Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1H940

Protein Details
Accession C1H940    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1021-1046LKWGYGMTSLRRKRKQRIFDHEVDGKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG pbl:PAAG_07281  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFSYVCDLFSNLEANLTLKVSTASIKRNPDLATIESWFSHYAKQIHDGKTDRLALLSCLFPERRPERVFGLKEPSLVKVIGRCLLLGVTKRQELDSYRTCGNGDLGNCVERVMKQAEDDIHEESGVTVEEIDNVLNQIASRCRFSGPDLRRQRTAANVDEALSPVFRRLTSREAKWFTRIILKDISPVTLPAPFVLRNFQFHLPDLLLVQDSFGAALDLLSCDPMRRFPPRPDPQYAKLLVSFAASHIPLTVGIKVGRPIFYKARGVKHCCKMAGKRTMSVERKYDGEYCQIHINLAKRPNCIQIFSKSGRDSTADRSGVHSTLKECLRIGKSGSKISRNCILEGELLVWSDVKSKLLPFHKLRKHVARSGSFIGAKNDSQPHPYEHLYIMFFDILLINDDVCLPKSYRERRVLLKEIVNPVKGRAVIVEQEYIDFSLPNTEEVLKAHFSRAISQCWEGLVLKGSEEPYFAIDQNEDPNIGHWIKLKKDYITGLGDTADFAIVGARYDAREATKLVEVKGLTWTSFFVGCREKNGRFFYNSEPVFRIVDVVSRNNMNIQLIRTLNQFGQFCSCVLDDEDLPLSIRSDQIQLPEPQVLFKTPFVVEMLGGGFKRRPGVNYFTLRFPRVLKIHNDRDVEDATTLEELQMLAKEASSVPTDELSQERVRWEEKLEAADGNPGYIMDALEQSSMSVASGVSPTEVYNQSPNEHRDPLSTIEQDILPELPHSTEIAPSTPTLSSPKPTEISIRQRGPKDASQKRFKRLRSQSPCITIRADNTHTMTNTSISNSQDDQMSRHLANLTNLSQSNTNQTNHRSSDSQSVIDLTTIPNSQVECMATPGQCTEVESQGSLEPGQQAPSQSCSQDQLPSKVNVGFKRRKLSAQASVSLDSIIRSTNLSLRPPAFLSETPILRGTGVSHNGIHLIFHSANQHLTSSFADFLDSPNALDATQIASDIAQIGNLLAAKQRVGTLPVQRGKILFLHWKAFFEHGLIENSKVKQFEGIREQWEKVGEKAFAGCLKWGYGMTSLRRKRKQRIFDHEVDGKAGENGPLGVVSSSPPPTDVDVQLSFYWREI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.16
5 0.14
6 0.14
7 0.12
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.16
12 0.2
13 0.26
14 0.33
15 0.4
16 0.42
17 0.46
18 0.46
19 0.46
20 0.45
21 0.4
22 0.37
23 0.32
24 0.32
25 0.27
26 0.28
27 0.25
28 0.22
29 0.23
30 0.25
31 0.26
32 0.27
33 0.35
34 0.41
35 0.43
36 0.5
37 0.51
38 0.48
39 0.51
40 0.52
41 0.44
42 0.37
43 0.34
44 0.28
45 0.27
46 0.24
47 0.18
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.31
52 0.33
53 0.39
54 0.4
55 0.43
56 0.44
57 0.53
58 0.55
59 0.51
60 0.56
61 0.48
62 0.49
63 0.48
64 0.43
65 0.35
66 0.32
67 0.28
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.19
74 0.21
75 0.23
76 0.23
77 0.26
78 0.27
79 0.29
80 0.31
81 0.31
82 0.33
83 0.33
84 0.38
85 0.38
86 0.37
87 0.36
88 0.36
89 0.36
90 0.33
91 0.31
92 0.27
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.22
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.16
101 0.2
102 0.18
103 0.17
104 0.17
105 0.21
106 0.23
107 0.26
108 0.27
109 0.25
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.16
114 0.14
115 0.11
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.09
128 0.14
129 0.16
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.23
134 0.28
135 0.35
136 0.35
137 0.44
138 0.51
139 0.55
140 0.57
141 0.58
142 0.56
143 0.54
144 0.54
