Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6QP61

Protein Details
Accession W6QP61    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-448YENKGGPQGHKRNYANQKSRKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-448KSRKR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 9.5, cyto 5, pero 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MADADEDAVRAPATASTEPDIDLSDETQDFRFLNHLNFFADSSPSIPRRGEKDFEPNPTELQADVLSASRGAMHNALSYPRLHGAKTRIIAFYAPDGYVPPVQIDRATPKASGEDGKSSESTPKPARPLPNSARISPDACVYVPNPKGQFFKTMGQADSTSRIWLLPEEALYLIERGSLDIRWPSPSGSTEDLSVPMSLQAAYACFMGRGGLTLERYSVYTGLKRLGYALVRAPGWCDDIQQQDADALGSSEITPPKIHGPGLAGMLASLFNWIHDPHSTASTATGPIIGTGIHRSYMDVYRKLAIIPWYDPVTAPERHPFDTTPPFRVVFHIYKPSTPIKKSALPTPDFRIAVVSTRDQTTMPTMTQLGALLESTPLDPPRGEKMDRMMYMRLRHGYRNVVMAVVDQGVVSYLRIADSAFGKEKLYENKGGPQGHKRNYANQKSRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.17
3 0.19
4 0.19
5 0.2
6 0.2
7 0.19
8 0.16
9 0.16
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.16
14 0.16
15 0.17
16 0.15
17 0.15
18 0.19
19 0.17
20 0.22
21 0.24
22 0.25
23 0.24
24 0.25
25 0.25
26 0.22
27 0.22
28 0.17
29 0.16
30 0.22
31 0.22
32 0.24
33 0.26
34 0.29
35 0.33
36 0.38
37 0.4
38 0.38
39 0.46
40 0.49
41 0.55
42 0.54
43 0.5
44 0.45
45 0.43
46 0.39
47 0.28
48 0.24
49 0.16
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.21
68 0.21
69 0.2
70 0.24
71 0.28
72 0.34
73 0.36
74 0.37
75 0.32
76 0.32
77 0.32
78 0.28
79 0.26
80 0.21
81 0.17
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.15
92 0.17
93 0.21
94 0.23
95 0.21
96 0.21
97 0.23
98 0.24
99 0.25
100 0.22
101 0.22
102 0.22
103 0.24
104 0.24
105 0.23
106 0.28
107 0.26
108 0.3
109 0.31
110 0.33
111 0.37
112 0.42
113 0.48
114 0.46
115 0.55
116 0.54
117 0.59
118 0.58
119 0.53
120 0.53
121 0.47
122 0.44
123 0.34
124 0.3
125 0.21
126 0.18
127 0.18
128 0.14
129 0.2
130 0.2
131 0.24
132 0.24
133 0.25
134 0.28
135 0.27
136 0.32
137 0.28
138 0.3
139 0.32
140 0.34
141 0.31
142 0.3
143 0.3
144 0.26
145 0.26
146 0.22
147 0.16
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.17
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.13
182 0.1
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.13
226 0.15
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.11
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.18
285 0.23
286 0.22
287 0.23
288 0.24
289 0.25
290 0.24
291 0.24
292 0.21
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.2
297 0.2
298 0.2
299 0.19
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.24
304 0.26
305 0.27
306 0.29
307 0.28
308 0.3
309 0.38
310 0.39
311 0.37
312 0.36
313 0.35
314 0.34
315 0.35
316 0.36
317 0.29
318 0.31
319 0.36
320 0.35
321 0.35
322 0.39
323 0.45
324 0.45
325 0.43
326 0.43
327 0.4
328 0.46
329 0.47
330 0.5
331 0.5
332 0.46
333 0.48
334 0.49
335 0.5
336 0.43
337 0.41
338 0.36
339 0.28
340 0.3
341 0.29
342 0.25
343 0.21
344 0.22
345 0.23
346 0.2
347 0.21
348 0.21
349 0.2
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.16
355 0.15
356 0.11
357 0.09
358 0.09
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.11
367 0.14
368 0.22
369 0.27
370 0.27
371 0.28
372 0.34
373 0.41
374 0.43
375 0.44
376 0.42
377 0.42
378 0.45
379 0.49
380 0.48
381 0.43
382 0.45
383 0.46
384 0.48
385 0.45
386 0.44
387 0.39
388 0.33
389 0.3
390 0.26
391 0.22
392 0.16
393 0.14
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.11
406 0.17
407 0.19
408 0.2
409 0.21
410 0.23
411 0.29
412 0.35
413 0.38
414 0.39
415 0.38
416 0.46
417 0.52
418 0.55
419 0.55
420 0.58
421 0.62
422 0.64
423 0.71
424 0.66
425 0.69
426 0.75
427 0.8
428 0.8