Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GW72

Protein Details
Accession C1GW72    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
336-365THTPAKKPAMKKPKDEPKIKESKSKKQTDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-321KKKR
339-363PAKKPAMKKPKDEPKIKESKSKKQT
371-384NKTPKNRRSTRSRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.666, nucl 10.5, cyto 10.5, cyto_mito 8.833, mito_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015886  DNA_glyclase/AP_lyase_DNA-bd  
IPR012319  FPG_cat  
IPR035937  MutM-like_N-ter  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0019104  F:DNA N-glycosylase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
KEGG pbl:PAAG_02767  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01149  Fapy_DNA_glyco  
PF06831  H2TH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51068  FPG_CAT  
CDD cd08972  PF_Nei_N  
Amino Acid Sequences MPELAEVARVVHYIRKYLVGKTITKVHVQDDPIVFGKVGTTAAEFQKHMEGKSIVDTGQQGKYFWMIMSSPPHPVMHFGMTGWLKLKNVHTYYYRAPASDKGNDRGEEPWPSKFWKFMLELDDEPKTEAAFVDARRLGRVRLVDCPGADIRKYSPLKENGPDPIVDKDIVTLDWLRKKVLSKRVPIKALLLDQTNISGIGNWMGDELLYHAKIHPEQYSNTLQESQIEQLYSAINYVCSTSVGLLGNSEEFPSNWLFSHRWSKGKTNHSHKLPNGEKIVFITVGGRTSAIVPAIQKKTGPVAGDVEDEAMDDNNEPPKKKRGIVSKESKYVENGETHTPAKKPAMKKPKDEPKIKESKSKKQTDAAQTEENKTPKNRRSTRSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.27
3 0.29
4 0.31
5 0.38
6 0.38
7 0.4
8 0.41
9 0.48
10 0.43
11 0.46
12 0.45
13 0.4
14 0.4
15 0.39
16 0.42
17 0.34
18 0.35
19 0.32
20 0.31
21 0.28
22 0.22
23 0.2
24 0.14
25 0.13
26 0.1
27 0.1
28 0.13
29 0.16
30 0.2
31 0.19
32 0.2
33 0.27
34 0.28
35 0.27
36 0.29
37 0.26
38 0.25
39 0.28
40 0.28
41 0.2
42 0.21
43 0.23
44 0.21
45 0.25
46 0.25
47 0.21
48 0.21
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.16
53 0.11
54 0.14
55 0.2
56 0.2
57 0.22
58 0.23
59 0.24
60 0.22
61 0.25
62 0.24
63 0.21
64 0.2
65 0.16
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.2
70 0.19
71 0.17
72 0.2
73 0.24
74 0.26
75 0.27
76 0.31
77 0.32
78 0.35
79 0.38
80 0.42
81 0.39
82 0.31
83 0.31
84 0.32
85 0.35
86 0.37
87 0.38
88 0.36
89 0.4
90 0.4
91 0.39
92 0.36
93 0.34
94 0.33
95 0.31
96 0.29
97 0.26
98 0.3
99 0.3
100 0.3
101 0.27
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.28
106 0.27
107 0.28
108 0.29
109 0.29
110 0.24
111 0.22
112 0.19
113 0.15
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.11
118 0.11
119 0.16
120 0.18
121 0.19
122 0.2
123 0.21
124 0.19
125 0.2
126 0.23
127 0.19
128 0.22
129 0.25
130 0.25
131 0.24
132 0.26
133 0.24
134 0.22
135 0.2
136 0.16
137 0.14
138 0.22
139 0.23
140 0.22
141 0.28
142 0.32
143 0.36
144 0.37
145 0.38
146 0.32
147 0.32
148 0.3
149 0.24
150 0.21
151 0.18
152 0.16
153 0.14
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.11
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.22
165 0.28
166 0.37
167 0.4
168 0.44
169 0.52
170 0.58
171 0.58
172 0.54
173 0.49
174 0.41
175 0.36
176 0.29
177 0.22
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.11
182 0.09
183 0.07
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.19
205 0.23
206 0.22
207 0.23
208 0.22
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.16
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.12
243 0.12
244 0.16
245 0.26
246 0.28
247 0.33
248 0.36
249 0.44
250 0.49
251 0.59
252 0.64
253 0.64
254 0.69
255 0.7
256 0.74
257 0.68
258 0.7
259 0.64
260 0.61
261 0.56
262 0.48
263 0.41
264 0.35
265 0.35
266 0.24
267 0.2
268 0.15
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.18
280 0.21
281 0.22
282 0.21
283 0.21
284 0.25
285 0.27
286 0.25
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.2
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.11
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.08
300 0.15
301 0.19
302 0.21
303 0.25
304 0.33
305 0.38
306 0.42
307 0.48
308 0.51
309 0.58
310 0.66
311 0.73
312 0.72
313 0.75
314 0.73
315 0.67
316 0.59
317 0.54
318 0.47
319 0.4
320 0.34
321 0.31
322 0.32
323 0.32
324 0.34
325 0.3
326 0.31
327 0.35
328 0.4
329 0.42
330 0.49
331 0.59
332 0.62
333 0.7
334 0.76
335 0.79
336 0.82
337 0.84
338 0.8
339 0.8
340 0.83
341 0.79
342 0.78
343 0.76
344 0.77
345 0.78
346 0.8
347 0.75
348 0.72
349 0.78
350 0.78
351 0.77
352 0.72
353 0.7
354 0.65
355 0.65
356 0.64
357 0.59
358 0.54
359 0.55
360 0.59
361 0.58
362 0.65
363 0.69
364 0.71