145 0.48
146 0.43
147 0.39
148 0.37
149 0.35
150 0.33
151 0.25
152 0.2
153 0.15
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.14
158 0.17
159 0.25
160 0.33
161 0.38
162 0.46
163 0.5
164 0.53
165 0.54
166 0.53
167 0.46
168 0.48
169 0.43
170 0.37
171 0.37
172 0.34
173 0.35
174 0.33
175 0.33
176 0.24
177 0.23
178 0.2
179 0.17
180 0.17
181 0.13
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.21
186 0.21
187 0.23
188 0.27
189 0.3
190 0.29
191 0.29
192 0.31
193 0.25
194 0.24
195 0.2
196 0.17
197 0.14
198 0.11
199 0.1
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.13
215 0.17
216 0.24
217 0.3
218 0.37
219 0.48
220 0.57
221 0.63
222 0.68
223 0.7
224 0.67
225 0.7
226 0.63
227 0.54
228 0.45
229 0.39
230 0.3
231 0.24
232 0.2
233 0.12
234 0.13
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.15
246 0.16
247 0.18
248 0.19
249 0.23
250 0.26
251 0.3
252 0.36
253 0.39
254 0.46
255 0.52
256 0.58
257 0.63
258 0.65
259 0.66
260 0.62
261 0.63
262 0.62
263 0.63
264 0.65
265 0.58
266 0.55
267 0.56
268 0.62
269 0.61
270 0.58
271 0.52
272 0.44
273 0.43
274 0.41
275 0.38
276 0.3
277 0.31
278 0.28
279 0.26
280 0.29
281 0.27
282 0.25
283 0.25
284 0.26
285 0.25
286 0.32
287 0.33
288 0.31
289 0.33
290 0.41
291 0.39
292 0.39
293 0.37
294 0.34
295 0.38
296 0.38
297 0.42
298 0.35
299 0.34
300 0.32
301 0.31
302 0.29
303 0.28
304 0.33
305 0.29
306 0.28
307 0.3
308 0.31
309 0.3
310 0.28
311 0.24
312 0.17
313 0.21
314 0.22
315 0.2
316 0.18
317 0.23
318 0.24
319 0.25
320 0.27
321 0.28
322 0.3
323 0.36
324 0.41
325 0.42
326 0.42
327 0.44
328 0.48
329 0.43
330 0.4
331 0.34
332 0.31
333 0.24
334 0.22
335 0.2
336 0.12
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.07
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.18
347 0.22
348 0.3
349 0.33
350 0.43
351 0.48
352 0.55
353 0.61
354 0.64
355 0.66
356 0.63
357 0.65
358 0.58
359 0.56
360 0.52
361 0.49
362 0.41
363 0.37
364 0.33
365 0.28
366 0.25
367 0.24
368 0.25
369 0.22
370 0.22
371 0.23
372 0.24
373 0.25
374 0.26
375 0.24
376 0.21
377 0.22
378 0.2
379 0.19
380 0.16
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.08
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.07
395 0.12
396 0.21
397 0.28
398 0.36
399 0.42
400 0.45
401 0.51
402 0.58
403 0.59
404 0.55
405 0.53
406 0.49
407 0.5
408 0.49
409 0.44
410 0.37
411 0.31
412 0.29
413 0.24
414 0.2
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.13
419 0.14
420 0.11
421 0.11
422 0.12
423 0.11
424 0.09
425 0.07
426 0.06
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.12
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.12
439 0.12
440 0.18
441 0.2
442 0.21
443 0.21
444 0.21
445 0.21
446 0.19
447 0.2
448 0.13
449 0.11
450 0.11
