Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H9I8

Protein Details
Accession C1H9I8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-144DSQLPKRVEKPQKPKDQPDVTHydrophilic
344-367TREQCSAKWKTMRLKKGRETSSPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
KEGG pbl:PAAG_07429  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSHLNPSSAGRILPGTAPGDSGAGLADNNNINNNSANNQPDVELPIPIDPRLQISVGSTQQPQESRLVDVNATEAIQPENFHRDRSPSGDTLLQDPEQDPVEEAAGQSLPKPQQTRQTASQAVDSQLPKRVEKPQKPKDQPDVTGRHSAAEIAAVEAFKTQFCEANSMSGEDFGRMVQHRETENGDFSSLGSNLTRSEFWDLLYALTPGRRPRDVQRYMRSHYVATSQKPRKWTKEQDDELVALHVEHGPNWAKIAEILGRARDDVNTRFRKRVQHRDTQTRGPWSSNECTRLESAVRQWLDIAQFPATAIYTTSDSKPGDIYRIDPRYILWTQVSDFMGNTRTREQCSAKWKTMRLKKGRETSSPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.07
13 0.1
14 0.11
15 0.12
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.19
22 0.21
23 0.23
24 0.21
25 0.21
26 0.21
27 0.2
28 0.24
29 0.22
30 0.18
31 0.17
32 0.19
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.15
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.14
41 0.15
42 0.21
43 0.22
44 0.25
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.27
49 0.27
50 0.25
51 0.24
52 0.24
53 0.25
54 0.25
55 0.21
56 0.2
57 0.19
58 0.15
59 0.15
60 0.12
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.2
67 0.2
68 0.22
69 0.23
70 0.26
71 0.28
72 0.33
73 0.35
74 0.28
75 0.3
76 0.31
77 0.3
78 0.29
79 0.29
80 0.24
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.16
85 0.15
86 0.13
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.12
96 0.13
97 0.18
98 0.21
99 0.23
100 0.32
101 0.38
102 0.43
103 0.43
104 0.49
105 0.48
106 0.46
107 0.47
108 0.4
109 0.35
110 0.34
111 0.3
112 0.24
113 0.27
114 0.28
115 0.25
116 0.27
117 0.36
118 0.41
119 0.5
120 0.59
121 0.62
122 0.71
123 0.77
124 0.81
125 0.81
126 0.76
127 0.71
128 0.69
129 0.65
130 0.57
131 0.56
132 0.49
133 0.4
134 0.34
135 0.29
136 0.21
137 0.15
138 0.12
139 0.06
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.14
151 0.13
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.09
159 0.09
160 0.06
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.09
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.16
169 0.15
170 0.17
171 0.15
172 0.14
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.09
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.13
196 0.16
197 0.17
198 0.19
199 0.27
200 0.37
201 0.45
202 0.51
203 0.57
204 0.6
205 0.61
206 0.64
207 0.57
208 0.47
209 0.39
210 0.38
211 0.33
212 0.31
213 0.39
214 0.41
215 0.42
216 0.5
217 0.55
218 0.56
219 0.61
220 0.67
221 0.66
222 0.7
223 0.7
224 0.65
225 0.61
226 0.54
227 0.45
228 0.35
229 0.25
230 0.14
231 0.11
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.1
241 0.11
242 0.13
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.16
251 0.18
252 0.2
253 0.29
254 0.37
255 0.4
256 0.44
257 0.48
258 0.57
259 0.62
260 0.68
261 0.66
262 0.67
263 0.73
264 0.78
265 0.8
266 0.78
267 0.74
268 0.71
269 0.65
270 0.57
271 0.51
272 0.46
273 0.47
274 0.44
275 0.43
276 0.36
277 0.36
278 0.35
279 0.35
280 0.3
281 0.27
282 0.26
283 0.3
284 0.29
285 0.27
286 0.26
287 0.26
288 0.26
289 0.25
290 0.23
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.13
296 0.11
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.19
303 0.19
304 0.2
305 0.23
306 0.22
307 0.24
308 0.23
309 0.25
310 0.3
311 0.34
312 0.34
313 0.31
314 0.31
315 0.33
316 0.33
317 0.33
318 0.25
319 0.22
320 0.23
321 0.28
322 0.28
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.24
327 0.23
328 0.25
329 0.27
330 0.3
331 0.33
332 0.4
333 0.43
334 0.45
335 0.54
336 0.59
337 0.6
338 0.64
339 0.68
340 0.71
341 0.76
342 0.79
343 0.79
344 0.81
345 0.82
346 0.85
347 0.85