Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6QGF1

Protein Details
Accession W6QGF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-434LDREAQKGQRRQAKKSTRKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
373-434KKLRRVDEEEKAEERRIAAEKLKKDERERILRGMSAEEQRKFLDREAQKGQRRQAKKSTRKG
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10, nucl 7.5, mito 3, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MAGMFKNVFGSHEAKPDDDFADFVEAPNPSPASLVADSTVVPAANTLAAKAVPYTAWYRVWERTSPSDFKQEAMIMPFILLIVLFHLWGVRKNRRRARDWAQAHVPSLQKEFAVVGFDGIARPAAVDGITVELANPESLLKEKTASEFAAYATGRQNVAFLDVNIKMPKRYNPITFVMEYVLGFFFESWEPPVEKYEALLYAFDGKEKDLVPVIAKDASPVKLPSSTYDGFIWAVVHKSHMRKFRNDRYDASITFSKDNPKLPSWVTVMTESAEISDTLLTPELIQAIEQAGNDFEFLIVTDQPVDRPTKIEETVPKKRIQLSANLASSASGYASTLPLFNQFLRLSDKLVASAHFRGEVMRKVRNVREEEIKKLRRVDEEEKAEERRIAAEKLKKDERERILRGMSAEEQRKFLDREAQKGQRRQAKKSTRKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.31
4 0.28
5 0.25
6 0.22
7 0.16
8 0.21
9 0.19
10 0.18
11 0.19
12 0.18
13 0.19
14 0.22
15 0.21
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.15
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.08
40 0.11
41 0.14
42 0.16
43 0.18
44 0.22
45 0.25
46 0.3
47 0.34
48 0.35
49 0.37
50 0.42
51 0.46
52 0.48
53 0.47
54 0.51
55 0.47
56 0.44
57 0.42
58 0.36
59 0.31
60 0.29
61 0.26
62 0.17
63 0.16
64 0.15
65 0.12
66 0.1
67 0.07
68 0.04
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.07
75 0.13
76 0.22
77 0.31
78 0.4
79 0.5
80 0.59
81 0.66
82 0.71
83 0.74
84 0.75
85 0.76
86 0.72
87 0.69
88 0.68
89 0.62
90 0.58
91 0.54
92 0.47
93 0.38
94 0.36
95 0.29
96 0.2
97 0.19
98 0.18
99 0.13
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.04
124 0.05
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.12
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.13
135 0.13
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.1
145 0.13
146 0.12
147 0.1
148 0.12
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.17
153 0.16
154 0.18
155 0.23
156 0.26
157 0.3
158 0.31
159 0.33
160 0.37
161 0.39
162 0.37
163 0.32
164 0.26
165 0.22
166 0.18
167 0.15
168 0.11
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.15
218 0.15
219 0.14
220 0.08
221 0.09
222 0.07
223 0.1
224 0.12
225 0.17
226 0.22
227 0.3
228 0.33
229 0.41
230 0.5
231 0.58
232 0.63
233 0.63
234 0.6
235 0.59
236 0.6
237 0.52
238 0.48
239 0.41
240 0.33
241 0.32
242 0.3
243 0.28
244 0.26
245 0.3
246 0.29
247 0.27
248 0.28
249 0.28
250 0.3
251 0.26
252 0.26
253 0.23
254 0.2
255 0.19
256 0.17
257 0.16
258 0.12
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.13
293 0.12
294 0.14
295 0.17
296 0.2
297 0.21
298 0.25
299 0.31
300 0.38
301 0.48
302 0.5
303 0.5
304 0.48
305 0.52
306 0.54
307 0.48
308 0.47
309 0.45
310 0.49
311 0.47
312 0.44
313 0.39
314 0.32
315 0.3
316 0.22
317 0.14
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.1
326 0.12
327 0.12
328 0.16
329 0.16
330 0.18
331 0.23
332 0.24
333 0.23
334 0.25
335 0.25
336 0.22
337 0.23
338 0.22
339 0.2
340 0.22
341 0.2
342 0.17
343 0.17
344 0.18
345 0.21
346 0.27
347 0.28
348 0.32
349 0.36
350 0.42
351 0.48
352 0.53
353 0.54
354 0.52
355 0.57
356 0.56
357 0.6
358 0.64
359 0.65
360 0.62
361 0.62
362 0.62
363 0.58
364 0.62
365 0.6
366 0.59
367 0.6
368 0.61
369 0.59
370 0.58
371 0.53
372 0.47
373 0.4
374 0.34
375 0.31
376 0.29
377 0.33
378 0.38
379 0.42
380 0.49
381 0.57
382 0.59
383 0.62
384 0.68
385 0.69
386 0.72
387 0.7
388 0.68
389 0.63
390 0.59
391 0.54
392 0.49
393 0.45
394 0.43
395 0.46
396 0.41
397 0.4
398 0.4
399 0.43
400 0.41
401 0.38
402 0.39
403 0.36
404 0.42
405 0.49
406 0.57
407 0.61
408 0.67
409 0.73
410 0.73
411 0.76
412 0.77
413 0.77
414 0.79