451 0.08
452 0.08
453 0.09
454 0.1
455 0.09
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.11
465 0.11
466 0.09
467 0.08
468 0.08
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.14
473 0.17
474 0.19
475 0.24
476 0.26
477 0.23
478 0.25
479 0.25
480 0.24
481 0.23
482 0.21
483 0.16
484 0.15
485 0.14
486 0.11
487 0.1
488 0.06
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.09
503 0.12
504 0.13
505 0.13
506 0.15
507 0.14
508 0.14
509 0.16
510 0.15
511 0.12
512 0.11
513 0.11
514 0.09
515 0.11
516 0.1
517 0.09
518 0.14
519 0.14
520 0.19
521 0.23
522 0.24
523 0.29
524 0.33
525 0.33
526 0.3
527 0.33
528 0.32
529 0.36
530 0.34
531 0.3
532 0.27
533 0.26
534 0.24
535 0.22
536 0.18
537 0.1
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.1
547 0.1
548 0.09
549 0.12
550 0.12
551 0.13
552 0.13
553 0.14
554 0.14
555 0.16
556 0.16
557 0.12
558 0.15
559 0.14
560 0.13
561 0.14
562 0.13
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.07
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.09
578 0.11
579 0.14
580 0.15
581 0.16
582 0.18
583 0.17
584 0.15
585 0.15
586 0.14
587 0.12
588 0.12
589 0.13
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.09
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.1
603 0.1
604 0.12
605 0.15
606 0.21
607 0.27
608 0.33
609 0.34
610 0.37
611 0.39
612 0.38
613 0.36
614 0.32
615 0.31
616 0.27
617 0.3
618 0.31
619 0.37
620 0.44
621 0.49
622 0.48
623 0.43
624 0.43
625 0.4
626 0.34
627 0.25
628 0.18
629 0.12
630 0.11
631 0.1
632 0.07
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.06
638 0.05
639 0.05
640 0.06
641 0.06
642 0.07
643 0.08
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.12
651 0.13
652 0.13
653 0.14
654 0.15
655 0.16
656 0.16
657 0.17
658 0.17
659 0.17
660 0.18
661 0.18
662 0.16
663 0.15
664 0.18
665 0.16
666 0.12
667 0.1
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.04
673 0.05
674 0.05
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.04
681 0.04
682 0.03
683 0.04
684 0.04
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.09
690 0.1
691 0.11
692 0.14
693 0.15
694 0.17
695 0.22
696 0.26
697 0.26
698 0.28
699 0.27
700 0.25
701 0.27
702 0.29
703 0.29
704 0.26
705 0.22
706 0.2
707 0.2
708 0.18
709 0.16
710 0.12
711 0.08
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.07
718 0.09
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.1
723 0.12
724 0.11
725 0.11
726 0.14
727 0.15
728 0.17
729 0.19
730 0.22
731 0.22
732 0.23
733 0.27
734 0.31
735 0.4
736 0.45
737 0.49
738 0.51
739 0.52
740 0.56
741 0.55
742 0.53
743 0.54
744 0.55
745 0.58
746 0.63
747 0.67
748 0.72
749 0.74
750 0.73
751 0.73
752 0.74
753 0.76
754 0.75
755 0.77
756 0.74
757 0.75
758 0.72
759 0.64
760 0.57
761 0.47
762 0.41
763 0.39
764 0.35
765 0.3
766 0.3
767 0.31
768 0.28
769 0.28
770 0.24
771 0.2
772 0.18
773 0.17
774 0.18
775 0.16
776 0.18
777 0.18
778 0.18
779 0.2
780 0.2
781 0.19
782 0.19
783 0.22
784 0.19
785 0.2
786 0.21
787 0.2
788 0.21
789 0.23
790 0.21
791 0.22
792 0.22
793 0.22
794 0.22
795 0.21
796 0.26
797 0.26
798 0.27
799 0.27
800 0.31
801 0.36
802 0.36
803 0.39
804 0.33
805 0.31
806 0.39
807 0.37
808 0.33
809 0.27
810 0.26
811 0.23
812 0.21
813 0.19
814 0.11
815 0.11
816 0.11
817 0.11
818 0.11
819 0.11
820 0.11
821 0.12
822 0.12
823 0.1
824 0.13
825 0.16
826 0.15
827 0.15
828 0.15
829 0.15
830 0.14
831 0.16
832 0.15
833 0.15
834 0.16
835 0.16
836 0.16
837 0.15
838 0.16
839 0.14
840 0.12
841 0.12
842 0.12
843 0.14
844 0.14
845 0.15
846 0.16
847 0.2
848 0.21
849 0.2
850 0.2
851 0.21
852 0.22
853 0.27
854 0.3
855 0.31
856 0.33
857 0.34
858 0.35
859 0.36
860 0.4
861 0.39
862 0.45
863 0.49
864 0.5
865 0.57
866 0.57
867 0.57
868 0.6
869 0.6
870 0.6
871 0.57
872 0.56
873 0.51
874 0.5
875 0.45
876 0.38
877 0.3
878 0.21
879 0.16
880 0.11
881 0.09
882 0.08
883 0.09
884 0.15
885 0.19
886 0.21
887 0.25
888 0.26
889 0.28
890 0.28
891 0.29
892 0.27
893 0.24
894 0.28
895 0.28
896 0.28
897 0.27
898 0.28
899 0.26
900 0.22
901 0.21
902 0.18
903 0.19
904 0.22
905 0.22
906 0.21
907 0.21
908 0.22
909 0.22
910 0.18
911 0.12
912 0.15
913 0.13
914 0.15
915 0.17
916 0.17
917 0.19
918 0.2
919 0.2
920 0.14
921 0.16
922 0.16
923 0.15
924 0.15
925 0.14
926 0.14
927 0.13
928 0.15
929 0.17
930 0.16
931 0.14
932 0.14
933 0.14
934 0.13
935 0.12
936 0.11
937 0.09
938 0.09
939 0.09
940 0.08
941 0.07
942 0.08
943 0.09
944 0.08
945 0.06
946 0.05
947 0.05
948 0.07
949 0.07
950 0.07
951 0.09
952 0.1
953 0.1
954 0.11
955 0.13
956 0.13
957 0.16
958 0.21
959 0.26
960 0.35
961 0.4
962 0.42
963 0.41
964 0.4
965 0.39
966 0.36
967 0.33
968 0.33
969 0.32
970 0.37
971 0.36
972 0.38
973 0.37
974 0.37
975 0.33
976 0.25
977 0.24
978 0.21
979 0.24
980 0.24
981 0.25
982 0.29
983 0.3
984 0.32
985 0.29
986 0.27
987 0.29
988 0.31
989 0.36
990 0.39
991 0.42
992 0.46
993 0.5
994 0.51
995 0.46
996 0.48
997 0.42
998 0.36
999 0.36
1000 0.29
1001 0.26
1002 0.27
1003 0.28
1004 0.25
1005 0.24
1006 0.23
1007 0.19
1008 0.2
1009 0.2
1010 0.19
1011 0.17
1012 0.2
1013 0.24
1014 0.3
1015 0.4
1016 0.48
1017 0.57
1018 0.66
1019 0.73
1020 0.79
1021 0.83
1022 0.86
1023 0.86
1024 0.88
1025 0.87
1026 0.85
1027 0.85
1028 0.8
1029 0.71
1030 0.62
1031 0.51
1032 0.41
1033 0.33
1034 0.26
1035 0.19
1036 0.13
1037 0.12
1038 0.1
1039 0.1
1040 0.1
1041 0.08
1042 0.08
1043 0.09
1044 0.13
1045 0.15
1046 0.15
1047 0.16
1048 0.16
1049 0.21
1050 0.25
1051 0.26
1052 0.27
1053 0.26
1054 0.3
1055 0.3
1056 0.31