Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6PXH5

Protein Details
Accession W6PXH5    Localization Confidence High Confidence Score 24.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-91DPESEIVHPRDRKKRKQSQEPTDEPKVKKBasic
200-219LTTKEKKKLKERADRLNKKLBasic
323-350YIWNGEEKFKKHRPRRDKKPEDSDDENEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
73-78DRKKRK
204-214EKKKLKERADR
330-341KFKKHRPRRDKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSFPTDVAEFDSDPRISFSRPDNSFLLETKDGREFLFNTILKRWVESIDEKLIRQQQGYGPEDPESEIVHPRDRKKRKQSQEPTDEPKVKKPRVNTAVWVTNIPTDATFSEIHESFKKYGILAEELDTGKPRIVMYNDENGNFNGEALVVYFRPESVTLAIQLLDETDFRLGVPNPCGLMRVQEADFSYKREQEAEPKVLTTKEKKKLKERADRLNKKLSDWGDDEAELAAKARQAAEEARKHVVLKHMFTLEELEEDPLATIEIHEDITSECAKIGPVLKVMVWDGEADGVATVRFVSAADARRCAQSMDGRIFSKRTIVAYIWNGEEKFKKHRPRRDKKPEDSDDENERLERYGDWLESGGNKTSKNQETENEKADKDETDKSQETNNEKADKNEADKSLETGNEKVDLDETDKSQEIDKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.21
4 0.25
5 0.3
6 0.34
7 0.36
8 0.4
9 0.38
10 0.41
11 0.42
12 0.39
13 0.39
14 0.33
15 0.32
16 0.31
17 0.33
18 0.3
19 0.28
20 0.3
21 0.25
22 0.25
23 0.33
24 0.31
25 0.3
26 0.32
27 0.37
28 0.33
29 0.34
30 0.31
31 0.24
32 0.27
33 0.28
34 0.3
35 0.34
36 0.36
37 0.34
38 0.4
39 0.45
40 0.42
41 0.39
42 0.37
43 0.32
44 0.39
45 0.43
46 0.38
47 0.33
48 0.32
49 0.32
50 0.3
51 0.26
52 0.19
53 0.17
54 0.21
55 0.21
56 0.28
57 0.34
58 0.41
59 0.51
60 0.59
61 0.68
62 0.73
63 0.82
64 0.85
65 0.9
66 0.92
67 0.92
68 0.92
69 0.9
70 0.87
71 0.86
72 0.83
73 0.74
74 0.73
75 0.73
76 0.69
77 0.65
78 0.62
79 0.63
80 0.62
81 0.63
82 0.59
83 0.56
84 0.56
85 0.53
86 0.48
87 0.38
88 0.33
89 0.3
90 0.24
91 0.17
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.15
98 0.16
99 0.18
100 0.2
101 0.23
102 0.21
103 0.24
104 0.24
105 0.19
106 0.21
107 0.21
108 0.2
109 0.17
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.15
116 0.13
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.18
122 0.2
123 0.27
124 0.29
125 0.28
126 0.3
127 0.26
128 0.27
129 0.22
130 0.18
131 0.1
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.05
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.12
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.12
166 0.13
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.17
173 0.18
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.24
181 0.3
182 0.29
183 0.27
184 0.26
185 0.27
186 0.26
187 0.29
188 0.29
189 0.32
190 0.38
191 0.44
192 0.49
193 0.57
194 0.65
195 0.72
196 0.74
197 0.72
198 0.74
199 0.79
200 0.82
201 0.77
202 0.77
203 0.67
204 0.58
205 0.56
206 0.46
207 0.39
208 0.32
209 0.29
210 0.21
211 0.2
212 0.19
213 0.14
214 0.13
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.1
224 0.17
225 0.21
226 0.23
227 0.24
228 0.25
229 0.25
230 0.26
231 0.3
232 0.26
233 0.24
234 0.24
235 0.24
236 0.23
237 0.23
238 0.23
239 0.15
240 0.13
241 0.12
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.06
247 0.06
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.05
286 0.1
287 0.18
288 0.19
289 0.22
290 0.23
291 0.25
292 0.25
293 0.24
294 0.23
295 0.22
296 0.26
297 0.29
298 0.31
299 0.31
300 0.33
301 0.34
302 0.3
303 0.28
304 0.23
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.22
309 0.25
310 0.27
311 0.24
312 0.26
313 0.24
314 0.25
315 0.28
316 0.26
317 0.32
318 0.39
319 0.48
320 0.55
321 0.65
322 0.74
323 0.81
324 0.89
325 0.91
326 0.93
327 0.92
328 0.94
329 0.91
330 0.87
331 0.83
332 0.77
333 0.72
334 0.64
335 0.55
336 0.45
337 0.38
338 0.31
339 0.25
340 0.19
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.16
345 0.15
346 0.16
347 0.18
348 0.21
349 0.22
350 0.21
351 0.22
352 0.25
353 0.34
354 0.38
355 0.39
356 0.4
357 0.42
358 0.48
359 0.53
360 0.55
361 0.5
362 0.45
363 0.43
364 0.41
365 0.36
366 0.32
367 0.33
368 0.31
369 0.35
370 0.36
371 0.36
372 0.4
373 0.45
374 0.46
375 0.47
376 0.49
377 0.48
378 0.47
379 0.49
380 0.5
381 0.47
382 0.47
383 0.47
384 0.43
385 0.41
386 0.4
387 0.4
388 0.37
389 0.35
390 0.33
391 0.28
392 0.27
393 0.26
394 0.26
395 0.24
396 0.22
397 0.2
398 0.21
399 0.22
400 0.22
401 0.23
402 0.24
403 0.24