	0.21
373	0.21
374	0.22
375	0.23
376	0.17
377	0.18
378	0.16
379	0.15
380	0.13
381	0.12
382	0.1
383	0.08
384	0.07
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.04
391	0.05
392	0.05
393	0.07
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.13
398	0.14
399	0.14
400	0.16
401	0.15
402	0.12
403	0.13
404	0.16
405	0.16
406	0.16
407	0.18
408	0.18
409	0.18
410	0.18
411	0.17
412	0.13
413	0.12
414	0.1
415	0.08
416	0.1
417	0.11
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.14
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.14
428	0.16
429	0.17
430	0.17
431	0.15
432	0.19
433	0.21
434	0.24
435	0.25
436	0.28
437	0.29
438	0.28
439	0.28
440	0.24
441	0.19
442	0.18
443	0.17
444	0.14
445	0.17
446	0.17
447	0.19
448	0.22
449	0.23
450	0.25
451	0.25
452	0.26
453	0.23
454	0.28
455	0.26
456	0.24
457	0.23
458	0.2
459	0.18
460	0.16
461	0.13
462	0.09
463	0.07
464	0.06
465	0.05
466	0.06
467	0.08
468	0.09
469	0.1
470	0.11
471	0.14
472	0.16
473	0.16
474	0.16
475	0.15
476	0.14
477	0.14
478	0.2
479	0.18
480	0.17
481	0.17
482	0.17
483	0.19
484	0.21
485	0.2
486	0.18
487	0.23
488	0.23
489	0.27
490	0.28
491	0.3
492	0.35
493	0.42
494	0.43
495	0.41
496	0.41
497	0.39
498	0.42
499	0.38
500	0.32
501	0.26
502	0.21
503	0.21
504	0.19
505	0.18
506	0.14
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.1
511	0.07
512	0.08
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.08
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.09
528	0.13
529	0.13
530	0.12
531	0.13
532	0.18
533	0.22
534	0.27
535	0.35
536	0.33
537	0.37
538	0.38
539	0.38
540	0.33
541	0.29
542	0.25
543	0.19
544	0.21
545	0.23
546	0.28
547	0.29
548	0.3
549	0.32
550	0.32
551	0.31
552	0.27
553	0.28
554	0.26
555	0.29

W6QAJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer